R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（下）

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本教程来自华东师范大学汤银才教授，本人已授权。为了获得更好的阅读体验，可在文末直达原文网站。前两期内容见：R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（中）；R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（上）

第 3 章 Bookdown 中的章节标题

我们在第3章讲述章节标题的设置、标签与引用.

3.1 章节标题

章节标题用遵从markdown的规则，用#设置，

• 一级标题用一个 #, 在 bookdown 中表示章, 相当于 TEX 中的\chapter{}
• 二级标题用二个 #, 在 bookdown 中表示节, 相当于 TEX 中的\section{}
• 三级标题用三个 #, 在 bookdown 中表示子节, 相当于 TEX 中的\subsection{}

还可以有更深的标题.

3.2 章节标题标签的设定与引用

章节标题标签可在标题后用 {#label}来设定，引用方式为\@ref(label). 例如

第\@ref(sections)章\@ref(sec3-2)节讨论标题标签的设定与引用.

显示为：

第3章3.2节讨论标题标签的设定与引用.

第 4 章 Bookdown中的公式与定理

这是第 4 章的内容, 讲述浮动对象定理与公式的标签与引用.

4.1 公式标签的设定

Rmarkdown中公式除了无标号的公式(用一对$$实现)，可以使用LaTeX中的equation环境, 尽管无法实现类似的 WYSIWYG, 但可设置标签. 标签格式为 (\#eq:label), 其中eq是关键字，例如

\begin{equation}
  f\left(k\right) = \binom{n}{k} p^k\left(1-p\right)^{n-k}
  (\#eq:binom)
\end{equation}

显示为

对于多行公式可以采用align环境，可对多个公式同时进行设置标签，不需要标签则用\notag，例如

\begin{align}
g(X_{n}) &= g(\theta)+g'({\tilde{\theta}})(X_{n}-\theta) \notag \\
\sqrt{n}[g(X_{n})-g(\theta)] &= g'\left({\tilde{\theta}}\right)
  \sqrt{n}[X_{n}-\theta ] (\#eq:align)
\end{align}

显示为 

4.2 定理标签的设定

这里我们先叙述几个定义和定理，并给出几个例子.

引理 4.1 A group having an infinite number of elements.

定理 4.1 (无限群) A group having an infinite number of elements.

证明: The proof comes here.

定义 4.1 A group having an infinite number of elements.

例 4.1 The set (Z,+) is an infinite group.

4.3 定理与公式的引用

例4.1, 定义4.1, 定理4.1为定理类引用.

公式的引用采用 \@ref(eq:label), 例如上面的二个公式可引用为：公式(4.1) 和公式 (4.2).

4.4 数学公式的扩展

有些公式无法用 TEX 中包的命令来实现，例如粗体数学符号，尽管在 TEX 中有个bm包在数学环境下通过\bm{\alpha} 来实现\boldsymbol{\alpha}的功能，但在html下需要给mathjax做个 TEX 宏(macro):

  TeX: {
    extensions: ["AMSmath.js","AMSsymbols.js","noErrors.js","noUndefined.js"]
    Macros: {
      bm: ["{\\boldsymbol #1}",1],
    },
  }

此时由$\bm{\alpha}$出来的效果为 α.

有关数据公式的标签与应用可参考mathjax 官方文档, Mathjax的本地化安装参考第B章介绍.

第 5 章 Bookdown中的图形

5.1 由R生成单个图形示例

这是第5章的内容， 讲述浮动对象图形的标签与引用.

图 5.1: iris数据集Petal.Length} ~ Species的箱线图.

5.2 由R生成两个图形并置示例

在R的代码块选项中设置out.width='50%', fig.show='hold'就可获得二个图形的并置.

图 5.2 iris数据集Petal.Length} ~ Species 的散点图. 右侧的图像中散点类型通过Species因子的水平给出，见图例. 直线为数据集拟合线性模型的结果.

5.3 由R生成两个图形堆叠示例

在R的代码块选项中设置out.width='90%', fig.show='hold'就可获得二个图形的并置.

5.4 静态图形示例

在Bookdwon中插入本地图形可使用命令(示例为Rlogo)

knitr::include_graphics("figures/Rlogo.png")

R logo

5.5 图形引用

图形引用通过R代码块的标签引用, 并带前缀fig:, 例如

图\@ref(fig:fig4-2)和图\@ref(fig:fig4-3)为两个图的并置与堆叠.

输出为：

图5.2和图5.3为两个图的并置与堆叠。

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