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开刊词 ||单细胞切病理

周运来 单细胞天地 2022-08-15

分享是一种态度

作者 |  周运来

一个长大了才会遇到的帅哥,

稳健,潇洒,大方,靠谱。

一段生信缘,一棵技能树。

生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,

单细胞行业的深度参与者,单细胞应用场景的积极探索者,单细胞产品落地的一站式提供者



望之,图谱又成新篇章;闻之,倾听细语达针意;问之,格物穷通在腠理;切之,脉脉相通一点通。欢迎来到《单细胞切病理·2022五一系列》。

单细胞技术如何走向临床应用?这是我们这一代单细胞人共有的上下求索之问。其实病理学和细胞学的发展一直是相互贯穿、彼此影响的。

在开始用海量单细胞技术来再一次审视病理学之前,我们需要简单回顾一下病理学的概念:

病理学是研究人体疾病发生的原因、发生机制、发展规律以及疾病过程中机体的形态结构、功能代谢变化和病变转归的一门基础医学科学。病理学一直被视为是基础医学与临床医学之间的“桥梁学科”,充分表明了它在医学中不可替代的重要作用,这是由病理学的性质和任务所决定的。

早在1858年,德国病理学家Rudolf Ludwig Karl Virchow,就出版了《细胞病理学》,提出“一切细胞来源于细胞” (Omnis cellula e cellula) 的著名论断,表达出:细胞只能来源于细胞。作为生命体的基本单元,细胞,自然也是疾病病理的基本单元。

国内细胞病理学教材是中国协和医科大学出版社出版的《细胞病理学》,从本书丰富多彩的插图中我们可以体会到:

  • 现阶段的细胞病理学主要基于显微技术
  • 现阶段的临床细胞学检查程序:采集->制片->固定->染色->封片->阅片->贴标签->诊断报告->归档。

基于显微镜技术的细胞病理学,主要依赖显微技术的发展、细胞理论的发展、取材固定染色技术的发展。在临床上主要有三大部分:

  • 妇科细胞学(脱落细胞学)
  • 非妇科细胞学(脱落细胞学)
  • 细针吸取细胞学

细胞病理学是一门正在发展并已经在临床诊断广泛应用的学科,细胞病理学最重要的应用是肿瘤诊断,即通过对痰、尿、胸腹水、宫颈涂片及针吸等细胞学标本的检查判断其中有无肿瘤细胞,如果细胞形态典型,还可判断肿瘤细胞的类型。

在海量单细胞视角下,病理学,特别是细胞病理学将会有哪些新的变化呢?

  • 拓展病理学研究的组织类型
  • 多组学层面的细胞图谱
  • 细胞类型的增加
  • 数据驱动的,数据分析结合人工阅片
  • 更加关注机理与分子表征(Pathway)
  • 分析方法的的变化,定义新的诊断指标
  • 空间组学对以切片技术为主的研究手段的拓展

切,是望闻问切的切;单细胞是海量单细胞测序技术。细胞病理学是不断发展的一门学科,每一次取样和检测技术的出现,都为我们再一次描绘关于自身的图谱。显微镜技术让我们观察细胞形态和结构,单细胞测序让我们在通量和精度上进一步打开单细胞的内部世界。如果说细胞的形态和结构是细胞的表型,那么,单细胞测序技术可以回答:产生某个表型的原因是什么?

单细胞切病理这个话题主要是想通过海量单细胞技术再次学习细胞病理学,也许会有一些拿着锤子看什么都是钉子的嫌疑,但又也许,能看出一些不一样的风景呢?

# 主要参考资料
病理学,步宏 李一雷主编,人民卫生出版社,2018
细胞病理学,刘树范 阚秀 主编,中国协和医科大学出版社,2011
医学免疫学,周光炎 主编,科学出版社,2019
Computational-method-for-single-cell-data-analysis,2019
协和听课笔记(病理学),阚晨 管慧主编,中国协和医科大学出版社,2020
协和听课笔记(诊断学),童璐莎 祝喻甲主编,中国协和医科大学出版社,2020
协和听课笔记(生物化学喻分子生物学),李晗歌 吴春虎主编,中国协和医科大学出版社,2020
协和听课笔记(医学免疫学),朱晨雨 杨寒主编,中国协和医科大学出版社,2020

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