两天一夜教您用R语言挖掘TCGA、GEO等公共数据库发表文章（结合生信热点）9月24-25

本班特色

现场完成一篇文章的流程以及所有图表，

至少2个套路的全程实战，让你快速掌握数据挖掘套路

全程实战，全程讲解代码，全部是自己的文章无限回放，

赠送同步视频 建群完善更好的售后服务

①

课程背景

没有经费做课题，没有实验造图形？其实，聪明人必须学着绕过去，我们不需要经费，完全不需要实验。用R语言挖掘公共数据，发表SCI文章R语言是科研工作者必备技能。本次会议以一篇SCI全文复现为目的，不瞎学R，用R解决科学问题，用R去发现新的临床问题。

②

授课老师

猴哥：武汉大学博士，副主任医师，讲师，发表SCI论文25篇，历任3家公司数据分析师，100篇meta分析数据分析经验，43场公益讲座授课基础，5年免费答疑的耐心和责任心。主持国家自然科学基金1项，主持省级课题3项、湖北陈孝平科技发展基金会肝胆胰恶性肿瘤研究基金1项、国家级大学生创新创业训练计划项目3项。 

根据自己的专业，找到课题、挖掘机制、锁定标记物

基金中呈现漂亮的图表和前期基础

掌握R语言处理GEO，TCGA数据的所有核心技能

科研绘图的所有技能

③

学习目标

全程实战，全程讲解代码，全部是自己的文章，重点讲解关键步骤，更多的售后服务，更好的掌握所有技能。最大胆、最全面、最深入人心地直达灵魂地讲解。至少2个套路的全程实战，让你快速掌握数据挖掘套路。现场完成一篇文章的流程以及所有图表。

④

课程安排

日期	主题	主要培训内容
第一天上午	R语言实战入门 R安装 Rstudio安装 3小时掌握R语言	菜鸟如何学习R 语言 R语言数据构成和流程控制 如何用好for循环和apply家族函数 如何转换为可以直接套用代码的数据（数据调整） 文章中的数据清洗和整理 R语言统计和作图简介 R语言无障碍安装和调用 R语言导入和导出
第一天下午	R语言模块化技能	GEO数据库从下载、整理、分析、出图、涵义（清除无意义的数据，发表级的热图，最漂亮的火山图，GO分析，KEGG分析，共表达网络）、GEO数据便捷实用的GSEA分析，GEO芯片的探针的注释
第一天晚	全代码实战芯片meta分析核心部分 11分的文章实例解析生信联合实验套路 Sun M. Integrated analysis identifies microRNA-195 as a suppressor of Hippo-YAP pathway in colorectal cancer. Journal of Hematology & Oncology. 2017. 10(1):79 (IF=11.059, PMID: 28356122)	芯片数据的检索、下载、预处理 多个GEO芯片联合分析（芯片meta）简介和制作 GEO芯片的探针转化为基因名的N种方法 R语言数据框的调整（掌握tidyr和dplyr） GE）芯片的差异分析、GO、KEGG、GSEA等 学员练习 （线上指导、配给视频练习）
第二天上午	全代码复现生存相关signature文章核心部分 （A prognostic 4-gene expression signature for patients with HER2-negative breast cancer receiving taxane and anthracycline-based chemotherapy，Oncotarget, 2017）	GEO数据下载 TCGA数据下载 生存相关signature的筛选和降维(lasso模型和rubust模型等) 批量生存分析 单因素生存分析 多因素生存分析 全代码制图 全代码制表 发表级图表的排版
第二天下午	TCGA ceRNA文章发表和制作 Sun M. a comprehensive study based on weighted gene co-expression network analysis and competing endogenous RNA network. Breast Cancer Res Treat. (IF 3.626, PMID: 30715658)	TCGA数据下载和数据库找课题 提取mRNA、IncRNA、MiRNA矩阵 ceRNA网络构建 批量生存分析、单因素、多因素、制表、制图 批量GO、KEGG 实战讲解例文

会务时间

（1）9月24-25日

（2）授课方式腾讯线上

（3）上午：8:30-11:30；下午：14:00-17:00

会务费用

（1）单独参加费用：3200元/人 ；两班连报（和其他班一起报名）6000元/人。

（2）发票名目：可开会务费、会议费、注册费、检测费、统计分析服务费等发票。

微信或支付宝扫描二维码支付，通过信用卡/公务卡扣

报名方式

邮箱报名：您编辑您的姓名、手机号码、参加班级发送到

[e-mail]