开源NGS可视化方案

本文转载自公众号“生信开发者”，已获授权，以下为全文。

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我们总在抱怨在线的基因组浏览器不能方便的展示自己的数据，IGV性能不够好，不足以展示自己对NGS数据可视化需求。本人在github上收录了一些开源的解决方案，也许他们中总有一款能满足您的需求的。

1、https://github.com/ryanlayer/samplot

2、https://github.com/Zhong-Lab-UCS ... isualization-Engine

3、https://github.com/matted/genome_coverage_plotter

4、https://github.com/epam/NGB

5、https://github.com/yhwu/bamrdplot

6、https://github.com/statgen/locuszoom

7、https://github.com/RCollins13/CNView

8、https://github.com/cc2qe/cnvgram

8、另外几个R语言的几个工具 也很不错如ggbio，GenomeGraphs，Gviz等，

以下是Gviz的几个示意图，

SequenceTrack

AlignmentTrack

SplicingTrack

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