生物信息培训班（长春站）开课通知

随着新一代测序继续的发展，生物信息在生物学研究中发挥了越来越重要的作用，成为生物学研究中不可或缺的工具，在科学研究，农业育种，临床医学中发挥了越来越重要的作用。随着测序行业的快速发展，数据累积越来越快，掌握生物信息技能将在生物学研究中发挥巨大的优势。
金秋九月，是东北最好的季节，在这次培训中，通过5天的系统培训，您将掌握测序原理及其在科研中的应用，熟练掌握Linux操作，常用生物软件的使用，并能自行进行完成，序列拼接，基因预测功能注释，转录组数据分析，外显子数据分析以及利用R语言进行科学文献绘图。培训之后，通过继续使用服务器，巩固生物信息分析技能，助您尽快发表SCI。

课程特色：

1、课程包含Linux，常用生物信息软件，R语言，WES分析，RNAseq分析等内容。
2、以实践操作为主，会进行大量生物信息分析案例操作；
3、赠送9套500多集生物信息视频教程；
4、半年生物云服务器（32线程，256G，24T）使用权限，可分析自己数据；
5、课程内容讲义一份；
6、QQ交流群，可进行后续答疑；

主讲老师：

王通：曾任职于华大基因，8年以上生物信息分析经，擅长基因组，转录组，宏基因组，肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业，主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者，已制作视频500集以上。首创视频＋云服务器培训模式，目前已完成线下培训30多场，累计学员超过4000多名。公众号“基因学苑”运行者。

报名须知：

时间：2018-9-17 ~ 9-21, 共 5 天，每天 8:30 ~ 17:00

地点：吉林省长春市 （具体地点后续通知）

报名电话：[phone]

注意事项：

1、请自备笔记本电脑，windows与mac系统均可。
2、培训（会议）通知，发票，合同，开票信息请联系工作人员。

培训费用：

5000元，食宿自理。
付款方式：银行对公转账
户      名：青岛同源基因科技有限责任公司
开户银行：中国建设银行青岛高新区支行
账户：37101006101052502221
其他方式请联系工作人员

联系方式：

电话：[phone]

微信

课程安排

日期	主题	课程安排
第一天 （上午）	Linux基本操作	生物信息学简介 mobaxterm使用 服务器上传下载数据 Linux基本命令 目录结构 文件操作 vim文件编辑 进程管理 文件查找find
第一天 （下午）	Linux基本操作	文本筛选grep 管道 高级命令sed 高级命令awk 生物软件下载 编译安装软件 bioconda安装软件 参考基因组下载 批量下载序列 生物数据库下载 Aspera高速下载
第二天 （上午）	测序原理及数据质控	测序原理 数据质控 fastqc 数据过滤 fastp 序列拼接 基因预测
第二天 （下午）	常见基因组分析	ncRNA分析 重复序列分析 基因功能注释和功能分类 全局比对 局部比对 多序列比对 利用mega构建系统发育树
第三天 （上午）	重测序基础	重测序简介 变异检测基本原理 GWAS、WGS、WES、RAD、GBS、BSA Tablet演示 bwa比对 sam格式介绍 sam文件处理samtools 利用bcftools找SNP 利用freebayes找SNP
第三天 （下午）	基因组变异检测	利用gatk找SNP 利用mutects找somaic突变 利用lumpy找SV 利用delly找SV 变异结果注释snpeff 利用igv查看变异结果
第四天 （上午）	R语言基础	R语言简介 R语言安装 Rstuido介绍 基本命令 安装R包 获取帮助 读写文件 R数据类型 案例1：绘制人染色体长度分布图 案例2：绘制基因表达热图 案例3：利用R实现vlookup提取数据
第四天 （下午）	R语言统计分析	案例4：频数统计与独立性检验 案例5:t检验与wilcox检验 案例6:相关性检验 案例7:线性回归 案例8:基因组大小与基因个数线性回归 案例9：购物篮分析 案例10: R语言与机器学习案例——乳腺癌预测
第五天 （上午）	R语言与生物信息	Bioconductor简介 利用R语言分析RNAseq数据
第五天 （下午）	R语言绘图	案例1：分组条形图 案例2：基因长度分布直方图 案例3：饼图及扇形图 案例4：箱线图 案例5：韦恩图 案例6：gwas分析曼哈顿图 案例7：差异表达基因火山图 案例8：GC-depth图 案例9：COG功能注释图 案例10：GO功能注释条形图 案例11：KEGG富集点图

*具体课程会根据现场情况适当调整

参加培训班，赠送生物云计算资源以及视频课程