查看原文
其他

未来,我需要这样一款基因搜索引擎

基因学苑 基因学苑 2023-08-18

随着测序数据的爆炸式增长,越来越多的物种基因组被测序输出,目前需要数据解决存储和计算的问题。不过随着越来越多计算机硬件厂商的加入以及云计算的发展,数据存储和计算问题稍微缓解。基因数据解读成为目前最为严峻的考验,如何才能读懂基因组这部“天书”。今天,我们就回到未来,设计一款未来的的基因搜索引擎。


1、首先,它需要支持中文,虽然我英文很好,但是毕竟生物医学相关专业术语太多。


2、不接受竞价排名,比如将一些与搜索内容不相关基因排到前面。

3、不接受广告赞助,很多基因会与固定表型和疾病相关,不能在相关基因页面中展示相关产品,比如黑色素表达高的基因中推荐美白护肤产品。


4、支持基因序列,基因ID,rsID,表型信息等搜索,比如输入乳糖,返回MCM6相关基因信息。



5、能够根据输入基因型信息,关联表型相关信息,并进行解读,例如与酒精代谢相关基因示意图。


6、给出基因型频率分布,看看自己是否是沉默的大多数,例如与乙型肝炎相关基因STAT4上的rs7574865突变位点在人群中的分布比例。

7、给出参考资料,例如该基因相关文献信息。



8、提供基因社交功能,将与我基因型相似的人进行关联。


---------- END ----------

(更多精彩内容,欢迎关注公众号)



您可能还会感兴趣的

基因学苑2018年文章目录
生物信息零基础班(北京站)开课啦
云服务器半价了
手把手教你生信分析平台搭建专栏合集
生物信息重要资源站点合集
不会编程,如何进行批量操作
一个人全基因组完整数据分析脚本
一个细菌基因组完整分析脚本
2019,送给大家一份新年礼物
生物学才是终极学科


您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存