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生物信息零基础班(上海站)开课啦

王通 基因学苑 2023-08-18

2019年我们的第三期培训班来到国际化大都市上海了。本次培训班,通过5天的系统学习,带您入门生物信息行业,通过五天大量的练习,让您熟练掌握Linux操作,测序原理,常用生物软件的使用,并能独立完成基因组,重测序,外显子分析等内容。让您对生物信息有一个全面的了解。培训之后,通过观看视频课程,继续使用服务器练习,巩固生物信息分析技能,让您今年彻底学会生物信息,助您尽快发表SCI。

课程特色:

1、五天时间,包含丰富学习内容;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始。
3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能,五天完成1万行代码。
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习。
5、赠送一年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可分析自己数据;
6、赠送100页以上纸质版讲义一份;
7、参加线下培训班学员默认为我们VIP会员,享有我们提供的VIP服务;

主讲老师:

王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。首创视频+云服务器培训模式,目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过4000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程150多篇。

课程安排:(根据现场情况适当调整进度)

日期

主题

课程安排

1

生物信息学简介及Linux操作

生物信息学简介

Linux操作

xshell使用

传输文件

选项参数

目录结构

权限管理

编写脚本

进程管理

生物软件下载与安装

软件搜索下载

自行编译

bioconda管理生物软件

PATH变量

生物数据下载

参考序列下载

数据库下载

SRA数据下载

sratoolkit工具

edirect工具

2

(上午)

测序原理

测序原理

一代测序

二代测序

三代测序

fastq文件格式 

质量值体系

2

(下午)

数据质控过滤

数据质控原理

利用fastqc进行数据质控

数据过滤原理

数据过滤操作

RNAseq数据过滤

宏基因组数据过滤

3

(上午)

基因组拼接

查找基因组大小

如何制定测序策略 

kmer估计基因组大小

基因组拼接原理

二代测序基因组拼接

三代测序基因组拼接

混合拼接

基因组统计

拼接结果评估

如何改善拼接效果


 3

(下午)

基因组分析

基因预测

ncRNA分析

重复序列分析

基因功能注释

基因家族分析

练习:鉴定一个未知物种

4

(上午)

比较基因组分析

参考序列下载

全局比对

局部比对

多序列比对

构建系统发育树

利用iTol美化系统发育树

4

(下午)

重测序基础

重测序基础

简化基因组

QTL分析原理

非人基因组重测序 

参考序列屏蔽重复

bwa比对

bam详解

5

(上午)

非人物种变异检测

samtools工具

利用freebays筛选SNP

vcf格式详解

bcftools工具

SNP分型

SNPeff注释工具

5

(下午)

人全基因组分析

外显子测序

Panel测序

利用GATK进行变异检测

SV检测

CNV检测

利用IGV可视化变异结果

Annovar工具

利用clinvar数据库筛选致病突变

报名须知:

时间:2019年3月27~3月31日(五天)每天早上8:30~17:00

上课地址:如家商旅酒店大连路地铁站店) 上海市虹口区霍山路300号

请自带电脑(windows与mac系统均可),提供午餐。


付款方式:

培训费用:5000元
付款方式:银行对公转账
户      名:青岛同源基因科技有限责任公司
开户银行:中国建设银行青岛高新区支行
账户:37101006101052502221
可以现场刷卡或扫码支付等,会议通知等请联系工作人员。

报名方式:

添加老师个人微信,拉进培训交流群,填写报名回执单。

电话:156 4253 9895

优惠政策:

1、前五名报名享9折优惠(以付款顺序为主);

2、老学员推荐,享九折优惠;


常见问题:

1、零基础是否可以学会?

完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员。


2、上完课就能够自己做分析了吗?

可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。


3、赠送的服务器账号是做什么的?

生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。


4、可以开发票吗?

可以,包括培训通知等,方便用户报销。


5、需要做哪些准备?

课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。


6、培训完后面有不会的问题怎么办?

生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。

*关于培训班详细课表,带章会议通知等,请微信公众号后台回复“上海。关于我的授课风格,可以点击阅读原文订阅免费生物信息视频课程。


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