生信平台搭建（十五）：Aspera

这次内容我们来介绍一款快速下载的工具aspera，Asprea是一款非常神奇的工具，它可以极大的提高数据传输的效率，不过aspera不能使用root账户来使用，因此，我们切换到普通用户来使用。

软件安装

软件官网：http://asperasoft.com/
登录Asprea官网，找到下载页面。这里面提供了很多工具。注意千万不要选择错了。我们选择下载客户端产品，这里选择aspera connect，这个是浏览器的插件，找到Linux版本下载地址，这个地址不容易显示出来，可能是网速问题。

wget -c https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.8.1/ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz
tar -zxvf  ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz
sh aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh

使用aspera

软件默认安装到home目录下，在一个隐藏的点.aspera 目录下。这个是浏览器调用的目录，Linux的图形化界面下可以直接使用浏览器调用，这里我们使用命令行操作。
其中我们需要使用的ascp命令在bin目录下，我们可以将其连接或者复制到在PATH的软件目录中，而在etc目录下有一个密钥文件asperaweb_id_dsa.openssh。

[wangtong@VM_0_11_centos ~]$ tree -L 2 .aspera/
.aspera/
`-- connect
    |-- bin
    |-- etc
    |-- lib
    |-- locales
    |-- notices.txt
    |-- plugins
    |-- product-info.mf
    |-- res
    `-- var

8 directories, 2 files

下面我们介绍一下ascp命令的使用。选项参数很多，这里我们只介绍几个常用的。
-i string输入私钥，安装 aspera 后有在目录 ~/.aspera/connect/etc/ 下有几个私钥，使用 linux 服务器的时候一般使用 asperaweb_id_dsa.openssh 文件作为私钥。
-l string设置最大传输速度，比如设置为 200M 则表示最大传输速度为 200m/s。若不设置该参数，则一般可达到10m/s的速度，而设置了，传输速度可以更高。
-T    不进行加密。若不添加此参数，可能会下载不了。
--host=stringftp的host名，NCBI的为ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov；EBI的为fasp.sra.ebi.ac.uk
--user=string用户名，NCBI的为anonftp，EBI的为era-fasp
--mode=string选择模式，上传为 send，下载为 recv

下载数据

这里面我们尝试下载ncbi三个数据库，注意，购买的腾讯云默认只有50g容量，是没法下载完nt库和nr库的，那个只是用来练习的。

# nt库下载
.aspera/connect/bin/ascp -i .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --overwrite=diff -QTr -l6000m [e-mail]:blast/db/FASTA/nt.gz ./
# nr库下载
.aspera/connect/bin/ascp -i .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --overwrite=diff -QTr -l6000m [e-mail]:blast/db/FASTA/nr.gz ./
# swissprot库下载
.aspera/connect/bin/ascp -i .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --overwrite=diff -QTr -l6000m [e-mail]:blast/db/swissprot.tar.gz ./

注意事项

首先，需要正确给出aspera-license，在-i后面接license文件，这里是asperaweb_id_dsa.openssh
第二，ftp账号要写正确，ncbi是[e-mail]
第三，ftp地址后面接冒号，然后是ftp上面文件的具体位置，不要写错了。
另外大家要知道的是，不是所有的网站都支持Aspera下载的。需要服务提供方购买Aspera服务，用户才可以使用。

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