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生物信息暑期班(北京站)开始报名

王通 基因学苑 2023-08-18

2019年我们的生物信息培训班第四次来到北京。错过前两期培训的,不能在错过这次了,学习要趁早。本次培训依然采用五天教学,通过5天的系统学习,带您入门生物信息行业,让您熟练掌握Linux操作,测序原理,常用生物软件的使用,并能独立完成基因组,重测序,外显子分析等内容。让您对生物信息有一个全面的了解。培训之后,通过观看视频课程,继续使用服务器练习,巩固生物信息分析技能,让您今年彻底学会生物信息,助您尽快发表SCI。

课程特色:

1、真正的小班授课,让每一位学员都执行出结果;
2、科学设计课程,循序渐进,课程包含Linux,测序原理,基因组分析,三代数据分析,重测序分析,外显子等,适合零基础开始;
3、以完整项目为案例,通过亲自上手操作,快速掌握技能;
4、赠送32G优盘,含有大量生物信息学习资料,可继续巩固学习;
5、赠送半年生物云服务器(32线程,256G,24T)使用权限,可继续巩固学习,也可以分析自己数据;
6、培训结束之后,可继续微信群答疑交流。

主讲老师:

王通:曾任职于华大基因,9年以上生物信息分析经验,擅长基因组,转录组,宏基因组,肿瘤基因组等数据分析。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业,主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者,已制作视频500集以上。目前已在北京,深圳,哈尔滨,杭州,武汉,南京,长春,上海,广州,青岛等组织过多场培训班,线上线下累计学员超过6000多名。公众号“基因学苑”作者,已写作生物信息教程180多篇。

课程安排:(根据现场情况适当调整进度)

日期

主题

课程安排

1

(上午)

生物信息学简介及Linux操作

生物信息学简介

登录服务器

传输文件

常用Linux命令

选项参数

目录结构

权限管理

1

(下午)

生物软件安装

vim编写脚本

sh执行脚本

生物软件下载与安装

bioconda管理生物软件

PATH变量设置

2

(上午)

生物数据下载

参考序列下载

数据库下载

SRA数据下载

批量下载数据

GTF文件下载

2

(下午)

测序原理及数据质控

测序原理

一代测序

二代测序

三代测序

fastq文件格式 

fastqc数据质控

数据过滤

进程管理

3

(上午)

基因组拼接

kmer估计基因组大小

基因组拼接原理

二代测序基因组拼接

基因组统计

QUAST评估组装质量

如何改善拼接效果

批量操作

3

(下午)

三代测序数据处理

nanopore数据质控过滤

Nanopolish进行组装错误校正

canu拼接nanopore数据

pacbio测序数据拼接

minimap2 比对参考序列

tablet可视化比对结果


 4

(上午)

基因组分析

基因预测

ncRNA分析

重复序列分析

基因功能注释

基因家族分析

4

(下午)

比较基因组分析

nt库比对鉴定物种

nr库比对基因功能注释

多序列比对

构建系统发育树

利用iTol美化系统发育树

5

(上午)

基因组变异检测

变异检测原理

bwa比对

bam文件格式

samtools工具处理sam/bam格式

5

(下午)

基因组变异检测

利用freebays筛选SNP

bcftools工具处理vcf/bcf文件

利用IGV可视化比对结果

SNPeff注释工具

annovar工具

报名须知:

时间:2019年7月27 ~ 7月31日(五天)每天早上8:30~17:30

上课地址:北京市海淀区辰茂鸿翔酒店(地铁10号线牡丹园地铁站附近)

请自带电脑(windows与mac系统均可),提供午餐。



付款方式:

培训费用:4900元
付款方式:银行对公转账
户      名:青岛同源基因科技有限责任公司
开户银行:中国建设银行青岛高新区支行
账户:37101006101052502221
可以现场刷卡或扫码支付等,会议通知等请联系工作人员。

报名方式:

添加老师个人微信,拉进培训交流群,填写报名回执单。

电话:156 4253 9895

常见问题:

1、零基础是否可以学会?

完全没有问题,我们本次培训班就是针对零基础学员,或者刚刚接触生物信息的学员,不要害怕自己是零基础,如果不学习,永远都是零基础。


2、上完课就能够自己做分析了吗?

可以,我们课上会演示大量操作案例,将脚本以及案例数据放到服务器上,只需要替换为自己数据即可完成分析。


3、赠送的服务器账号是做什么的?

生物信息分析需要大量的计算资源以及部署软件数据库,赠送的服务器在大家学习完成之后,可以使用该计算资源进行自己的数据分析,而无需继续购买计算资源和花费大量时间部署软件和数据库。


4、可以开发票吗?

可以,包括培训通知等,方便用户报销。


5、需要做哪些准备?

课程开始之前会发送在线视频和讲义,让用户预习Linux操作。


6、培训完后面有不会的问题怎么办?

生物信息学习是一样长期的任务,培训班结束了,学习并没有,我们有培训交流群,后续可以在群内继续交流学习。




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