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概述

Xenium是一个由10x Genomics提供的端对端完整解决方案,帮助用户实现亚细胞分辨率的靶向基因和蛋白表达原位分 析。该平台包括Xenium分析仪、试剂耗材和分析软件;Xenium分析系统是一台高度自动化、高通量的组织原位分析技术平 台。此外,从组织制备到数据分析,该平台将会得到10x Genomics技术专家团队的全方位支持。它在10x Genomics早期收 购的ReadCoor和Cartana的基础技术之上做了大量研发和改进。Xenium分析仪将单分子RNA和蛋白检测的功能与强大的 光学元件、数据采集和解码技术相结合,能够以亚细胞分辨率在整张切片上快速检测大量靶点的组织原位表达水平。该平台 可以兼容多种样品类型,包括新鲜冷冻(FF)组织和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。与10x Genomics的其他产品一 样,Xenium平台将拥有一条不断拓展的产品路线图,不断增强核心平台的分析能力和分析物种类,比如一张切片同时检测 RNA和蛋白质表达水平。

工作流程概览

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图1. Xenium的工作流程。首先在Xenium载玻片上制备FF或FFPE组织切片(每块载玻片上的可成像区域为12mm x 24mm)。然后对切片进行 处理,RNA能更好的与可环化的DNA探针进行杂交。杂交探针连接后产生可酶促扩增的环状DNA探针。之后将载玻片放入Xenium分析仪 中,样本在其中经过连续几轮的荧光探针杂交、成像和去除,产生明亮、易于成像且高信噪比的信号。接着生成每个基因特异性的荧光 特征条码,实现目标基因的定位和识别。最后构建出整张组织切片上转录本的空间图谱。

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