谁会是下一个Illumina？这可能是目前最全的国内第三代测序企业盘点
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有人说NGS成就了illumina，成就了华大，在如今基因测序如火如荼的时代，NGS依旧是人们追求的热点。但在NGS以外，以Helicos公司的Heliscope、Pacific Biosciences公司的SMRT技术和Oxford Nanopore的纳米孔测序技术为代表的第三代基因测序已经走向前台。
而在国内，围绕第三代测序技术，或研发、或引进、或合作，设备开发、测序服务等公司各显神通，他们之中谁会成为下一个Illumina？谁会成为下一个华大？我们不得而知。
（以下盘点国内从事第三代测序服务的企业，内容来自各企业官网，以及网上公开报道，本站不承担任何责任，如有遗漏和错误，欢迎指正。）
Helicos公司
Heliscope单分子测序仪
作为单分子测序技术的开山之作，由斯蒂芬·奎克（Stephen Quake）教授创办的Helicos公司在2008年推出的Heliscope单分子测序仪曾被人寄予厚望，但由于售价太高，使得Helicos公司生意不尽如意，陷入缺乏资金的困境，最终在2012年底因为没有融资渠道不得不破产。2013年美国破产法院批准Helicos的请求将知识产权售予Illumina, Life Tech, Fluidigm, Complete Genomics，Helicos公司便从此从人们的视野中消失。
1
Helicos公司的继任者--瀚海基因
Helicos公司破产后其单分子测序技术并没有消失，2012年，在奎克实验室完成博士后工作的贺建奎教授回国创立了深圳市瀚海基因生物科技有限公司，继续开展单分子基因测序技术的研发工作，而Helicos的创始人斯蒂芬·奎克教授正是瀚海基因的首席科学顾问。
在继承并发展了Helicos公司技术的基础上，2015年瀚海基因对外公布其单分子基因测序仪“GenoCare”的原理样机，2017年8月GenoCare正式投产。据报道GenoCare的首笔订单达到700台。目前该测序仪已在科研市场应用，但投入临床市场所需的批文还在申报中。
GenoCare测序仪
据参与GenoCare检测的中国科学院北京基因组研究所原副所长于军表示，“我们运用GenoCare对大肠杆菌测序的数据结果显示，Genocare与测序行业龙头Illumina生产的MiSeq二代基因测序仪的一致性达到了99.7%。”
据了解，瀚海基因从2015年获得第一笔大额融资后，目前共获得5轮、2亿元风险投资，目前估值达15亿元。如今瀚海基因已开始在罗湖莲塘工业园建设1万平米的第三代测序仪生产线，建成之后产能将达到每年1000台，产生50亿元价值。
Pacific Biosciences公司
SMRT技术
与折戟沉沙的Helicos公司不同，同样是单分子测序技术的Pacific Biosciences公司则是风生水起。公司成立后经过6轮融资，共获得4亿美金的风险资金，成为2010年初创企业中的明星企业，同年10月，登陆纳斯达克，股票代码PACB。目前Pacific Biosciences公司主要拥有PacBio Sequel和PacBio RSⅡ两款测序仪。
PacBio Sequel（左），PacBio RSⅡ（右）
不过Pacific Biosciences公司的前景从去年开始似乎被蒙上一点点阴郁。2013年罗氏与Pacific Biosciences签订合作协议，到2016年2月曾有传言称，罗氏欲收购Pacific Biosciences，不过到了同年12月，罗氏突然宣布将终止与Pacific Biosciences在测序技术方面的合作，这令市场大跌眼镜，受此影响Pacific Biosciences的股价大跌38%。
而决定单干的Pacific Biosciences却面临三代测序研发投入高，商业化不成熟的困境，简单地说，缺钱。从8月公布的2017年Q2财报来看，公司总营收2010万美元，其中产品和服务收入增长17%。研发费用1690万美元，占总营收的84%，净亏损2550万美元。
在6月Pacific Biosciences宣布通过股票增发和向股票承销商出售股票，拟再融资4600万美元用于收购或投资互补业务、技术和产品候选产品。
不过好的一面是，公司的研发进度较为顺利，单分子测序也在证明其价值，股市对公司的信心同样在增长，公司的前景仍旧乐观。
在国内，有多家测序企业已经引进Pacific Biosciences的测序产品，提供第三代测序服务，其中就包括华大基因、诺禾致源等。（以下排名不分先后）
1
华大基因
华大在2015年5月就购入一台Pacbio RS II测序仪，并在同年12月又再次购入一台PacBio Sequel，但并没有后续的购买消息，其官网也没有相关的服务。作为基因测序服务领域的标杆，以及正在研发自己的基因测序仪的企业，华大对第三代测序技术的态度和行动，值得关注。
2
天津生物芯片技术有限责任公司
2013年天津生物芯片引进Pacbio RS II系统，提供第三代测序服务，2016年9月天津生物芯片又再次引进PacBio Sequel，现已形成PacBio单分子测序RSII和Sequel的“双核”平台。
天津生物芯片三代测序平台自2013年运行至今，已成功利用三代测序技术完成细菌、真菌、昆虫、动植物、人类等数百个物种的基因组、全长转录组测序及分析工作。目前天津生物芯片服务项目包括基因组学、蛋白组学、生物芯片、生物信息学、微生物鉴定、多克隆抗体定制等6大项共68小项。
2016年4月，天津生物芯片开放其三代测序平台，与诺禾致源达成深度战略合作，共同拓展高通量测序在科技服务领域的应用。
3
北京诺禾致源科技股份有限公司
致力于成为“全球最大测序服务中心”的诺禾致源在第三代测序技术的投入可谓大手笔，在2017年初引进10台PacBio Sequel系统，用于全基因组测序、全长转录组测序（Iso-Seq™）以及靶向测序服务。时隔半年后，又再次订购10台PacBio Sequel系统。
据诺禾致源公司创始人兼首席执行官李瑞强博士介绍：“在我们开始运行Sequel系统后的几个月内，SMRT测序的需求大增，我们的生产能力必须在短时间内翻番。”
同时根据PacBio董事长兼首席执行官Michael Hunkapiller博士的补充，此次订购，使得诺禾致源成为Sequel平台最大的用户，已是世界上最大的SMRT测序服务中心。
4
未来组生物科技有限公司
2016年武汉未来组与PacBio公司公司签订协议，目前共引进了6台PacBio Sequel测序仪，其中3台位于武汉研发中心，3台位于北京实验室。
据了解，未来组从2011年成立起就开始进行第三代测序技术的研究，2013年成功开发了基于Pacific Biosciences公司的第三代单分子实时测序平台的生物信息分析流程，解决了复杂基因组组装、微生物完成图和宏基因组组装、 全长转录组分析、人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈， 推动了基因组学研究的升级换代，目前已经完成上千个三代测序科研项目，发表了多篇三代测序的项目文章。
未来组不仅关注PacBio Sequel，在2017年9月，引进3台英国Oxford Nanopore公司的GridION X5纳米孔测序平台，并公布Oxford Nanopore (ONT)国内首发数据。
5
武汉菲沙基因信息有限公司
位于武汉光谷生物城的菲沙基因是PacBio Sequel另一个中国大客户，2016年双方签订合作协议，引进6台PacBio Sequel测序仪，其中首台与2016年3月开机。
据其官网介绍，菲沙基因是一家集第三代测序技术服务、三维基因组学技术服务、癌症基因组医学服务、生物信息软件开发、生物信息技术服务、基因组数据库搭建、基因检测技术研发等生物信息上下游产业于一体的高新技术企业。在2016年5月公司获得由湖北省高新技术产业投资有限公司投资的千万元A轮融资。
6
天津国际生物医药联合研究院
2014年10月，天津国际生物医药联合研究院第三代基因组测序仪中心、天津大学人类基因组研究中心、东丽湖基因测序平台在天津正式启动，引进15台第三代基因测序仪，并与天津市人民医院、华大基因、国家超级计算机天津中心等单位签订合作协议，从测序标本的获取、测序工作的进行、测序数据的分析构建“全检测链”。
7
北京百迈客生物科技有限公司
2015年，百迈客引进三台新型测序仪，其中包括一台PacBio RS II，同年12月该测序仪正式投入使用，与百迈客现有的BioNanoIrys系统互补，并与原有的Hiseq4000、Hiseq2500、DAProton、Miseq等测序仪组合，形成以第二代测序平台为主、结合第三代测序平台进行测序的模式。
同时，2016年12月，北京百迈客生物科技有限公司与PacBio、基因有限公司共同组建的联合实验室正式揭牌，据了解这是PacBio首次以联合实验室模式在中国开展战略合作。
8
上海翰宇生物科技有限公司
翰宇生物位于上海张江高科技开发园区，致力于第三代测序及第二代测序技术的应用与推广，是上海人类基因组研究中心长期战略合作伙伴。目前公司拥有PacBio RS II、MiSeq和Illumina HiSeq2500等全方位的三代及二代高通量测序平台。
9
上海派森诺生物科技股份有限公司
派森诺生物与2016年初宣布引进PacBio Sequel，目前据其官网介绍，派森诺生物目前拥有Roche 454 FLX+、Illumina MiSeq、Illumina HiSeq 2500、Illumina NextSeq 500、Ion Proton、PacBio RS II、PacBio Sequel等最新款高通量测序平台和相关仪器设备。致力于为生物、农业、医药、环境等领域研究人员提供动物、植物和微生物样品提取检测、文库构建、序列测序、生物信息分析和指导文章写作等一站式服务。
Oxford Nanopore 公司
纳米孔测序技术
Oxford Nanopore公司和它的纳米孔测序技术可谓是个传奇，Oxford Nanopore原本与基因测序大佬Illumina是合作伙伴，后来双方谈崩分手，Oxford Nanopore就被这个基因检测巨头当成了竞争对手。2016年被Illumina以产品侵犯其专利为由告上法庭，美国法院判决Oxford Nanopore败诉。
GridIon X5测序仪
但Oxford Nanopore立刻放弃被禁止销售的MspA纳米孔技术，转向新的CsgG孔。接连推出基于新技术的MinION、PromethION、SmidgION，以及最新的GridIon X5等一系列纳米孔测序仪。并在2016年底拿到1.26亿美元，据CEO Gordon Sanghera介绍，本次资金将用于商务业务范围的拓展，包括亚洲地区（尤其是中国地区）。
具体详见：一文盘点2016生命科学领域的独角兽企业
1
纳米孔测序在中国-武汉未来组
由于Oxford Nanopore的纳米孔测序技术在中国的商业化之路刚刚起步，从公开资料来看，目前只有武汉未来组在2017年9月引进3台GridIon X5系统，并开展测序业务。
2
竞争者出现？梅丽科技
在6月，一则并不怎么引人注意的消息进入小易的眼中，《全球尚无“纳米孔技术”癌症早筛商用产品，但梅丽科技希望用它走在医学前沿》，起初小易以为是某家公司引进Oxford Nanopore的测序仪，但仔细一看事情似乎并不那么简单。
梅丽科技团队（中间为周智博士）
从文章以及后续的报道显示，由周智博士在2016年创立的深圳市梅丽纳米孔科技有限公司，正在研发纳米孔早期癌症检测仪器，用户可使用仪器检测10μml体液（血液、唾液等），快速确认是否患有癌症及所患癌症阶段。目前，周智已完成实验室阶段的原理验证，第一代原型机将于今年6月研发完成，今年10月份左右可推出产品（硬件和软件）。（但目前尚未有相关的后续报道）。
据报道梅丽科技的癌症早期检测仪器被团队设计为小型手持式，测试者被抽取的体液（10μml左右）在混合试剂后，放入仪器中间的样品池，和盖密封后将设备连上手机或电脑。目前，整套试剂开发完成，仪器所用微流控芯片可量产，团队现正与协和、厦大附属医院等洽谈临床研发合作。
据公开报道显示，今年5月，梅丽科技已完成221万元天使轮融资，投资方为聚创造和九吾医疗控股有限公司。今年8月，梅丽科技的纳米孔应用于癌症诊断仪器项目获得深圳第二届“麒麟杯”创新创业大赛优秀奖，据了解，周智计划在今年9月启动Pre-A轮融资。
如今第三代基因测序技术迅速发展，国内外测序需求飞速增长，距离成熟商业化还有多久？中国企业是否能够借第三代测序技术的东风，孕育出一个新的Pacific Biosciences、Oxford Nanopore、甚至Illumina，我们很期待。
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