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AIDD专题

互动派教育 互动派教育 2023-02-12


AIDD专题




01

课程特色

本次系列课程共四个专题,均采用在线直播的形式,课后提供无限次的回放视频,建立永不解散的课程群,长期互动答疑,学员学完后可以继续与专业老师同学交流问题,巩固学习内容,从而更好地满足学员不同方面的论文及实际科研工作需求;

专题四课程通过机器学习、深度学习的分类回归任务、 分子特征、模型评估、参数优化与模型选择、浅层机器学习分类虚拟筛选、集成机器学习方法、DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型实操以及结合相关课题的应用实践等内容,带您真正的进入人工智能药物发现的领域。




02

课程大纲

时间

课程名称

课程内容

第一天

上午

计算机辅助药物分子设计

1.计算机辅助药物设计(CADD)简介

2.CADD的基本方法

2.1 分子对接

2.2 药效团

2.3 QSAR和QSPR

2.4 各类药学研究数据库的介绍

第一天

下午

Anaconda3的安装配置

3.Anaconda3

3.1 Pandas

3.2 NumPy

3.3 RDKit

3.4 scikit-learn

3.5 Pytorch

3.6 Tensorflow

3.7 DeepChem

3.8 XGBoost

第二天

上午

AIDD简介

——分类和回归任务

1.分类模型的构建与应用

1.1 逻辑回归算法原理

1.2 朴素贝叶斯算法原理

1.3 k最近邻算法原理

1.4 支持向量机算法原理

1.5 随机森林算法原理

1.6 梯度提升算法原理

2. 分子特征介绍

2.1 分子描述符  

2.2 分子指纹  

2.3 分子图

第二天

下午

基于浅层机器学习的药物发现(目标:引导学员自行实现基于其他三种算法如KNN,SVM,XGBoost的毒性预测模型,并用于小分子化合物的毒性预测)

3.模型评估方法

3.1 交叉验证

3.2 外部验证

3.3 分类模型的常用评价指标

3.4 混淆矩阵

3.5 准确率

3.6 敏感性

3.7 特异性

4.参数优化与模型选择

4.1 超参数优化

4.2 模型选择的标准

模型实例讲解与练习(文献复现):

给定数据集为例,基于随机森林算法的CYPs抑制剂相关毒性预测模型的构建与使用

第三天

上午

基于浅层学习的药物发现——回归任务

1.回归模型的构建与应用

2.回归模型的常用评价指标

2.1 MSE 

2.2 MAE  

2.3 R2

3.模型选择

3.1 超参数优化

3.2 最优模型选择

第三天

下午

基于浅层学习分类的虚拟筛选(目标:引导学员自行实现基于其他三种算法的pIC50值预测模型,并用于小分子化合物pIC50值的预测)

模型实例讲解与练习(文献复现):

Ø  以微管蛋白为例,机器学习分类任务在药物发现中的实战作用

Ø  给定数据集为例,基于随机森林算法的pIC50值预测模型构建与使用

第四天

基于深度学习的药物发现

1.深度学习的发展历程

1.1 深度学习在药物开发中的应用

1.2 DNN

1.3 GCN

1.4 GAT

1.5 KGCN

1.6 FP-GNN

2.深度神经网络的常用框架介绍

2.1 PyTorch

2.2 TensorFlow

3.DEEPCHEM介绍与使用

模型实例讲解与练习(文献复现):

Ø  DEEPCHEM集成的机器学习方法和加载使用

第五天

使用DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型进行实操

实例讲解与练习(文献复现):

Ø  给定数据集为例,使用DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型进行小分子抗乳腺活性预测

Ø  乳腺预测的基本思路,逻辑和课题设计


部分案例图示:

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03

课程时间

2023年4月08日-4月09日

2023年4月14日-4月16日

在线直播5天




04

报名费用

课程名称

原价(元)

优惠后价格(元)

CADD专题

(六天)

5900

5700

AMBER专题

(四天)

3900

3700

AIDD专题

(五天)

4900

4700

薛定谔专题

(两天)

2600

2400

费用提供用于报销的正规机打发票及盖有公章的纸质通知文件;

如需开具会议费的单位请联系招生老师发送会议邀请函;

年底免费大赠送:(赠送的免费课程不开发票)

1)  报名CADD专题课程,可任选AMBER专题、薛定谔专题、AIDD专题课程之一免费参加

2)  报名AIDD专题课程,可任选AMBER专题、薛定谔专题课程之一免费参加

3)  报名AMBER专题课程,可免费参加薛定谔专题课程




05

联系方式



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