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这些年,NEJM文章用的统计方法有啥变化

2017-10-24 医咖会 医咖会

2005年,NEJM发表了一篇文章《Statistical Methods in the Journal》[1],可以看到1978-1979,1989以及2004-2005年期间,NEJM发表的原始研究使用的统计方法总结。2017年,NEJM对此进行了更新,可以进一步看到2015年NEJM发表的文章所用的统计学方法[2]

先来看一下2005年的情况

在2005年发表的这篇文章中,作者纳入了NEJM在2004年1月份至2005年6月份发表的311篇文章。对于每篇文章,作者仔细审查了方法学部分,并浏览了结果部分以及统计相关的附录内容。每篇文章都由两个人独立审查。


相比1978-1979以及1989年,2005年的文章增加了新的统计学方法。表1显示了不同时期,NEJM原始研究中所用的统计方法。(每种统计方法的中英文对照和举例详见文章最后的附录)

注:(1)累积使用这一列,数值和百分比代表的是,有多少文章只使用了该行或该行以上的统计方法。例如,非参数检验这一行对应的53,则表明有53篇文章使用了:描述性统计,t检验,列联表分析或非参数检验(未使用该行以下的统计学方法)。

(2) 2004-2005年使用其他统计方法的13篇文章,包括5种遗传分析和2个Meta分析。


相比1989年,2005年分析的文章中,无统计方法或仅有统计性描述的文章百分比无明显变化。不过,包含列联表、流行病学统计指标、生存分析、多重回归、多重比较和功效分析等统计方法的文章百分比有了大幅增加。与既往的研究相一致,2005年的结果表明,更新和更复杂统计学方法的使用有持续增加的趋势。

再来看一下2015年的情况

2017年发表的这篇文章,纳入了2015年1月至12月NEJM发表的238篇文章,至少两位生物统计学家独立审查每篇文章,并基于27种统计学方法分类清单(详见文章最后附录)记录文章使用的统计学方法。


图1展示了使用不同统计学方法的文章百分比。在2015年的238篇文章中,共14(6%)篇文章未使用统计方法或仅使用了描述性统计。1978-1979,1989,2004-2005年,平均每篇文章使用的统计方法数量分别为1.9、2.7和4.2,2015年这一数字增加到了6.1

图1. 不同时期使用某种统计学方法的文章百分比


可以看到,过去10年,功效分析(即统计功效和样本量计算)、流行病学统计指标(例如OR,RR)、调整和标化(针对发病率和患病率)等的使用有明显增加。2015年,超过一半的文章使用了功效分析(62%),生存分析(57%),列联表(53%)或流行病学统计指标(50%)。


t检验在1978-1979期间是最为常用的统计学方法(44%),但是其使用频率有下降的趋势,1989、2004-2005、2015年的文章中,分别有39%,26%和31%使用了t检验。和之前的发现一样,更多样化和更高级统计方法的使用有逐渐增加的趋势。

扩展阅读

《J Clin Pharm Ther》之后发了一篇文章[3],对上述2015年的文章进行了扩展,使用了同样的238篇文章,分为干预性研究和观察性研究两大部分,对研究设计和统计方法进行了更细致的分析。和大家分享几个结果图表,感兴趣的伙伴可以了解下~


表2. 238篇文章中使用的统计学方法总结


表3. 对统计方法进一步细分


表4. 238篇文章的研究结果

(点击图片可查看清晰大图)


图2. P值分布(N=209) (.001包含P<0.001部分)

附录

统计方法分类及简单举例


No statistical methods or descriptive statistics only

无统计方法或者只有描述性统计

  • 无统计内容或者仅有描述性统计,例如百分比,均数标准差,标准误,直方图


t-Tests (t检验)

  • 单样本、配对、两样本t检验,z检验


Contingency tables (列联表)

  • 卡方检验,Fisher精确概率法,McNemar检验


Nonparametric tests (非参数检验)

  • 符号检验,Wilcoxon符号秩和检验,Mann-Whitney检验,中位数检验,Kruskal-Wallis检验,Friedman检验,Kolmogorov Smirnov检验


Epidemiologic statistics (流行病学统计指标)

  • RR,OR,log odds,敏感度,特异度


Propensity Score (倾向性评分)

  • 匹配,校正,分层,加权


Pearson’s correlation (Pearson相关)


Simple linear regression (简单线性回归)


Analysis of variance (方差分析)

  • 方差分析,协方差分析,简单比较,F检验


Transformation (数值转换)


Nonparametric correlation (非参数相关)

  • Spearman秩相关,Kendall等级相关,单调回归,趋势检验


Survival methods (生存分析)

  • 生存函数,Kaplan-Meier曲线,Cox回归模型,其他生存分析模型,log-rank检验


Multiple regression (多重回归)

  • 多项式回归,逐步回归


Multiple comparisons (多重比较)

  • Bonferroni法,Scheffé法,Dunnett法,Duncan法,SNK法,FDR


Adjustment and standardization (调整和标化)

  • 用于对发病率及患病率进行调整和标化


Multiway tables (高维列联表)

  • Mantel-Haenszel法、对数线性模型、logistic回归


Power analyses (功效分析)

  • 定义比较宽松,涉及到统计功效和样本量计算


Cost–benefit analysis (成本收益分析)


Sensitivity analysis (敏感性分析)


Repeated-measures analysis  (重复测量分析)

  • 重复测量方差分析,广义估计方程(GEE),重复测量资料的固定效应模型


Missing-data methods (缺失值处理方法)

  • 个案剔除法,成对删除法,均值填补法,热卡填补法,单一填补法,多重填补法


Noninferiority trials (非劣效性试验)


Receiver-operating characteristic (ROC曲线)


Resampling (重采样)

  • bootstrap,交叉验证(cross-validation),刀切法(jackknife)


Principal component analysis (主成分分析)

  • 因子分析,逐步判别分析,方差最大化旋转


Cluster analysis (聚类分析)

  • 谱系聚类,快速聚类,两阶段聚类,DBSCN


Meta分析


Genetic analysis (遗传分析)

  • 遗传度和分离分析,连锁分析,遗传关联分析,基因表达数据分析


以上很多统计方法的SPSS操作,医咖会既往都有推送过,详见:【合集】36种统计方法的SPSS详细操作


参考文献

1. N Engl J Med. 2005;353(18):1977-9.

2. N Engl J Med. 2017;376(11):1086-7. 

3. Trends in study design and the statistical methods employed in a leading general medicine journal. J Clin Pharm Ther. 2017 Jul 27. doi: 10.1111/jcpt.12605.


更多阅读

1. 如何处理缺失数据?给你支3招!

2.【合集】15篇诊断试验和ROC曲线文章,从理论到操作,要啥有啥!

3. 这4种倾向性分析方法你值得了解!

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