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“MIDAS”平台可检测蛋白质-代谢物间的相互作用|Science一周精选
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为了帮助改进对蛋白质和代谢产物间难以捉摸相互作用的发现和表征,研究人员推出了MIDAS(质谱与平衡透析相结合以系统性地发现变构状态)。
据作者表示,MIDAS代表的是一种强大的新型工具,它可以“发现、了解和利用先前未知的蛋白-代谢物相互作用组中的代谢调节模式。”蛋白质和小分子代谢产物之间的相互作用是最常见和最基本类型的生物相互作用之一,它们在调节蛋白功能和控制多种细胞过程中发挥着重要作用。然而,对蛋白质-代谢产物相互作用(PMIs)的发现和表征一直是零星且具有挑战性的。
为了解决这一问题,Kevin Hicks和同事开发了MIDAS平台,该平台能够系统性地发现难以捉摸的PMIs。Hicks等人用MIDAS分析了33种人体中参与碳水化合物代谢的酶与401种代谢产物的相互作用,揭示了830种PMIs。
MIDAS确认了先前已知的调节因子、底物和产物的PMIs,但该方法还能让作者从不同的代谢途径发现许多先前未知的PMIs,其中包括由ATP和长链酰基辅酶A对乳酸脱氢酶的调节。
据作者披露,这一发现可能是不同组织中脂肪和碳水化合物代谢之间意想不到生理关系的基础机制,它或可被用于阻断有氧糖酵解以治疗癌症。
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