Hello 未来！Oxford Nanopore测序数据惊艳首发！

关键字：武汉未来组  Oxford Nanopore  

高产出高质量 超长读长 首发

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武汉未来组（NextOmics）继成为首家中国PacBio测序服务供应商之后，今天下午又为大家带来了突破测序界“摩尔定律”的Oxford Nanopore (ONT)首发数据。

国内三代测序技术应用的开拓者武汉未来组（NextOmics）自2011年起一直致力于将领先技术提供给关注前沿科学的合作伙伴。作为中国首家PacBio测序服务供应商，也是亚太区首批PacBio Sequel测序中心，经过5年多的技术积累，逐渐成为世界领先的三代测序中心。

Oxford Nanopore自诞生以后，因优点众多，而备受关注，未来组已于数月前引入该平台，且看最近新鲜出炉的测序数据测评吧，欢迎点击阅读原文并收藏~

未来组采用人血源DNA，构建＞10kb文库，于Nanopore MinION测1个flowcell，对下机reads进行质控统计，并与参考序列进行比对。

高产出，高质量

单个flowcell产出约2.5G，与文献中使用Nanopore MinION测序组装人类参考基因组时的平均产出相当：~2.3Gb^[1]（39个flowcell共产出91.2Gb），并且其中高质量reads比例＞80%。

超长读长

随后评估reads读长分布，平均读长~13.5kb，long reads最长达137kb，高于文献中的测序数据^[1]（Mean read length ~8.6kb）。

与参考基因组比对mapping率高

之后再评估测序数据的准确度，将reads与参考基因组GRCh37比对，mapping率高，符合预期。

初次测评就介绍到这里，后续未来组将持续优化建库上机条件，带来更惊艳的数据，请记得持续关注。

记得今年早期，向稳（基云惠康创始人）在一篇微信文章中就提出，中国哪家测序公司会首先推出Oxford Nanopore的测序服务？我们今天算是给出了一个正式的答复。

三代测序是武汉未来组从2012年开始，就确定的差异化发展的战略。在2013年3月11日，正式推出三代测序（PacBio平台）服务以后，武汉未来组就一直不遗余力的推动三代测序在各个领域的应用，从一开始是在线粒体、叶绿体、细菌的基因组组装、表观修饰分析，逐步过渡动植物基因组的组装、人类基因组的组装、全长转录组等领域，武汉未来组一直走在了探索的前沿。今天，我们推出三代测序的又一个新平台，Oxford Nanopore，这对于我们来说，是一个新的里程碑。坦率的说，是否中国首家推出Oxford Nanopore测序服务，对于武汉未来组来讲，已经没有实质性的意义，但是，对于一个追求技术极限的团队来说，不走在技术的最前沿，就是一种耻辱，是我们不能接受的。

       今天，我们公开的数据结果，仍然是很初步的数据，Oxford Nanopore平台仍然是一个早期应用的平台，还有很多不完美的地方。但是，我们相信，这条道路通向的，一定是一个崭新的世界！

    Hello，未来！

    Hello, Next-generation Omics !

                                 ——  Wonder

                     2017年9月15日凌晨

                            简评于武汉光谷

参考文献

[1] M Jain, S Koren, J Quick, et al. Nanoporesequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads. bioRxiv. 2017

【注】如果您愿意参与到Oxford Nanopore数据的分析中来，请点击阅读原文，获得OxfordNanopore原始数据。