干货！生存分析从理解到作图妥妥的
问题1：临床研究的生存分析：
研究眼部按摩疗法是否有助于视力的恢复。
实验记录的结果是康复所需的天数。
这种台阶图怎么画？
两组是否有显著性差异？
问题2：动物试验的生存分析：
荷瘤小鼠接受不同的药物处理，通过比较裸鼠存活的天数，来判断药物是否有效。
请绘制生存曲线(如右侧台阶图)：
A和Control是否有显著性差异？
A和B是否有显著性差异？
相关关键词：
生存分析（Survival Analysis）
生存函数
Kaplan-Meier
生存曲线（Survival Curve）
注意和“生长曲线growth curve”区分
多重比较（Multiple Comparisons）
计划比较（Planned Comparisons）
大家可以在百度、Google上搜索以上关键词。
生存分析可使用的软件：
1、GraphPad
2、Origin
3、SPSS
一、生存分析——2个实验组
【原始数据】生存分析(2组)：
1、目的：研究眼按摩疗法是否有助于视力的恢复。
2、方法：挑选20个视力为4.6的受试者分成两组——对照组和治疗组，记录视力恢复到5.0的所需的天数。
3、该研究期限为2年。
【目标图片和目的】生存分析(2组)：
生存分析(2组)的组间比较：
GraphPad提供两种比较方法：
Log-Rank法
Gehan法
默认使用第一个。除非有充足理由才使用第二个。
若P值≤0.05，则两组的生存曲线存在显著性差异。
二、生存分析——3个实验组
【原始数据】生存分析(3组)：
【实验方法简述】：
1、给裸鼠接种肿瘤，以肿瘤体积达到某预定值的时间定为0天。
2、按组别注射生理盐水或药物，记录裸鼠的存活天数和肿瘤体积变化。
3、实验观察的期限为50天。
【目标图片和目的】生存分析(3组)：
生存分析(3组)的计划比较：
3个实验组的生存分析的P值≤0.05，只能说明3组内存在显著性差异（通俗的说就是，三组治疗不完全等效）。
取计划进行两两比较的两组，重新进行2个实验组的生存分析。将计算出来的p值与0.05进行比较。
多重比较和计划比较：
1、Multiple Comparisons：控制总体的最大试验误差率为0.05，对Comparisons使用校正过的α（比0.05要小）。
2、Planned Comparisons：控制Comparisons的误差率为0.05，相对更容易捕捉微弱信号，但容易放大总体试验误差率。
3、科研中多为探索性实验，总体的结论有时不太有用，多数用Planned Comparisons。
三、生存分析——4个实验组以上
【原始数据】生存分析(4组)：
【目标图片和目的】生存分析(4组)：
没有显著性差异怎么办？
探索性实验有时不必拘泥于统计学的条条框框。
Choice1：做一个遵守统计学规律的好孩子，忽略微弱信号。
Choice2：冲破这些死板的规律，捕捉到这些微弱信号，继续用实验证明。
四、生存分析拓展知识
生存分析在不同软件的输入方式：
GraphPad是通过不同列来分组的。
SPSS和Origin是通过一列数字来分组的。
适合多重比较的一个例子：
【实验方法简述】：
购买了三箱裸鼠，怀疑这三箱不是同一批生产的，不做任何处理进行生存分析。
因此，需要判定一下“这三箱裸鼠的生存曲线是否有显著性差异”。
在该结论的基础上，同时判定“两箱之间是否有显著性差异”。
生存分析(3组)的多重比较：
取要进行两两比较的两组，重新进行2个实验组的生存分析。将计算出来的p值与校正过的α值进行比较。
生存分析(3组以上)的多重比较：
对3组以上(含3组)的生存分析结果进行显著性差异判断时，选择两组进行生存分析计算P值后，和校正过的α值进行比较。
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续
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