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Western百败百战老学姐的心酸笔记

2016-06-25 小笔 弗雷赛斯

作为一枚资深伪文青,平常小笔最爱的莫过于看风景、弹古筝以及毫无逻辑无病呻吟(哈哈哈,人生最大幸事,没有之一)。然而小笔的正业却是严谨的科学探究(是不是想翻我个大白眼),没错,就是这么神奇的切换。


那么,作为在科研之路上摸爬滚打多年的老学姐,很想和大家吐槽吐槽一路走来遇到的奇葩事,以及从中汲取的经验咯,今天就先来聊聊我第一次触电的western吧。。。



说起western,大家再熟悉不过,是业内大部分专业的基础入门级技能。小笔第一次来实验室接触的就是它。相信很多新手宝宝和小笔一样,第一次看师兄师姐捣鼓一天,又是稳压跑蛋白又是稳流转蛋白,然后还要在冰箱里面摇着过夜,脑子彻底懵圈了。等好不容易理顺了过程,又有新的问题层出不穷。明明和师兄师姐步骤一样啊,啥都一样啊,为啥结果就是不对呢,或者是没有呢?天理何在?默念是不是该走一趟灵隐寺?


作为曾经一个月半根条带都爆不出来的小笔,经过失败,分析,整理,再失败,再分析的过程,积攒了一些经验。具体的操作过程就不赘述,毕竟度娘啊什么的比我强大的多,在此强调一些易被忽视的细节,并分享一些我的经历,供大家举一反三:

1

做胶总是漏,蛋白跑的总是丑:相信这是很多初学者常遇到的问题。明明玻璃洗的很干净啊,明明加水使液面平整了啊,明明是混匀后才做的胶为何跑出来的蛋白歪歪扭扭。。。其实这很简单,就是认真的态度和细心的双手


这些操作都很容易,基本上没有技术难度,但是也很容易出问题,比如胶的液面为何不平,常常是因为你加双蒸水的时候力道太大,而胶相对凝固的时间较短,液面不平是理所应当。所以细心和耐心非常重要,心急吃不了热豆腐哒。



 

2

 如何快速又稳定的跑蛋白呢?电压过大,产生的热量也会很高,温度太高会影响某些目标蛋白的表达并且跑出来的条带很丑,而一直低电压所耗费的时间不少。


以小笔和小伙伴们的经验,一般在电泳槽内放上一个冰袋用于降温,同时采用70V恒压,30min; 随后200V恒压, 时间根据所需蛋白分子量来定。


上述步骤都只须动动手指头就分分钟搞定,为了做一个高效的科研狗,此刻你应该做的是配置好转膜液,并偷偷告诉你,转膜液于-20℃冻存备用(提高转膜效率,一般人我不说哦)。


友情提醒,一定要盯牢你的蛋白marker跑到了什么位置,不然就要game over了,不要问小笔怎么知道的,往事不要再提。



 

3

蛋白转到了滤纸上?!没错,就是这么任性。小笔在此分享的是湿转法:请认准“黑胶白膜”经典套餐,滤纸的长宽比胶小2 mm左右,而膜的长宽比胶大2mm左右,绝对避免上下两层滤纸接触而引起短路,并按照图所示对好正负极后,再接通电源。


如果电压接反或者膜和胶的位置放反了,就会出现蛋白跑到滤纸的情况。操作该过程尽量使用干净的手套。其实也是一个细心的问题,鉴于我的大大咧咧,在此问题上也出过不少差错。




     

4

封闭液选择?一抗的时间到底有没有要求?是不是孵育时间越久越好?一般用BSA或者脱脂奶粉,我们实验室多采用脱脂奶粉,封闭后背景比较干净(但在检测磷酸化蛋白可以采用BSA,因脱脂奶粉含磷酸化蛋白会造成干扰)。


师妹曾把一抗放在4℃冰箱摇了3天。。。然而并没有什么卵用,甚至有些蛋白反而爆不出来了。一般来说,当天想要出结果,在室温孵育3-4小时即可。时间不够的话室温孵育1小事后4℃冰箱过夜就妥妥的了。


5

啥么都一样,为何换了一个环境,蛋白就出不来了呢?!这个问题,小笔。。。说起来就有点复杂了,小笔老板当初从美国回来开办实验室的时候,明明带着成熟的western protocol,也摸索了大半年才建立起了完善的western体系。


小笔当初从我们的一个实验室去到另外开辟的新的实验室的时候,也是一个月没有做出来结果,而且好几个人都没有结果。说起来玄乎,其实这其中也是有着各种各样的小问题和小方法的,活学活用,因地制宜还是很重要的。

其实western的方法和攻略,网上总结的很多很多,我的分享只是九牛一毛。为何没有大篇幅的来讲,其实也是想起到抛砖引玉和启发的作用。毕竟,问题形形色色,各不相同,关键还是要去摸索,用看韩剧的热情去挖掘实验的精华,用打魔兽的激情去战胜这些所谓的bug。


小笔是一枚伪文青,用的是看风景的心情,弹古筝的专注,和“无病呻吟纸上谈兵天马行空”的开阔思维,努力奋斗在科研的路上(咳咳,夸的好像有点过了,面壁去)。





只想做个闲人,对一张琴,一池荷,一溪云…做实验??oh no,这也太煞风景了,让我静静,下次见。





实验专栏主编

小笔,我浙药学院的一名普通老博,“长期奋斗”在肿瘤药理及神经药理学领域,经常跟老鼠细胞啥么的打交道,不过马上要滚蛋了,但仍然会活跃在这几个领域继续做实验,聊八卦。其实小笔最初的自我定位是成为一枚文艺女青年,不过每天在实验室泡着久而久之也就只是枚伪文青了。小笔想用一颗文艺加逗比的心,把枯燥的实验操作转化为轻松清新的语言传递给大家,生活还是可以很美好,课题实验也还是可以继续哒!


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