干货 ！如何智能地整理一大堆文献

在我看来，整理文献的主要目的是：在任何条件下，快速找到所需信息。

任何好用的软件，都不如大批量多批次的文献阅读。

我的思路是：轻整理重搜索

轻整理，是指不对文献分类，或者只是对文献简单分类。重搜索，是指利用不同的搜索工具，快速定位到我需要的文献。

在日常使用中， 除了在文献PDF上直接标注，我很少用其他的软件去记录我看过的文献。因为除了文献本身，其他还有什么载体能够那么直接方便地记录呢？

所以整理文献问题就成了：如何快速找出那篇有我笔记的PDF文献。

以此为目的，我建立了一套以文献PDF云同步为基础，辅以大量搜索工具的文献整理方案。

我现在的主要方法：

以Mendeley建立电子文献索引为主，并以云端同步PDF文献为主要储存手段，通过Everything，Google Scholar，桌面搜索软件，Onenote笔记等多种搜索手段，快速找到自己所要的信息。

干货开始

重搜索

在新项目（写一篇综述，开始一个新课题或者完成一份大作业）之前，我会在Mendeley中根据不同项目，建立一个新文件夹。

一个项目刚开始的时候，首先建立一份本地的文献原始积累。我习惯在Web of Science上根据关键词去找所需要的文献。比如我现在想看一下微流控单细胞测序（microfluidic single cell sequencing）最近的进展时，就去WoS搜。

将所有文献的题目全部浏览一遍，下载需要关注的文献，阅读标注后，将有价值的PDF文献，拖进Mendeley，建立原始的文献积累。

Mendeley会自动提取文献信息，按照文献的发表年份，期刊，和文章题目将文献重命名，并将该文献自动整理到指定文件夹中，完成文献的原始积累。（这也是mendeley相较于endnote等其他的文献整理软件而言，所具备的最大优势）

我又将这个Mendeley的文件夹中所有文献用dropbox同步。之后我要看文献时，只从这个文件夹中打开文献。这样做的好处就是，把所有的文献和笔记信息全部集中化了，不会造成信息碎片。

我看一篇文献，除了一些世界上的顶尖超级大牛，一般记不住作者的名字，但是我一般会对文章发表年份和所在期刊有很深的印象。而且一般题目又提供了文章中最主要的信息

所以我设置Mendeley自动根据文献的三个强信息：

1发表年，发表期刊，和文章题目自动重命名，并结合everything，在本地实现文献的第一重搜索。

2如果搜索目标很明确，比如我现在想找一篇之前在Nature Drug Review上看过的关于drug combination的文章，由于关键词很明确，用Everything直接就从本地找到了，耗时不超过3秒。

3如果搜索目标不那么明确，比如 “总感觉有些文献读过就忘记了，想用的时候想不起来”；或者找找一些特定的问题，不确定本地文献有没有。这个时候我一般会把所有能想到的关键词输入，上Google Scholar搜索。（什么！国内科研汪没法上Google scholar？哼哼╭(╯^╰)╮还记得那些年freescience推过的新技能系列嘛~~~点击“新技能get”一栏查看往期推送，谷歌不能用还是能一劳永逸！）

这个时候，可能会找到一些文献在本地是有的，那就可以根据文献名，用Everything快速在本地找到对应的文献。

如果一些文献本地没有，那就直接下载PDF，阅读后在Mendeley建立本地索引。

如果想要搜索特定一句话，或者在写文章的时候想对一些说法进行佐证，就可以用Mendeley的搜索工具，或者还是上Google Scholar。

轻整理

我一般会在平时读文献的时候，根据一个项目下的不同问题，建立一些小的分类。在Mendeley中，同一篇文献是可以归属不同的文件夹的，所以在归文件夹的时候也不用那么纠结。

最后，我想说的是，任何文献整理软件都不能代替人对文献的阅读，任何时候读文献中信息永远是第一位的。整理软件只能够帮助更加快速地找到所需的信息，仅此而已。

本文整理自知乎 nerfing大大的文章

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