查看原文
其他

用了Docker,妈妈再也不担心我的软件安装了 - 基础篇

2017-06-19 陈同 生信宝典

Docker能做什么

The key benefit of Docker is that it allows users to package an application with all of its dependencies into a standardized unit for software development.

  • 提供一个虚拟的操作平台,供我们安装依赖不同版本系统的工具软件。

  • 提供一个即时可用的应用软件或者流程的镜像,开发者把软件部署到系统镜像中, 使用者可以直接下载下来使用,省去了个人安装软件的烦恼。

  • 提供一个系统资源分配手段,给不同用户的程序分配独立的计算资源。

Docker的几个基本概念

  • 镜像 (Images): 可以认为是超级轻量级的虚拟机的快照。 镜像会有自己的唯一ID,名字和标签,比如ubuntu:latest, django:1.6等。 通常都是在已有的镜像(多数是Linux操作系统的镜像)的基础上构建自己的 具有新功能的镜像。

  • 容器 (Containers): 可以认为是超级轻量级的虚拟机, 是镜像运行起来所处的可读写的状态。 容器里面可以安装、运行程序,还可以把安装好的程序存储起来获得新的镜像。

    与虚拟机很大的不同在于,一个容器通常只运行一个程序。在Docker中, 应用程序和数据文件是分开的,因此可以在不影响数据的情况下快速升级代码 或系统。

  • 数据卷 (Volumes): 永久保存数据的磁盘空间。 Docker允许用户定义哪一部分是应用程序,哪一步分是数据,并且把他们分隔开。 这就保证了在Docker中容器的生命周期是短暂的,而数据的存储是永恒的。

    数据卷存储在运行Docker的宿主机上,对每个容器来说是特有的。 我们可以启动同一个镜像来产生多个容器,并且分别给他们分配一个数据卷。

    数据卷也可用于在不同的容器间共享数据。 具体参见http://blog.genesino.com/2016/09/docker-lamp/

  • 联通 (Links): 容器启动后会分配有一个私有IP,其它容器可以通过这个IP地 址与这个容器通讯。

    假如有个正在运行的数据库容器 (dbapp), 那么我们可以在网络服务器容器 (webserver)中通过指定端口连接dbapp与数据库容器通讯。

安装和配置

  • Centos 6.5 安装Docker


    #添加epel的源
    su -c 'rpm -Uvh  http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/i386/epel-release-6-8.noarch.rpm'
    yum update

    # 安装Docker
    yum install docker-io

    # 启动Docker服务
    service docker start
    # 关闭Docker服务
    service docker stop

    # 设置Docker开机启动
    /sbin/chkconfig --add docker
    /sbin/chkconfig docker on
  • 其他新版操作系统的安装可以直接使用系统自带的yumapt工具, 启动和配置如上。

    apt-get install docker.io

Docker用户权限

默认情况下,Docker命令的运行需要根用户权限。一个解决办法是把用户加入docker用户组,原因是Docker能够将/run/docker.socket的文件权限设为660、用户组设为docker。当把用户加入到docker用户组后,就无需使用sudosu命令切换获取根用户权限。check here

###以下操作都是在根用户下进行的

###增加一个用户组docker
# groupadd docker
###把用户${USER}加入docker用户组
# usermod -aG docker ${USER}
###重启docker服务(可不执行)
# service docker restart
###新窗口登录${USER}

但通常只应把信任的用户加入docker用户组因为docker用户组的权限相当于root。

如果打算只允许用户访问一个特定的容器,可以写一个简单脚本

# cat /bin/docker_container1
#!/bin/sh
docker run -ti --rm container_name /bin/sh

脚本完成后,配置sudoers

# grep username /etc/sudoers
username   ALL=(ALL)  NOPASSWD: /bin/docker_container1

更多权限设置见http://dockone.io/article/589

Docker试用

  • 查看本地Docker的信息 docker info

  • 运行Docker需要有一个镜像和容器。镜像是容器的只读版本, 最基础的镜像是一个操作系统,是运行其他命令的基础。 因此我们需要先获取一个操作系统镜像,通常使用Ubuntu系统, CentOS系统和 Alpine (只有5M)。 我们也可以根据所要运行软件的需要,来获取不同的操作系统, 方便软件的安装。

  • 搜索镜像 docker search ubuntu; 镜像的名字通常由用户名/镜像名构成, 无用户名的为官方认证镜像。

    root@server:~# docker search ubuntu
    NAME              DESCRIPTION      STARS     OFFICIAL   AUTOMATED
    ubuntu            Ubuntu is ...    4595      [OK]      
    ubuntu-upstart    Upstart is...     66       [OK]
    jordi/ubuntu      Ubuntu bas...     1                    [OK]
  • 获取镜像

    • docker pull ubuntu 获取镜像的最新版本(不指定版本号即为latest)

    • docker pull ubuntu:14.04 获取指定版本的镜像;14.04为镜像的版本号(又称TAG)。

  • 查看本机Docker中存在的镜像 docker images

    REPOSITORY   TAG      IMAGE ID       CREATED      VIRTUAL SIZE ubuntu       latest   37b164bb431e   4 days ago   126.6 MB
  • 获得了镜像之后,我们需要运行镜像;运行起来的镜像就是容器,是可读写的。 我们可以在容器中安装软件、运行命令,就如在正常的操作系统中一样。

    在容器中运行单个命令或程序, 通常加--rm参数,容器运行结束之后就自动 删除。如果我们想保留容器的修改,则不能加--rm参数。

    docker run --rm ubuntu echo "Hello from docker"
    Hello from docker

    交互式运行容器 docker run -it ubuntu, 这时可以发现终端的用户名变了

    root@server:~# docker run -it ubuntu
    root@57cb695e904f:/# ls
    bin   dev  home  lib64  mnt  proc  run   srv  tmp  var
    boot  etc  lib   media  opt  root  sbin  sys  usr
    root@57cb695e904f:/#

    docker run --help可以查看这个命令的参数。

  • 在容器中部署软件,安装build-essentialr-base; build-essential 是编译软件包的基础,提供需要的编译器、头文件和库文件。r-base 是编译R语言程序包的基础。

    apt-get update
    #apt-get install -y build-essential r-base
    apt-get install toliet

    这一步我们可以安装任意的软件,测试时可以选择小一点的软件包。 最开始时选择了安装build-essential, 只是为了学习, 到后来发现安装这个并没有什么用,也不方便测试。为了简单起见, 可以尝试安装Apache。在本文后面有个简单的测试Apache安装的例子。

  • 运行docker commit -m 'Add build-essential r-base' -a ct5869 8aca49b869be ct5869/ubuntu-dev:v1''

  • 测试运行新的镜像 docker run --rm -it username/ubuntu-dev:v1

  • 挂载宿主机硬盘在容器内部操作, 通过-v参数,路径都为绝对路径,docker run --rm -v /host_absolute_dir:/container_absolute_dir username/ubuntu-dev:v1 echo 'test' >/container_absolute_dir/test_file这样,就相当于把host机目录/host_absolute_dir链接为docker容器路径/container_absolute_dir

  • 如果只是自己用,到现在就可以结束了,我们可以在镜像里面继续更多的操作了。

  • 另外我们还可以运用导出导入来迁移镜像

    • 导出镜像:docker export image_id >ubuntu-dev.v1.tar

    • 导入镜像:cat ubuntu-dev.v1.tar | docker import - username/ubuntu-dev:v1

  • 如果我们想把镜像分发给别人使用,就需要把镜像传到镜像仓库比如Docker Hub。 我们需要现在Docker hub注册, 用注册的用户名替换掉前文提到的username

  • 注册成功之后,在本地服务器尝试登录,用以把登录信息存储在本地,方便后续使用。 运行docker login,按提示输入用户名、密码和邮件。登录成功会返回Login Succeeded.

  • 运行docker push username/ubuntu-dev:v1把准备好的镜像上传; 等待片刻,完成上传。这时就可以再Docker hub上看到上传的镜像了。

  • 其它用户可以使用 docker pull username/ubuntu-dev:v1来获取安装好编 译环境的ubuntu系统了。

Docker系统基本操作

  • 当一个容器不再使用时,运行docker rm container_id移除容器,以节省空间。 这不会对镜像造成影响。

  • 当一个容器不再使用时,运行docker rm -v container_id移除容器及其挂载卷, 以节省空间。这不会对镜像造成影响。

  • 批量删除退出的容器docker rm -v $(docker ps -a -q -f status=exited)

  • 对于只需要单次运行的容器,比如执行一个命令等,则只需要在docker run时添加--rm参数就好。这样容器运行结束后会自动删除。

  • 运行docker rmi username/ubuntu-dev:v1移除镜像。

  • 运行docker tag 26d99f722dca username/ubuntu-dev:v0修改镜像的名字。

  • 运行docker run -d --name=container_name username/ubuntu-dev:v1指定运行的container的名字。

  • 运行docker run --rm -ti -v /host_abs_dir:/container_abs_dir:ro username/ubuntu-dev:v1挂载只读目录。

  • 运行docker stop containde_id/container_name停止镜像。

  • 运行docker rm $(docker ps -a -q)docker rmi $(docker images -q)移除全部镜像。BE CAREFULL

  • 查看Docker镜像的创建历史 docker history image_name

    IMAGE          CREATED       CREATED BY SIZE                COMMENT 3d4f934accdb   7 months ago        /bin/sh -c #(nop) CMD ["/run.sh" ]               0 B                 aa321fa8d23f   7 months ago        /bin/sh -c #(nop) EXPOSE  3306/tcp 80/tcp        0 B                 6446fbfc507d   7 months ago        /bin/sh -c #(nop) VOLUME  [/etc/mysql /var/lib   0 B                 44e98bdf2bbf   7 months ago        /bin/sh -c #(nop) ENV PHP_POST_MAX_SIZE=10M     0 B                 bedff16caee9   7 months ago        /bin/sh -c #(nop) ENV  PHP_UPLOAD_MAX_FILESIZE   0 B                 72b723ccc97f   7 months ago        /bin/sh -c mkdir -p /app && rm -fr /var/www/h   0 B
  • 查看镜像的JSON文件 docker inspect image_name

  • Docker images的安装路径为 /var/lib/docker

    • /var/lib/docker/{driver-name} will contain the driver specific storage for contents of the images.

    • /var/lib/docker/graph/<id> now only contains metadata about the image,  in the json and layersize files.

  • 查看Docker 容器启动和运行日志

    docker logs --tail=all container_id

使用Dockerfile自动构建镜像

除了可以像上面那样一步步地获取镜像、修改容器、存储镜像、上传镜像等操作外, 我们还可以使用Dockerfile自动实现上述操作。

典型的Dockerfile如下所示,

FROM alpine MAINTAINER username username@internet.com RUN apk add --no-cache apache2 apache2-utils COPY public_html /var/www/html EXPOSE 80 443 CMD ["rc-service apache2 start"]
  • FROM为除注释之外的第一条命令,用来声明镜像的基础系统。

  • MAINTAINER设置镜像维护人的信息。

  • RUN在容器内部运行shell命令。

  • COPY是把本地的bash配置文件拷贝到新维护的镜像中; COPY的文件的路径是相对于docker build的PATH,一般是当前路径;

  • CMD指定容易运行时默认执行的命令,如出现多个,只有最后一个会被运行。

运行命令docker build -t="username/httpd-alpine:v1" .就可以构建镜像了。 最后的.表示Dockerfile在当前目录,也可指定其他目录。public_html必须 与Dockerfile在同一目录。

Docker的特征

  • Docker will watch only one single process. If you need multiple processes, you need to add a monitor like Monit or Supervisor at the top-level to take care of the others. But this is not recommended.

Docker使用注意

  • 避免安装不必要的软件包。

  • 每个容器都只运行一个进程。

  • 最小化层:每执行一个命令,都会产生一个层。

参考

  • 入门级 http://blog.saymagic.cn/2015/06/01/learning-docker.html

  • 入门级 https://www.dwhd.org/20151115_140935.html

  • 入门级 http://www.cnblogs.com/kevinX/p/5458244.html

  • Start (english version) https://scotch.io/tutorials/getting-started-with-docker

  • Start (english version) https://prakhar.me/docker-curriculum/

  • Greate english version https://blog.talpor.com/2015/01/docker-beginners-tutorial/

  • Docker trick https://blog.docker.com/2014/06/why-you-dont-need-to-run-sshd-in-docker/

  • Docker root and non-root http://www.2cto.com/os/201508/432930.html

原文链接

GitHub: http://blog.genesino.com/2016/07/docker/CSDN: http://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/73436708

关注我们

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存