轻松绘制各种Venn图

Online tools

• 2-30 Venn Diagrams (non-proportional)样品多了只是计算各个集合中共有和特有的Item数目。

• http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

• 2-6 Venn Diagrams (non-proportional)最多可以画6种样品的组合

• http://bioinfo.genotoul.fr/jvenn/example.html

• 2-4 Venn (non-proportional)

• http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

• 2-3 Venn (non-proportional)

• http://genevenn.sourceforge.net/

• 3-way Venn (proportional)

• http://www.cmbi.ru.nl/cdd/biovenn/index.php

• 3-way Venn (proportional)

• http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn.cgi

• 4-way Venn (proportional)

• http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn4.cgi

Local tools

• 2-8 Venn Diagrams (proportional, nested, powerful)

• https://github.com/linguoliang/VennPainter 本地下载安装即可适用，便捷的菜单操作。

• 2-6 Venn Diagrams (proportional)

• http://sysbio.uni-ulm.de/?Software:VennMaster

• 3-way Venn diagram (proportional)

• http://omics.pnl.gov/software/venn-diagram-plotter

R packages

• VennDiagram (non-proportional)

• One easy way of using VennDiagram https://github.com/Tong-Chen/s-plot 可以绘制3-5个不同列表的组合，可以提供符合格式的文件，也可以提供计算好的数字。

• venneuler (proportional, may not always right)

Other intersection solutions

• UpSetR: http://www.caleydo.org/tools/upset/ 采用连线的方式展示不同的组合之间共有的和特有的项目，对于特别多的组合尤其适用。单个点表示特有，连起来的点表示共有，相当于venn图中重叠的部分。垂直的柱子代表的是Venn图中的数字。水平的柱子代表对应样品中Item的总数。

• Bubble PLot: http://bl.ocks.org/mbostock/4063269

• ChordDiagram: http://bl.ocks.org/mbostock/4062006