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生信宝典之傻瓜式 (一) 如何提取指定位置的基因组序列
为了一件小事也不得不写程序时,你是否会觉得心里很烦?本栏目旨在分享生物信息分析中的一些小技巧,纯傻瓜式操作,助你事半功倍,心情倍儿爽。
想要提取拟南芥1号染色体,正义链6666-8888位
置的序列?你只需要三步。
第一步,在NCBI上Nucleotide
条目下搜索到拟南芥1
号染色体,点开进入下一步。
第二步,在右边的Change region shown
中,选择Selected region
并输入6666
和8888
,点击Update View
进入下一步。
第三步,点击左边的GenBank
,把格式改成FASTA
,大功告成。
想要提取反义链怎么办?只需再加一步,在右边的Customize view
中,勾选Show reverse complement
,点击Update View
。