中山大学两支本科生参赛队在2023 国际遗传工程机器大赛荣获金奖
2023年11月5日，中山大学生命科学学院的两个团队在国际基因工程机器大赛（International Genetically Engineered Machine Competition, iGEM）全球总决赛中均荣获金奖（Gold Medal）。本次比赛共有来自麻省理工学院、耶鲁大学、哈佛大学、清华大学、北京大学、中山大学等国内外知名学府共400支队伍参赛。比赛于11月2日至11月5日于法国巴黎现场结合线上进行。今年李彩教授作为带队老师，我校生命科学学院学生、中山医学院、生态学院、计算机学院学生组成的两支队伍（SYSU-SLS-CHINA、SYSU-software）赴法国巴黎线下参加比赛。SYSU-SLS-CHINA团队创新性地提出了运用工程化改造的巨噬细胞治疗实体瘤的手段。SYSU-software设计了BioRocket软件工具，利用机器学习和基于结构的蛋白质比对方法系统地从原核基因组中挖掘细胞外收缩注射系统（eCISs），为eCISs未来作为合成生物学研究和临床治疗中的应用奠定了坚实的基础。
成员会场合影
我院学生团队在iGEM赛事上连续数年取得优异成绩，在国际舞台上展示学术风采，体现了生科学子践行“博学、审问、慎思、明辨、笃行”的中大校训，勇于创新，敢于追求学术理想的情怀，更体现了生命科学学院构建“五个融合”人才培养体系的成效，将进一步激励更多的优秀学子学在中大，追求卓越，勇攀高峰！
iGEM大赛是合成生物学领域的国际顶级大学生科技赛事，也是涉及数学、计算机、统计学等领域交叉合作的跨学科竞赛。由美国麻省理工学院于2003年创办，2005年发展成为国际赛事，于每年10月在麻省理工学院进行最终角逐。国际基因工程机器大赛赛况和研究成果每年都受到《科学》、《自然》、《科学美国人》、《经济学人》等顶级学术杂志、英国广播公司等官方媒体的关注并进行专题报道，具有广泛的国际影响力。
SYSU-SLS-CHINA在治疗领域（Therapeutics Village）提出了新型的肿瘤免疫巨噬细胞治疗（SYN-MACRO）方案。
项目简介
癌症是一种恶性疾病，对人类健康构成重大威胁。近年来，免疫治疗方法如CAR-T已经出现，并在癌症治疗方面表现出了很大的潜力。然而，CAR-T在治疗实体肿瘤方面的效果有限。CAR-M疗法的使用也存在一定的局限性。巨噬细胞表现出M1/M2表型。而实体肿瘤中的巨噬细胞往往被"驯化"为M2表型，这些抗炎巨噬细胞进一步促进肿瘤发展并促进癌症进展。考虑到这些挑战，我们团队今年提出了SYN-MACRO（Synthetic engineering macrophage for Hepatocellular Carcinoma therapy，合成工程巨噬细胞用于肝细胞癌治疗）。团队通过改造了巨噬细胞，并设计了一系列基因回路，使它们在识别到肿瘤后转变为M1表型，产生促炎作用，招募其他免疫细胞，并抑制肿瘤发展。SYN-MACRO在为肝癌和其他实体肿瘤提供新的见解和治疗方法方面具有巨大的潜力。
（SYSU-SLS-CHINA项目主页
https://2023.igem.wiki/sysu-sls-china/）
（SYN-MACRO基因通路设计）
（SYN-MACRO项目宣传视频：
https://video.igem.org/w/d4Y6f5G4nEx7Joxc36X4cS）
SYSU-SLS-CHINA团队成员：
指导老师：金寿恒副教授
学生指导：蔡思慧、郑墨酣
队长：周琪皓、陈一博、曾旭明
学生成员：陈佳芃、凌嘉骏、刘雨萱、李向殷、李宗钱、何幸颐、赵凯博、何欣乐、罗珺文、吴昱辰、姜馨雨、郑博、钟仕奇、刘星池
致谢
感谢中山大学生命科学学院的大力支持! 感谢金寿恒副教授为我们项目给予的指导! 感谢崔隽教授为我们提供的宝贵建议和湿实验平台！感谢每一位团队成员的辛勤努力！
SYSU-software在软件与AI领域（Software & AI Village）设计了BioRocket软件工具，利用机器学习和基于结构的蛋白质比对方法系统地从原核基因组中挖掘eCISs。
项目简介
自然界中，原核生物进化出了各种能够与宿主细胞接触的蛋白质传递系统，其中比较有研究前景的一种——细胞外收缩注射系统（eCISs），是注射器样的蛋白质复合物，由原核生物分泌到胞外，将其中运载的蛋白质注入靶细胞。近来有研究揭示了eCISs的可编程潜力，但只有少数eCISs被研究。今年，SYSU-Software设计了BioRocket软件工具，利用机器学习和基于结构的蛋白质比对方法系统地从原核基因组中挖掘eCISs。我们使用我们的算法分析了超过8万个可用的细菌和古细菌基因组，并最终基于序列和结构信息预测了5524个新的eCISs，并通过我们得到的数据探索了其靶向决定域的可编程性。我们进一步进行了湿实验来验证预测数据。我们的项目显著地扩展了eCISs的多样性，尤其加上我们在人类实践和创业方面的工作，为eCISs未来作为合成生物学研究和临床治疗中的应用奠定了坚实的基础。
现场展示项目
项目相关材料
项目介绍网页：https://2023.igem.wiki/sysu-software
BioRocket工具在线平台：http://8.134.141.78/
我们的GitLab：https://gitlab.igem.org/2023/software-tools/sysu-software
项目宣传视频：https://video.igem.org/w/tJEAdj5L6xn96uJbb3GZLo
团队演讲视频：https://video.igem.org/w/8B9J4ue1ZS5QfhuJDP72Pu
大会广场演讲视频：https://video.igem.org/w/m7wBGyTFXnSffRuujm4VhA
SYSU-software团队成员：
指导老师：李彩教授，杨建华教授，冯思源副研究员
生物组：田嘉源，雷如昕，张苇林，徐微，赵乐容，黄文锐，胡柴茂，王思颖，张佳怡，邵静怡，冯瑜辉，张梓妍
数模/程序组：郭一墨，欧子维，魏桂鹏，杨鼎，薛乐翔
美工组：田鑫，郑佳璐，吴雨菲
顾问：李慧勤，蒋帅，刘春蕾，巫景行，李锶铎，王元瑾
致谢
感谢中山大学生命科学学院的大力支持；感谢团队指导老师李彩教授，杨建华教授和冯思源副研究员提供的指导和干湿实验条件；感谢外部顾问江峰研究员提供的宝贵意见；感谢擎科生物对基因合成的支持！
SYSU-CHINA 2024招新预热：
对于即将到来的2024年iGEM比赛，我院实验队和软件队计划优势互补，强强联手，合并一队，以全新的身份SYSU-CHINA 2024共同向2024年的iGEM比赛发起冲击和挑战。
招新推送通知将继续在生命科学学院团学研发布，请大家留意～
排版 涂佳铃初审 周语 熊丽娜审核 李庆泉 张雁审核发布 张斯虹