WBS | Water Biology and Security第一期正式上线！

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中国科学院水生生物研究所创办的开放获取英文期刊Water Biology and Security（ISSN 2772-7351）第一期于2022年2月在Elsevier平台发行。本期共计10篇文章，包括开刊词、4篇长综述文章及5篇研究性论文，作者分布在中国、美国、加拿大、英国、巴西等国家地区，内容涉及水生生物免疫学研究、基因组学研究、生物技术及遗传育种、水域生态研究等各领域。所有文章全文可免费阅读。

本期链接：

www.sciencedirect.com/journal/water-biology-and-security/vol/1/issue/1

同时，期刊首页还开辟了近期会议信息板块及新闻板块，不定期更新涉水领域相关国内外会议信息及科研动态，欢迎各位涉水人员关注WBS期刊的最新进展。

期刊首页：

www.keaipublishing.com/watbs/

Editorial

1. Water Biology and Security – A new open-access platform for multidisciplinary research concerning freshwater and marine ecosystems

Jian-Fang Gui, Robert M. Hughes

中国科学院水生生物研究所桂建芳院士和美国俄勒冈州立大学教授Robert M. Hughes共同执笔，阐述了Water Biology and Security期刊的创办渊源、收录范围、及理念和愿景。

Citation format: Gui, J. -F., Hughes, R.M., Water Biology and Security – A new open-access platform for multidisciplinary research concerning freshwater and marine ecosystems, Water Biology and Security, 2022, 1, 100001. doi: 10.1016/j.watbs.2021.10.001.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2021.10.001

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Review articles

2. Rethinking fish biology and biotechnologies in the challenge era for burgeoning genome resources and strengthening food security

Jian-Fang Gui, Li Zhou, Xi-Yin Li

中国科学院水生生物研究所桂建芳院士团队完成了题为“在基因组资源快速增长和粮食安全日益强化的挑战时代鱼类生物学和生物技术再思考”的长文评述。该评述包括六个部分：（1）重要鱼类谱系的生物学创新和基因组演化；（2）天然多倍体鱼类的演化命运及结果；（3）鱼类驯养和选育的生物学后果；（4）鱼类育种生物技术的发展和革新；（5）鱼类遗传育种生物技术的可用途径和潜能；（6）遗传改良对水产种业和食品安全的贡献。此外，还对水产品在保障全球粮食安全中的作用以及国际上近两年兴起的水产品即“蓝色食品”可以提升国民营养和生产水产品低碳排放的和谐环境性能进行了重点评述。指明了水生生物多样性保护和水产养殖可持续发展的新方向。

Citation format: Gui, J.-F. et al., Rethinking fish biology and biotechnologies in the challenge era for burgeoning genome resources and strengthening food security, Water Biology and Security, 2022, 1, 100002. doi: 10.1016/j.watbs.2021.11.001.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2021.11.001

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3. Bright spots for inland fish and fisheries to guide future hydropower development

William M. Twardek, Ian G. Cowx, Nicolas W.R. Lapointe, Craig Paukert, T. Douglas Beard, Elena M. Bennett, David Browne, Andrew K. Carlson, Keith D. Clarke, Zeb Hogan, Kai Lorenzen, Abigail J. Lynch, Peter B. McIntyre, Paulo Pompeu, Mark Rogers, Alexis Sakas, William W. Taylor, Taylor D. Ward, Zeenatul Basher, Steven J. Cooke

水力发电是河流生态系统和淡水生物多样性面临的最大威胁之一。由来自加拿大卡尔顿大学、英国赫尔大学、美国密苏里大学、美国地质调查局等多国研究团队共同完成的长评论文从水电开发的选址、设计、建设、运营及补偿阶段进行了详细的案例分析，提出了将水电开发纳入生物多样性和生态系统保护的重要性。

Citation format: Twardek, W.M. et al., Bright spots for inland fish and fisheries to guide future hydropower development, Water Biology and Security, 2022, 1, 100009. doi: 10.1016/j.watbs.2022.100009.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2022.100009

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4. Methodology for fish biodiversity monitoring with environmental DNA metabarcoding: The primers, databases and bioinformatic pipelines

Fan Xiong, Lu Shu, Honghui Zeng, Xiaoni Gan, Shunping He, Zuogang Peng

中国科学院水生生物研究所何舜平研究员所带领的团队对一种新型的鱼类监测方法：基于环境DNA（eDNA）的宏条形码测序技术进行了全面的方法学综述。鱼类的皮肤、黏液和粪便等释放到环境水域中可形成游离性的环境DNA，随着生物技术的发展, eDNA方法被广泛应用到水生生物多样性研究中。与传统方法相比, eDNA方法具有灵敏度高、省时省力、对调查的生物对象无损伤等优点, 并可以快速地检测出调查区域内生物种类组成、稀有物种等。eDNA宏条形码技术为鱼类监测评估提供了一种新的技术和方案，本文整理总结了该技术在鱼类多样性检测方面的应用，重点对该技术中的三个关键点，引物、数据库和生物信息分析流程进行了全面系统的介绍和比较分析。另外本文还对eDNA方法与传统方法进行了比较阐述，作者提倡将 eDNA 分析技术纳入未来更多的鱼类生物多样性评估工作势在必行。

Citation format: Xiong, F. et al., Methodology for fish biodiversity monitoring with environmental DNA metabarcoding: The primers, databases and bioinformatic pipelines, Water Biology and Security, 2022, 1, 100007. doi:10.1016/j.watbs.2022.100007.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2022.100007

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5. Progress in research on fish sex determining genes

Ji Chen, Zuoyan Zhu, Wei Hu

中国科学院水生生物研究所胡炜研究员团队发表了题为“鱼类性别决定基因研究进展”的评述。该评述纵览了从哺乳类、鸟类，到爬行类、两栖类，以及鱼类的脊椎动物性别决定研究现状，重点阐述了鱼类性别决定基因的发掘、功能研究、作用机制及调控机制的研究进展。日本青鳉dmy基因是脊椎动物中第二个发现的性别决定基因，也是功能和作用机制研究较透彻的性别决定基因。自dmy发现后的二十年间，已有二十多个鱼类性别基因被发掘出来。尤其近三年来，随着高通量测序与基因编辑等技术的日益进步，为鉴定鱼类性别决定基因并揭示其作用机制提供了重要支撑。以性别决定基因为靶点，通过基因编辑技术已获得了单性的鱼类新种质。鱼类性别决定基因的深入研究和基因工程技术的不断发展，为建立精准高效的鱼类性控育种技术奠定了基础。

Citation format: Chen, J. et al., Progress in research on fish sex determining genes, Water Biology and Security, 2022, 1, 100008. doi: 10.1016/j.watbs.2022.100008.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2022.100008

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Research articles

6. Identification of a TGF-β1 homologue in the large yellow croaker (Larimichthys crocea) revealed its role in regulation of immune response

Xiaofeng Li, Pengfei Mu, Yan Teng, Xiaomeng Li, Yinanzi Wu, Xinhua Chen

福建农林大学陈新华教授团队克隆并鉴定了大黄鱼（Larimichthys crocea）TGF-β1（LcTGF-β1）基因，发现其拥有哺乳类TGF-β1的特征性氨基酸序列。通过对大黄鱼先天性免疫应答的调控研究发现，大黄鱼TGF-β1可以诱导单核巨噬细胞向M2型极化，从而起到维持适当的免疫应答强度和修复炎症部位组织的作用。此外，本研究通过CFSE标记和流式细胞仪检测首次证明LcTGF-β1可抑制原代头肾淋巴细胞中T细胞的增殖，也发现LcTGF-β1可抑制T细胞标志性基因的表达。这些结果表明，鱼类TGF-β1在功能上同哺乳动物TGF-β1相同，既可以调控先天性免疫应答，也可参与调控适应性免疫应答，从而维持适度的免疫应答和免疫耐受。

Citation format: Li, X. et al., Identification of a TGF-β 1 homologue in the large yellow croaker (Larimichthys crocea) revealed its role in regulation of immune response, Water Biology and Security, 2022, 1, 100006. doi:10.1016/j.watbs.2022.100006.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2022.100006

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7. Time-resolved and multi-tissue RNAseq provides new insights on the immune responses of European eels following infection with Aeromonas hydrophila

Fan Xiong, Lu Cao, Jing Xiong, Ya Fang Wu, Wen Shu Huang, Ming Xian Chang

中国科学院水生生物研究所昌鸣先研究员团队通过高通量测序的方法研究了嗜水气单胞菌感染欧洲鳗鲡后不同组织不同时间点的免疫反应变化。对感染组和对照组的欧洲鳗鲡的肠道、肝脏、脾脏分别进行了转录组分析，发现了不同组织中存在较为一致的免疫反应变化。该研究同时还发现了鳗鲡中存在大量物种特异的同源异构体（paralogues），而大部分同源异构体在此免疫反应过程中表达模式一致，暗示了它们在免疫反应过程中的功能一致性。

Citation format: Xiong, F. et al., Time-resolved and multi-tissue RNAseq provides new insights on the immune responses of European eels following infection with Aeromonas hydrophila, Water Biology and Security, 2022, 1, 100003. doi: 10.1016/j.watbs.2021.100003.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2021.100003

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8. Long-term phosphorus reduction and phytoplankton responses in an urban lake (USA)

Yuan Grund, Yangdong Pan, Mark Rosenkranz, Eugene Foster

为降低城市湖泊中的富营养化带来的蓝藻水华问题，美国波特兰州立大学Yuan Grund团队对美国俄勒冈州奥斯威戈湖水质和夏季浮游植物群落的长期变化进行了连续13年的检测，分析了湖泊管理中等温层曝气和添加明矾等手段对水质和浮游植物的影响。结果表明，有效的城市湖泊管理手段使得优势浮游植物从蓝藻转向了硅藻和叶绿素类生物，降低了蓝藻大量繁殖带来的危害。

Citation format: Grund, Y. et al., Long-term phosphorus reduction and phytoplankton responses in an urban lake (USA), Water Biology and Security, 2022, 1, 100010. doi: 10.1016/j.watbs.2022.100010.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2022.100010

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9. Biodiversity of zooplankton in 0–3000 m waters from the eastern Indian Ocean in spring 2019 based on metabarcoding

Xia-Wen Cheng, Lan-Lan Zhang, Fei Gao, Ye-Hui Tan, Rong Xiang, Zhuo-Ya Qiu, Li-Jun He

中国科学院南海海洋研究所张兰兰研究员、谭烨辉研究员和海南大学高菲副教授、华东师范大学何利军教授等所在团队发表了题为“基于DNA宏条形码技术的东印度洋0−3000 m水体中浮游动物生物多样性的空间变化”的研究论文。该项研究利用先进的多联浮游生物分层拖网在东印度洋获取的高质量深海连续分层样品，基于分子生物学方法，发现了作为世界四大永久缺氧区之一的孟加拉湾内浮游动物的群落结构较开放性大洋的显著差异。通过该项研究，不仅提高了印度洋浮游动物生物多样性的认识，而且对其生态功能的深入研究具有重要的科学意义。

Citation format: Cheng, X.-W. et al., Biodiversity of zooplankton in 0–3000 m waters from the eastern Indian Ocean in spring 2019 based on metabarcoding, Water Biology and Security, 2022, 1, 100005. doi: 10.1016/j.watbs.2022.100005.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2022.100005

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10. Freshwater snail and shrimp differentially affect water turbidity and benthic primary producers

Yulun Guo, Peiyu Zhang, Jianlin Chen, Jun Xu

不同习性的底栖动物在生态系统中有互补的功能，维持底栖动物的多样性对于生态系统的健康至关重要。中国科学院水生生物研究所徐军研究员团队通过微宇宙生态系统开展了不同习性的底栖动物对水质和底栖初级生产者的影响的研究。通过两个连续的控制试验，分别探究了（1）铜锈环棱螺和日本沼虾的共同作用和（2）不同生物量的日本沼虾对水质以及底栖初级生产者的影响。研究表明，投放一定生物量的日本沼虾可能是一个很好的控制丝状藻的生物调控方式。

Citation format: Guo, Y. et al., Freshwater snail and shrimp differentially affect water turbidity and benthic primary producers, Water Biology and Security, 2022, 1, 100004. doi: 10.1016/j.watbs.2021.100004.

https://doi.org/10.1016/j.watbs.2021.100004

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*中文翻译仅供参考，所有内容以英文原文为准。

  期刊简介  

《Water Biology and Security》（WBS）是由中国科学院水生生物研究所主办，科爱出版社出版的一本覆盖水生生物多样性与保护、水环境与生态安全、渔业与水产品安全等领域的综合性英文学术刊物。

期刊为OA出版模式，3年内完全免费发表，全文在Elsevier平台开放获取。

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