treeio: 进化树基础类和方法

现在有评论功能了。🍻

上次发表了ggtree版本的plotTree，被大V转发，一下子推特都涨粉了，正所谓传播靠大V，欢迎大家转发到盆友圈😜

言归正传，ggtree代码越写越多，所以我决定把它分成treeio和ggtree，这样子可以把文件解析和树操作等功能与可视化分开，让ggtree专注于可视化，也有利于后续的维护。

treeio提交到Bioconductor，是Martin Morgan老人家review的，他直接说他看了代码，没有comment，直接加Bioconductor。昨天刚加进去，所以Bioconductor的页面还没生成，不过也就在这一两天的事了。

今天把ggtree里的一些文件删掉，移到treeio的代码全部注释掉。正好发现是第888个commit，于是截屏留个纪念。

这两年的时间，好多精力在写ggtree，treeio里大部分功能，其实是两年前圣诞假期写的，那时候拿着笔记本在太平洋装着逼写着代码，因为当时我想着快速（赶在过年前）出一遍paper，像BEAST、CODEML的解析都是那时候写的，过年前也写好了draft，结果不承想，一拖就拖到8月才投稿，审稿一拖就拖到今年8月才接收，现在还没出版，也就是说出版得到明年了！这速度，若不是搞得早，分分种毕业的时候还看不到文章的节奏！

点击阅读原文，直达treeio，现在各种读树，树的操作功能都已经不在ggtree包里了。