无中生有windows版R包

之前帮助高老师实现比对序列的做图，把代码打包为R包seqcombo，方便安装使用。花两小时的作品，发现还有些用户在使用 -，-

之前有人联系我说安装不上，我觉得不应该有这个问题，因为是纯R代码代码，不涉及到编译，源码包安装不应该有问题。但既然有人问，又都是windows用户，我想可以给他们提供编译好的windows包，简化安装过程（这么体贴用户，我都要被自己感动了）。

放在CRAN或Bioconductor上的R包，CRAN和Bioconductor会编译出不同平台的二进制包，但seqcobo放在github上，只有源代码，没有预编译好的包，但没有不是问题，我编译好放上去就行了。

但问题是我没有windows！多年来一直是OSX和linux，MacBook Pro跑Arch Linux，一台iMac跑OSX，我自己根本没有跑windows的机器，所以难为无米之炊，借台机器总是有的，但总不能每次一更新，就拷个代码去别人的机器上打包，再拷回来上传到网上，想想也是蛋疼。

所以没有windows，这事干起来还不太容易，！在想怎么来无中生有生出个windows包出来的时候，我想起了rhub，也是因为没有windows，之前就用rhub来进行windows平台的R check，在把代码push到CRAN或Bioconductor之前，我总会测试没问题了，再提交代码过去，而rhub正好可以给我提供windows平台的检测。

在R check完之后，rhub会把check之前build的包存起来，正是这一点，为我们提供了这无米之炊，这时候我就可以下载它来放到我的repo里，这也算是一个变通的办法。

然而，我要等它check完，再去下载，放到repo，push到github上，动作太多，太繁琐，所以必须写代码让它自动化起来。

于是写了Makefile:

windows:    Rscript -e 'rhub::check_on_windows(".")' addtorepo: windows    Rscript -e 'drat:::insert("../$(PKGNAME)_$(PKGVERS).tar.gz", "../drat/docs")';\    Rscript -e 'drat:::insert(ypages::get_windows_binary(), "../drat/docs");\    cd ../drat;\    git add .; git commit -m '$(PKGNAME)_$(PKGVERS)'; git push -u origin master

我只要make addtorepo一条指令，它就会自动运行传到rhub的windows平台check我的包，check结束后，下载rhub平台编译的包，然后用drat:::insert来把它放到合适的位置，并生成相应的文件（如包的依赖关系、md5sum等），再把它push到github上去。

这里我用了一条ypages::get_windows_binary()指令来检验rhub check是否结束，如果是则把编译的包下载到临时文件，并作为输入传到drat:::insert。

ypages也是一个R包，我用来搞github pages的私人定制包，比如我各种包的主页上那些badge图标，显示下载量、版本号、文章引用数目等相关信息的图标，都是通过ypages自动生成的，没有放出来，所以细节不在这里讲，这里主要介绍一个思路，利用rhub云平台来编译windows二进制包，放入私人repo供用户下载安装，通过makefile自动化这一过程。Makefile才是最通用的可重复性研究工具，你值得拥有。