火视219|Bioo Scientific:二代测序(NGS)建库试剂强势来袭!
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怎么能不说水土养人呢,Texas是美国本土面积最大的一州,总部设在这的Bioo Scientific自2003年成立以来可以说是一路开外挂成长起来的,NIH、NSF、FDA、甚至连美国农业部门都给他拨过款,让他放手去研究创新生物科技方面的产品。
而且Bioo Scientific也超争气,现在多项技术产品都在申请全球性的专业保护。今年4月的时候又获得55万美元奖励用于研究单细胞基因序列科技,简直是个聚宝盆。其产品主要包括各种体内RNA产品,全套的ELISA细胞因子,PCR反应试剂,DNA/RNA抽提试剂盒,以及需要大量技术支持的单克隆或多克隆抗体等。
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让Bioo Scientific这么有底气的核心技术NGS库是基因序列和信息的储存库。NGS技术可以用来测试基因顺序及其排列顺序。而且也很会做生意,对它的利用率超高——49%使用NGS技术进行基础科学研究;32%用于寻找与变异相关的疾病;18%用于癌症研究;仅有1%用于非编码的RNA研究。
他可以提供完整的NGS库预备组合和复用设计,这些设备可以能增加试剂盒Illumina和Ion Torrent测序平台的灵活性与灵敏度,还有储存库的速度。最终加速临床研究,快速推进产业化。
他的的全套技术包括:
(1)整套基因组序列:对某一个人或生物的整个基因组序列的鉴定。
(2)靶向基因测序:使用高度针对性的方法,扩增子面板,从而利于分析特定部位的基因。
(3)SNP基因分型:在基因序的列变异处进行识别。
(4)宏基因组分析:关于非实验室陪养的细菌研究,包括真菌和微型真核生物
(5)表观遗传学:表观遗传学的研究其实是通过化学反应实现的,有计划的激活和停用部分基因组,从而利于研究特定位置的基因。
(6)基因组表达和转录分析:在一个给定的细胞或细胞群对RNA的表达水平进行分析。
要实现上面的这些技术,NGS库的准备套件包括:nextflex™知识库、nextflex™条码适配器和nextprep™核酸分离试剂盒。Bioo Scientific野心满满,目前还打算研究下一代测序,好进一步提高酶的效率,以实现强大的,高品质的测序数据和更低的成本效益。想做生物科技的统治者,下面来看看现在Bioo Scientific手上都有哪些好牌。
也就是RNA干扰,在进化过程中高度保守的、由双链RNA诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。(下图为RNA讲解示意图)
凝胶和低输入偏置减少相结合,创造了降低结扎的错误率和RNAi序列库准备适配器形成二聚体的新方法,最终使降低RNAi的使用量,一句话,帮科学家省钱!
指的是基因的终止子,用于结束一个基因的转录。但是现在比较囧的是,现有的3’端测序的方法大多数真核基因选择性酸化显示(APA),其中RNA亚型采用不同的剪切和多聚腺苷酸化位点(PAS)。更要命的是!这些不同的亚型已被证明代谢方法全然不同,包括稳定性、定位,与翻译.......
DGE的3’端序列分析的发现,将让研究人员能够排列拥有3’端的RNA分子。所以Bioo Scientific DGE的3’端序列分析的出现就跟救星一样,完全解决了3’端标注的错误和不完整性,明显提高了单细胞RNA表达的研究速度,用于研究单细胞生物RNA基因片段是哪些活性,毒素基因是哪些都搞得清清楚楚,方便了一些疫苗的研制。目前试剂盒已经在临床方面产生积极的影响。
因为食品安全意识提高,中国的网民都在吵着说要重新整改所有关于饲料蛋白质含量的检测方法,相比之下,欧盟对在这方面的检测就超苛刻。乙氧基喹啉是目前欧洲常用的饲料添加剂同时也是鱼粉添加剂,能防止鱼粉中的ω-3脂肪酸的氧化,并防止鱼粉在运输和储存过程中自燃。
Bioo Scientific推出的maxsignal®乙氧喹ELISA检测试剂盒(一种蛋白质检测试剂盒),能方便人们对鱼粉、鱼、虾中乙氧基料肉(EQ)残留量快速测定和筛选。
NEXTflex-HT™为Illumina测序单指标的条形码,和上一代相比优势在于大大增加吞吐量。每个包含12台唯一引锁序列,允许双重纠错在PCR技术错误时或测序仪miscalling使样本之间分化时。此外,每对连续的条形码是全色彩对称的,适用于低电平复。
另外,nextflex HT条形码也减了研究人员使用同一套指标连续运行的烦恼,不用担心吸样和样品的串扰这些糟心事儿,有效地降低了实验的失误率。
Bioo Scientific 2015年推出的NEXTflex™ 快速DNA建库试剂盒使得研究人员能够在2小时甚至更少的时间内,从低至1ng的DNA完成适用于Illumina测序平台文库的构建。该试剂盒是基因组DNA、FFPE样品、ChIP DNA以及微量临床样本建库的最佳选择。
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酒香不怕巷子深,现在Bioo Scientific在德克萨斯州科学研究能力较强,业务也很大,在中国也有多家代理商,比如上海迈普生物科技有限公司。上海迈普公司表示,选择代理Bioo Scientific,是因为它的产品更高质量的测序文库、更丰富全面的产品线、更少量的样品需求以及相比别的公司,他的产品灵敏度更高。
不过基因测序也不是国外风景独好,2014年6月30日,国家食品药品监督管理总局经审查,批准了BGISEQ-1000基因测序仪、BGISEQ-100基因测序仪和胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(联合探针锚定连接测序法)、胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(半导体测序法)医疗器械注册。
随后也批准了多个基因检测试剂盒产品。为NGS在临床上的应用提供了产品,并且同年也对测序试剂及仪器的医疗器械分类进行了明确规定,加大对基因测序产业的扶持,鼓励基因测序产业上游产品的研发并加快审批速,或许也表明了CFDA在测序产品上的积极态度。
反观基因测序行业中游渠道以及解读行业,中游的渠道布局在国内已经相对成熟,多掌握在巨头手中,创业公司难以渗透。基因测序解读行业也面临瓶颈,对于大数据分析以及解读自动化都依赖于大量的基因样本库,这也是创业公司难以撼动的。或许试剂以及基因测序的细分领域终端应用才是我国基因测序行业新进入者最后的机会。
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