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伯豪董事长肖华胜:基因芯片技术的未来有许多可为之处

2016-07-06 火石创造 火石创造
摘要

2008年12月16日,上海生物芯片有限公司暨生物芯片上海国家工程研究中心整合旗下系统技术平台、商业化服务体系、高素质服务团队等资源成立了致力于研发外包服务的专业化公司——上海伯豪生物技术有限公司。我们就基因芯片技术与服务的市场发展这一话题,特别采访了现任上海伯豪董事长兼总经理肖华胜博士。

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嘉宾介绍

肖华胜,博士,研究员,毕业于第四军医大学国家人类基因组南方研究中心博士后,后加入上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心。现任上海伯豪生物技术有限公司董事长兼总经理,上海伯豪医学检验所有限公司董事长,上海伯豪医药科技有限公司董事长。 


嘉宾核心观点

一、基因芯片市场份额受到高通量测序侵蚀,专业的基因芯片公司出现被并购的浪潮。

二、芯片技术具有独特性,还无法被完全取代。

三、微流控芯片技术在近十年的发展中,依然没有为基因芯片的商业化发展带来突破。

四、芯片技术的未来是芯片实验室(Lab on a chip)。

五、芯片技术在临床与健康应用方面仍有很多可为之处,市场前景广阔。



火石创造对话肖华胜


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问题一:近期,专业的基因芯片厂家被巨头大规模并购,包括Affymetrix被Thermal Fisher并购、Nimblegen被罗氏并购、Genomic Solutions被Digilab并购等事件,是预示着基因芯片市场开始萎缩,还是巨头看好芯片市场而大举进军?


肖华胜博士


专业的基因芯片公司出现被并购的浪潮,是因为基因芯片市场份额受到高通量测序侵蚀。Affymetrix也同样受到了高量测序对它的侵蚀,虽然该公司拥有很多专利,也有很多美国FDA和中国CFDA认证的产品,但这些产品一般都在第三方检验所使用,且该布局的研究所和医院都已经有相关产品,市场增长率缓慢。


国内芯片公司不是很多,主要以国家发起的为主,如生物芯片上海国家工程研究中心、生物芯片北京国家工程研究中心,以及之后衍生出的芯片公司如北京博奥、上海伯豪等。


基因芯片比基因测序的市场小很多,单独以基因芯片作为唯一业务的公司市场竞争力相对较弱,因此芯片公司多呈现多元化发展,提供多种技术组合,如PCR、基因芯片、二代测序技术及周边相关技术。


火石创造

问题二:二代测序出现后基因芯片是否会被取代?


肖华胜博士


关于这个话题我们在2008年《中国科学》上发表过一篇综述,分析两种技术各自的优势,在不同的领域里也有各自的应用范围。


随着二代测序价格的降低,现在这两种技术的应用重叠度越来越高。基因芯片技术在一些领域逐步被二代测序替代,但是芯片有自己的优势:技术较为成熟,样本处理和数据分析相对测序更加简单、快速,且在快速筛选上有较大优势。


具体应用优势如:在大规模样本的固定位点基因检测速度上有很大优势,在基因表达检测上对中低表达峰度的基因检测可靠性更高、在基因拷贝数变化的研究方面速度较快,成本相对较低。微流控芯片技术的引入可以实现检测自动化和一体化,整体效率有较大提升。


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问题三:基因芯片目前有什么临床应用?当前应用市场份额较大的Illumina公司的技术优点是什么? 


肖华胜博士


基因芯片的应用较广泛,一次杂交可完成对待测样品多种突变位点的筛查,目前主要的应用方向是个体化用药和遗传性疾病。目前基因芯片主要应用于疾病的诊断与治疗和药物研究两大方向, 在疾病的诊断与治疗方面如遗传病相关基因的定位、肿瘤或其他重大疾病易感性筛查、早期诊断、感染性疾病的诊断和耐药菌株检测; 在药物研究方面如新药开发、对药物的毒性评价和调查药物处理细胞后基因的表达情况。经过20年的探索和发展,基因芯片技术已经积累了大量数据、以其快速、准确、高通量的特点推动了生命科学、医学和检验检疫等领域的发展。


Illumina公司目前主要的商业化芯片产品有SNP芯片、甲基化芯片等。SNP芯片主要是对全基因组范围的点突变进行检测,最高可以达到500万个位点,密度非常高。但是该芯片使用范围与全基因组测序重叠,且使用成本较高。甲基化芯片主要是对全基因组范围内的几乎全部甲基化位点进行甲基化状态检测。主要技术原理是在亚硫酸氢盐的处理下,没有甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(T),而甲基化的胞嘧啶则不受影响,这样就可以转化为不同碱基的检测,这款芯片就可以对此进行精确地检测。Illumina最近推出了基于Infinium系列探针的甲基化芯片EPIC BeadChip,芯片从450K升级到850K。


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问题四:您对于微流控芯片的技术发展有何看法?


肖华胜博士


微流体芯片技术发展较为缓慢,2006年Nature有个微流控专刊,十年过去了,很多技术还没有应用到实际产品中。从技术角度来说,光刻技术、生物修饰等技术较为成熟,技术难度可能存在于微流控管道的修饰、平滑、检测物的特异性等问题。从芯片的使用和控制角度来看,还需要其他的技术融入如流体力学、生化反应等,整个系统过程较为复杂,应用仍然较少。


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问题五:上海伯豪公司今后的产业布局如何?


肖华胜博士


上海伯豪公司成立于2008年,是最早做基因芯片及服务的公司,公司于2010年之后逐步建立二代测序平台。当前公司已拥有七大服务平台: 生物样品分析平台、微阵列芯片平台、新一代测序平台、生物标志物平台、分子检测平台、基因编辑平台、生物信息平台。


公司凭借高标准的技术平台和多样化的服务等竞争优势,向国内外企业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案。对于位点数较少的、样本数较多的需求,我们基于基因芯片与PCR技术进行处理;对于高通量的位点、大量样本数的需求,我们基于基因测序技术进行处理。公司拥有高通量筛选平台、低通量验证平台和基因功能验证平台。此外公司还拥有丰富的基因组测序和临床基因芯片检测数据资源。


今后上海伯豪生物有限公司的主要业务分为两块:研发外包业务与临床检测业务。前者面向科技服务市场,后者面向疾病与健康的应用市场。2012年在上海建立了伯豪生物的第一家临床检验所,2016年在重庆建立了第二家临床检验所。当前正在周浦建GMP车间,为基因水平临床产品报证做准备。除了服务以外,我们重点将加强产品的研发和生产,逐步完成从服务向产品+服务的经验模式的转型。


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问题六:公司当前的融资状态如何?


肖华胜博士


当前公司已经完成两轮融资。2012年完成A轮融资,引进欧奈尔和珙桐两家投资基金,加速了公司新一代测序平台、生物标记物筛选验证等平台的建设,并向临床分子检测、科技服务产品等方向拓展。2015年完成团队增持和B轮融资,由上海东富龙医疗科技(300171)出资9000万。当前,研发团队持股24.7%。公司在2015年主营业务收入和融资均超亿元,并且希望能尽快扩大规模,已在筹备下一轮融资。


当前,伯豪公司旗下有五个控股公司,包括上海伯豪医学检验所有限公司、重庆伯豪医学检验所有限公司,上海迅伯生物科技有限公司、上海伯豪医药科技有限公司、上海微矩阵生物科技有限公司。公司在产品研发、临床分子检测和基因检测业务方面全面发力,获批国家首批基因检测技术应用示范中心。


友情提示:嘉宾观点不代表火石创造立场。


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