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火视全球|Bina Technology ——罗氏测序部门的中坚力量

2016-12-14 火视全球 火石创造

拥有150亿美元市场价值的基因研究行业正面临一系列巨大的变化,研究人员从基因测序结果中获得了越来越多的信息,对基因组数据扩展分析的需求越来越迫切。Bina公司准确、快速的大数据分析平台也许能为我们带来真正的个性化医疗时代。

文|王舒浩


公司

产品

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公司名片



公司名称:Bina Technology

创立时间:2011

公司属地:美国加利福尼亚

所属行业:生物技术

公司网址:www.bina.com

公司CEO: Narges Bani Asadi

主要产品与服务:Bina基因组管理解决方案、Bina RAVE和Bina AAiM分析软件


公司简介


Bina Technology成立于2011年,是一家为基因测序的学术和市场转化研究提供大数据平台的私人控股公司。2014年Bina公司被罗氏收购后,整合至罗氏测序部门,继续专注于创新基因分析解决方案的开发工作。


Bina公司拥有由生物信息科学家、计算机科学家和软件工程师组成的跨学科团队,其开发的可扩展综合分析平台使研究人员和生物信息学家能够从基因组数据中获得丰富的信息。Bina公司的产品大大降低的基因组分析的复杂性、时间和成本,加速了个性化医疗科学的发展。


公司CEO




Narges Bani Asadi博士是Bina公司的创始人兼首席执行官,Narges博士在斯坦福大学和加州大学伯克利分校进行了多年的系统生物学和高性能计算的多学科研究,将研究成果与基因组学相结合,建立了Bina公司。她拥有多项技术专利并出版了多本著作。Narges博士在斯坦福大学电气工程专业获得了硕士和博士学位。



公司

产品

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商业模式画布




关键业务


Bina基因组管理解决方案


Bina公司通过改善大数据信息管理技术,为行业领先的测序平台开发构建了一个无缝的端到端基因组管理解决方案,即 GMS解决方案,为精准医疗的实现提供了条件。




当涉及到管理基因组数据时,简单地拼接几个开源工具是不行的。随着数据量的增加,处理数据、团队协作和管理知识库是管理基因组数据的关键。Bina GMS分析平台通过以下四个方面超越了传统基因组数据分析平台:

数据分析——Bina GMS提供准确的、可扩展的和低成本的基因组数据分析;

数据管理——Bina Gms通过安全可靠的技术对基因组数据生命周期进行保护和管理;

团队协作——Bina GMS使用云共享促进多功能基因组研究团队的合作;

知识库管理——Bina GMS将基因组分析结果作为元数据进行存储,以方便在知识数据库中对其进行集成、关联和搜索。


Bina RAVE


Bina RAVE是一款专为研究人员和生物信息学家设计,能够缩短基因组数据分析周转时间,并给出准确、全面的分析结果的经济实用型分析软件。它让生物信息学家能够集中精力规划新的研究或分析,让研究人员可以更快地进行基因组数据的分析。Bian RAVE拥有以下功能:




  • 可以实现全基因组分析、全外显组分析、靶向组分析、正常肿瘤分析和RNA-seq分析

  • 拥有用于比对、变异调用、结构变异检测和表达分析的综合工具包

  • Pipeline加速技术将减少7倍的分析周转时间

  • 界面简单易于理解


Bina AAiM


Bina AAiM是一款为基因组研究人员提供快速、可扩展的NGS数据分析的软件。目前许多基因组注释工具不能够对整个人类基因组进行分析处理,Bina AAiM软件可以轻松、快速地对复杂的全基因组数据、外显子组数据和靶向组数据进行注释。Bina AAiM 拥有以下功能:




  • 提供实时、交互式查询

  • 用户可以使用平台上的20多个商业和私人数据库,包括ClinVar、COSMIC、dbNSFP、1000 Genomes等

  • 定期更新数据库和注释列表

  • 直接使用由Bina RAVE软件提供的分析数据,实现端到端的基因组分析

  • 易于使用的界面设计

合作伙伴


目前Bina公司已经和部分医疗机构和医药企业签订了合作协议,包括斯坦福遗传研究所、威斯康辛医疗中心和阿斯利康公司。


2011年到2013年期间,Bina公司先后与斯坦福遗传研究所、威斯康辛医疗中心展开合作。Bina公司帮助斯坦福遗传研究所分析数百个完整的人类基因组,并将一个人类基因组分析时间缩短到了5个小时。Bina公司也对每个出生在威斯康辛医疗中心的新生儿进行完整的基因分析。


2015年4月,阿斯利康和Bina公司签订了合作协议,成为了第一个加入Bina联盟计划的公司,阿斯利康利用Bina GMS作为企业平台,在三个主要治疗领域:肿瘤、心血管和代谢疾病以及自身免疫疾病方面进行开发工作。


市场和竞争对手分析


Bina Technology的主营业务是采用大数据分析方法分析人类基因序列,他们的分析结果将成为研究机构、临床医生等下游医疗服务行业的基础数据。目前来看,美国已经有超过8000家致力于人类基因组序列分析的企业,然而这些公司在处理基因数据上的能力良莠不齐。


DNAnexus、23andME、Spiral Genetics等公司正通过高级算法和云计算来加速基因组数据分析,让发现疾病的过程变得更快、更容易和更便宜,他们是Bina公司的主要竞争对手,其中DNAnexues公司已经在之前报道过。


23andME是DNA鉴定公司,它可以帮助个人通过DNA分析技术和网络互动工具了解自己的基因信息和93种疾病的风险因素。


Spiral Genetic是一家基因组数据分析公司,它主要帮助研究人员快速分析DNA序列数据。该公司表示可以在三个小时之内分析一个完整人类基因组序列。


虽然这些基因分析公司都能够采集人类基因序列信息并加以应用,推断出客户患上何种疾病的概率,但由于很多疾病和基因的关系并未完全被明确阐明,导致其中很多数据并不可用。Bina Technology 希望填补这一空白,成为一个平台、一个数据库,让研究型大学、医药公司、医疗机构等下游机构能够在他们提供的数据之上,进一步摸清基因变异与各种病症之间的关系。


融资情况


截止到目前,Bina公司共经历了4轮融资,从8位投资者那里获得了约1030万美元的融资。其中,2011年5月,Bina公司完成了101万美元的A轮融资,主要投资者为Bobby Yazdani、 Signatures Capital;2013年3月,Bina公司完成了由Sierra Ventures领投的625万美元的B轮融资。



公司

产品

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Bina Technology公司使用的是目前基因组数据分析算法中最好的科学算法之一,而且他们还利用了多个分析工具对数据进行辅助分析,因此其提供的数据精度比由单一分析工具更高。


Bina公司的这项技术使得它们在The DREAM Challenge第五阶段中取得了插入缺失检测第一名和身体SNV检测第二名的成绩。The DREAM Challenge是一个由国际癌症基因组联盟(ICGC)、癌症基因组图谱、Sage Bionetworks共同举办的一个开放性的项目,它希望将不同学科的科学家联合起来来解决生物学中的重要问题,并进一步了解基因组变化和癌症突变之间的联系。


Bina的研发团队基本上都是来自斯坦福大学和加州大学伯克利分校的博士,研究方向为大数据或生物信息。由他们开发的一些开源工具、算法发表在了Nature、Bioinformatics等顶级期刊,并得到了同行的广泛认同。但是在云存储成为主流存储方案的今天,如何保证信息的安全是Bina和一些基因组数据分析公司不得不面对的一大难题。


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