今日Nature: 如同SARS, 中国致命猪瘟病毒又源自蝙蝠!
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导 读
2002年,冠状病毒(SARS-CoV)引起的非典型肺炎病例在中国南方出现,导致8000多人感染、774人死亡(相关报道见:http://www.who.int/csr/sars/en/)。SARS事件证明了冠状病毒能够在人体内引起致命疾病。之后相关研究将蝙蝠鉴定为SARS冠状病毒的储库,显示这种病毒很可能起源于蝙蝠,进一步表明蝙蝠是高致死性人畜共患病毒的重要宿主,譬如亨德拉、尼帕、埃博拉病毒和马尔堡病毒。
2016年-2017年间,在距离SARS病例出现地点约100公里的清远市养猪场,爆发了一系列致命猪病疫情。病猪出现了严重的急性腹泻、急性呕吐,导致新生仔猪体重迅速降低,受感染的仔猪在发病后2-6天死亡,受感染的母猪只有轻微的腹泻,大多数母猪在两天内恢复。其中,五天或更小的仔猪的死亡率高达90%,八天以上的仔猪死亡率降至5%。
今天,《自然》在线发表了我国学者的最新相关研究。石正丽、童贻刚、马静云、王林发及研究团队发现了导致这种猪急性腹泻综合症(SADS)疫情的源头——一种新型的HKU2相关冠状病毒,它的基因组与一种蝙蝠携带的冠状病毒的基因组相似。这种蝙蝠冠状病毒是研究者于2016年在某个养猪场附近的蝙蝠洞穴里分离出来的。
2016年,猪病疫情爆发后,工作人员在死亡仔猪的肠内发现了猪流行性腹泻病毒(PEDV,一种冠状病毒)。2017年1月12日以后,疫情仍在加剧,然而却无法在死亡仔猪中检测到PEDV,同时也未检测到其他病毒,表明引起疫情的是一种新型致病病毒,研究者将其称作SADS-CoV。随后,在该农场20-150公里范围内的另外三个养猪场内也出现了类似疫情。截至2017年5月2日之前,这种疾病在这四个农场共造成24693头仔猪的死亡。之后疫情得到隔离控制。
为了鉴定潜在的病原体,研究者收集了患病仔猪的小肠样品,通过使用新一代测序(NGS)技术进行宏基因组学分析。结果显示,在四个农场的样本中均检测到了序列相同的SADS-CoV病毒。
通过针对核衣壳基因的qPCR检测,研究者在患病仔猪和母猪中检测到SADS-CoV,在健康猪及未出现疫情农场的样本中没有检测到该病毒。结果显示,SADS-CoV病毒在仔猪中的复制率高于母猪。与其他猪肠道冠状病毒一样,该病毒具有侵袭小肠组织的特异倾向。
通过血清学检测,研究者发现,恢复期的母猪感染后三周内SADS-CoV呈阳性。为了查明是否存在人畜共患的可能性,研究者使用相同的萤光素酶免疫沉淀系统方法,分析了35名与病猪紧密接触的农场工人的血清样品,并没有检测到该病毒。
为了明确病毒的传播路径,研究者筛选了2013年至2016年期间在广东省七个不同地点收集的591个蝙蝠肛拭子,发现有9.8%的样本含有类SADS-CoV病毒,这些样本来自同为SARS冠状病毒天然宿主的菊头蝠。通过比对蝙蝠携带的病毒基因组与SADS-CoV基因组,研究者发现二者具有96%至98%的相似度。
为了明确病毒的进化关系,基于病毒基因组的系统发生分析结果显示,蝙蝠携带的病毒具有高度的遗传多样性,与其宿主之间有强大的协同进化关系。
蝙蝠来源病毒和SADS-CoV病毒的基因组及系统发生分析
然而,分子时钟分析未能建立基因组序列分歧与采样日期之间的正向关联。因此,研究者推测该病毒可能多次从蝙蝠传给猪,也可能一次传给猪之后经过基因重组扰乱了分子时钟。
为了进一步明确疫情确实是由该病毒导致,研究者进行了动物感染实验。其中,一项实验是将感染了SADS-CoV的肠组织匀浆应用于实验仔猪,另一项实验是用培养的SADS-CoV分离株感染健康仔猪。结果显示,受感染的所有仔猪均出现水样腹泻、体重迅速减轻和肠道损伤(实验终止后安乐死后测定)。组织病理学检测显示,受感染仔猪中的小肠绒毛显著萎缩,小肠上皮细胞中观察到了病毒蛋白。
受SADS-CoV病毒感染的猪小肠的病理学检测结果
随着类似传染疾病的不断爆发,该研究表明,理解蝙蝠和其他野生动植物携带的病毒多样性相当重要。相关部门应积极监控蝙蝠及其他野生动物中的病毒性感染,尤其是在新兴疾病出现的热点地区(譬如中国南方),对兽医卫生、公共卫生和全球经济具有重要意义。
采访实录
以下是石正丽、童贻刚、马静云、王林发四位作者访谈内容。
问:目前很多疫病初期症状很相似,我们如何能准确判定该疫情有潜在高危性呢?
答:目前来看,新发传染病的检测需往前移,建立很好的预防检测机制,并且这个工作需要全球范围科学家一起合作去了解自然界动物携带的病毒,评估传染到人类的可能性,早期建立预警和预防。这次能这么快也得益与前十年的积累,目前也有很多病毒学的研究计划,旨于尽早建立模型,进行长期的跟踪监测。
问:本次发现的冠状病毒的传播途径是什么呢?
答:由于病毒在肠道里面增殖,所以主要是粪便污染传播。疾病暴发后在猪场周围的确观察到有蝙蝠飞翔,这些猪场是建在山丘傍边,推测附近有蝙蝠聚集地。
问:为什么该病毒在空肠部分更集中繁殖呢?
答:因为这个部位的病毒受体表达量是最多的。
问:我们知道这一次疫情的发现和控制速度非常之快,那么请问从历史上讲一下这一次的速度相对快了多少?
答:我们可以和SARS做比。这一次发现很大的意义在于其病发动力学和SARS很接近,也是从蝙蝠来的。SARS从2003年10月发现病例到找到病原经历了5、6个月。直到多方合作发现病毒来源于蝙蝠已经到了2005年,跨度达到18-24个月。这一次从看到病例后,2月内我们就搞清楚了所有问题,2003年到2017年,这是将近10倍的增幅。这得益于四个方面1)团队合作和团队之间的了解,才能很好的技术互补;2)备战意识,战胜传染病就像战争反恐,在还未扩大时及时防控;3)人才的培养,年青一代地贡献也非常重要;4)先进技术的利用,建立新的研究方法,及时控制疫情。
问:SARS的源头是蝙蝠,这次的源头也是蝙蝠,有什么内在原因吗?如果食用了带该病毒的猪有什么后果?
答:这与蝙蝠是唯一一种飞行的哺乳动物有关,为了适应飞行,他的很多免疫防御系统为了适应飞行变异的和普通陆地上的哺乳动物不一样了,他的免疫系统可以与很多病毒共生。这是一个很大的命题,还有很多研究正在进行中。目前这个病毒还不能感染人,理论上对人无害。其次高温烹调可以破坏病毒,所以人食用了不会有什么风险。目前血清学证据也还没发现人能感染该病毒,但是细胞学上看还是能感染一些人的细胞,所以还是有一定风险感染到人的。
问:病毒的变异非常快,对于疫苗和药物的研发等速度的不匹配有什么解决方式吗?
答:这个有两方面,1)从病毒方向看,我们需要找到广谱的抗病毒机制,2)我们需要研究机体对病毒的反应,其实很少有病毒杀了我们,都是自己杀自己,要研究机体的免疫反应,研究的药物可以针对机体进行,达到感染不发病的目的。就像蝙蝠的免疫一样,携带而没有发病。
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