Genome Biology | 9月内容更新
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期刊新闻
Genome Biology推出了Evolutionary Genomics最新特辑，内容包括该领域顶尖研究人员的研究结果和科研方法。欢迎扫码了解更多：
Genome Biology和 BMC Biology即将联合推出Microbiome Biology特刊，该特刊目前正面向广大科研人员征稿。欢迎扫码了解更多：
主题论文
饥饿和水淹下水稻组蛋白中赖氨酸丁酰化，巴豆酰化和乙酰化的动力学和功能相互作用
Zhou等人发现了大量组蛋白位点，这些位点在内外信号刺激引发的不同构象变化中发挥作用。 这些构象变化组合能够对基因表达进行精细调控，从而实现植物的适应性改变。
doi: s13059-018-1533-y
复杂性状和死亡的表观遗传预测
Marioni等人使用DNA甲基化（DNAm）和遗传预测因子预测影响死亡率的特征和疾病。他们发现DNAm预测因子与导致健康以及死亡的生活方式相关。
doi: s13059-018-1514-1
基于meta分析的结直肠癌亚型转录组的连续性
通过分析多个结肠直肠癌（CRC）转录组数据库之间的共表达模式，Ma等人制定了CRC转录组亚型评分机制以用于更精确地区分患者的亚组。
doi: s13059-018-1511-4
综述
研究作物进化的基因组方法
Genomic approaches for studying crop evolution
doi: s13059-018-1528-8
Schreiber et al.
基因组学时代生物多样性的保护
Conservation of biodiversity in the genomics era
doi: s13059-018-1520-3
Supple and Shapiro
亮点研究
平行选择驯化基因以加速作物改良的优势
The advantage of parallel selection of domestication genes to accelerate crop improvement
doi: s13059-018-1537-7
Rendón-Anaya and Herrera-Estrella
不断发展的CRISPR条形码工具盒
The continuously evolving CRISPR barcoding toolbox
doi: s13059-018-1541-y
Gaj and Perez-Pinera
会议报告
2018年基因组生物学会议解读
Insights from the 2018 Biology of Genomes meeting
doi: s13059-018-1542-x
Oak and Plan
不同的模型系统揭示了减数分裂的共同原则
Diverse model systems reveal common principles of meiosis
doi: s13059-018-1527-9
Borek and Marston
研究
对195个DNA甲基化组的综合分析揭示了部分甲基化结构域的共有和细胞特异性特征
A comprehensive analysis of 195 DNA methylomes reveals shared and cell-specific features of partially methylated domains
doi:s13059-018-1510-5
Salhab et al
调控植物RNA沉默通路以提高CRISPR / Cas9系统的基因编辑效率
Manipulating plant RNA-silencing pathways to improve the gene editing efficiency of CRISPR/Cas9 systems
doi:s13059-018-1529-7
Mao et al
LPS刺激下小鼠树突细胞内的染色质修饰
Waves of chromatin modifications in mouse dendritic cells in response to LPS stimulation
doi: s13059-018-1524-z
Vandenbon et al
由于基因结构的进化所驱动的动物转录组中外显子跳跃度高的缘由
Origin of exon skipping-rich transcriptomes in animals driven by evolution of gene architecture
doi: s13059-018-1499-9
Grau-Bové, Ruiz-Trillo and Irimia
DNA固有曲率降低导致突变增加
Reduced intrinsic DNA curvature leads to increased mutation rate
doi: s13059-018-1525-y
Duan et al
选择性剪接将组蛋白修饰与干细胞命运决定联系起来
Alternative splicing links histone modifications to stem cell fate decision
doi: s13059-018-1512-3
Xu et al
大豆驯化和改良过程中的DNA甲基化的足迹
DNA methylation footprints during soybean domestication and improvement
doi: s13059-018-1516-z
Shen et al
DNA复制时机及链不对称性会对突变特征分布造成影响
Mutational signature distribution varies with DNA replication timing and strand asymmetry
doi: s13059-018-1509-y
Tomkova et al
基因组组织和染色质分析发现转录层面胰岛素样生长因子信号转导下调可作为发育中B细胞衰老的标志
Genome organization and chromatin analysis identify transcriptional downregulation of insulin-like growth factor signaling as a hallmark of aging in developing B cells
doi: s13059-018-1489-y
Koohy et al
方法
BayesCCE：可在无参考情况下通过DNA甲基化程度估计组织细胞组成的贝叶斯框
BayesCCE: a Bayesian framework for estimating cell-type composition from DNA methylation without the need for methylation reference
doi: s13059-018-1513-2
Rahmani et al
可以通过模拟肿瘤纯度的变化从异质肿瘤基因表达数据确定癌症表达数量性状基因座（eQTL）
Cancer expression quantitative trait loci (eQTLs) can be determined from heterogeneous tumor gene expression data by modeling variation in tumor purity
doi: s13059-018-1507-0
Geeleher et al
使用单接头和环化方法减少miRNA的测序偏差
Decreasing miRNA sequencing bias using a single adapter and circularization approach
doi: s13059-018-1488-z
Barberán-Sole
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