科研新人必读：十招教你如何快速通过文献关
导语
再过一个月，又有一批研究僧怀揣着拯救人类的“包袱”跳进科研这个坑了。
哦，不对不对，该积极起来。作为科研新人，导师和师兄师姐嘱咐你的第一句话就是：一定学会看文献，养成看文献的习惯。
今天要解决的是科研新人第一关：“怎么找到你需要的文献”；如何选择自己该读和值得读的文献以及阅读文献的正确打开方式。
恩，没错，啃文献是科研工作的第一道关，小编怎么忍心看着一脸懵逼无从下手的你们而不管呢？来，跟着小编一起来闯科研第一关吧！如果您是导师，师姐或师兄，将此文转发给你身边的新人吧，帮你省很多口水。
1
文献检索篇：Pubmeb为首的检索3巨头
看文献，第一步是要找到文献，这时候就要用文献检索工具了。
检索头牌：Pubmed
Pubmed作为美国国家医学图书馆所属的国家生物技术信息中心开发的一款论文搜索引擎，凭借其海量的文献数据和简便快捷的搜索方式，成为了网上使用最广泛的生物医学方面的文献搜索工具。我们可以通过最简单的在标题和摘要中搜寻相关的关键词或相关公式，来寻找相关的文章。
pubmed相关使用方法，可以查看解螺旋往期文章。
用之不易的Google学术
这个其实并不能算是文献检索工具，但其有个很大的特点就是能够对全文进行搜索，而不是像上面说的那两个只是搜索标题和摘要。因此当要搜索事实型依据的时候，比如，要搜索“某病的发病率为36%”这样的出处，在摘要中可能没有具体的数据，所以需要google来进行全文搜索。
Google学术的功能还是挺强大的，不过在天朝却被封了，要是想用还得翻墙。
关联检索：Web of Science
这个方法比较适合研究机构，因为Web of Science的数据库是要收费的，但其搜索引擎比Pubmed更高级，不但能够限定文章的学科，还能限定作者的国籍单位等等，非常好用。值得一提的是它里面的逻辑连接词比Pubmed多了一个很实用词——Near，这个能在相邻的两个句子中寻找关键词。比方说要搜索高血压和糖尿病的关系，如果使用一般“AND”来连接，可能会出现头一句是说的糖尿病，然后结尾出来个高血压，其实并无联系。但用“Near”的话，由于两个词之间的距离被限定了，因此相关的概率也会高的多。
中文检索：万方，知网，维普等
基本是中文文献，在google上找不到的话可以来这里试试。
2
文献下载篇：免费是王道
看文献少不了要下载全文，很多精彩论文却被挡在了收费门外，甚是不爽。“窃书不算偷”，如果有些工具可以帮助你免费浏览和下载文献，节约的不仅仅是钱，更重要得是提高了效率。
免费下载首先要知道就是sci-hub了，深谙这个道理的俄罗斯的女神经学家Elbakyan，她在2011年创办了一个网站——Sci-Hub，梦想是要通过这个网站，将世界上所有需要收费阅读的知识，免费提供给需要它们的人。而且她也真做到了，目前Sci-Hub收录了4700万篇学术文章，但是这个网站是“非法”，常常被“封禁”，不过它的生命力依然顽强，为了反“封禁”，网站采取了游击战的方式——换IP地址。现在还有人为了方便中国学者，整合“Sci-Hub中国版”。具体怎么使用，网上有很多文章教你怎么使用。
有时sci-hub实在无法开工了，怎么办？别慌！还有这15个免费文献下载神器
1、PMC（PubMed Centeral）
网址：http://www.pubmedcentral.org/
美国NCBI（美国国家生物技术信息中心）建立的数字化生命科学期刊文献集，现提供50余种生物医学期刊免费全文。Pubmed官方系统中，将免费的全文集中在此，查pubmed同时，就能查看PMC中的免费全文。常规来说，PMC中内容已相当全面了。
2、PLoS（Public Library of Science）
网址：http://www.plos.org/
PLOS是一家由众多诺贝尔奖得主和慈善机构支持的非赢利性学术组织，旨在推广世界各地的科学和医学领域的最新研究成果，使其成为一种公众资源，科学家、医生、病人和学生可以通过这样一个不受限制的平台来了解最新的科研动态。PLoS出版了8种生命科学与医学领域的期刊，可以免费获取全文，比较具有影响力，Plos系列的期刊目前都已被SCI收录。虽然期刊数量不多，但是文章总体数量相当庞大。
3、SRP（Scientific Research Publishing）
网址：http://www.scirp.org/
Scientific Research Publishing（科研出版社，简称SRP）是一家国际综合性开源学术期刊出版机构。目前已有国际开源英文期刊近三百本，所有期刊都是开源的（OpenAccess，或称开放存取， 简称OA），可免费下载所有期刊全文，所有期刊均回溯至创刊。多数期刊已被CAS，EBSCO，CAB Abstracts，ProQuest，IndexCopernicus，Library of Congress，Gale，CSP等数据库全文或摘要收录。
4、OALib（OpenAccess Library）
网址：http://www.oalib.com/
Open AccessLibrary（OA图书馆）通过提供高质量的文档和快速响应的服务器，致力于为学术交流和进步做贡献。为大家提供200多万篇学术文章，这个数字估计在不久的将来还会增加。这里很多内容与PMC交叉。不过会收录部分没有进入pubmed的免费全文。
5、DOAJ （Directory of Open Access Journals）
网址：https://doaj.org/
DOAJ（Directory of Open Access Journal），免费的全文科技学术期刊。由瑞典的隆德大学图书馆Lund UniversityLibraries设立于2003年5月，从最初的350种期刊开始，现有2752种期刊，其中830种可以全文搜索。目前有140307篇文章。是个很好的专门OA期刊文献检索系统，但不包括预印本资源。该系统收录期刊的文章都是经过同行评议或严格评审的，质量高，与期刊发行同步，是做研究的好帮手。
6、Annual Reviews
网址：http://www.annualreviews.org/
美国Annual Reviews出版社是一家专注于出版权威综述期刊的非盈利出版机构，它出版的AnnualReviews系列是引证率最高的出版物，所有期刊在其相应领域均排名前十。
7、kl ArXiv
网址：http://arxiv.org/
ArXiv是属于CornellUniversity的非盈利教育机构，面向物理学、数学、非线性科学、计算机科学和定量生物学等学科提供16种免费电子期刊的访问。不需翻墙，而且速度较快。
8、CERN Document Server
网址：http://cdsweb.cern.ch/
主要覆盖物理学（particlephysics）及相关学科，提供360,000多篇全文文献，包括预印文献、期刊论文、图书、图片、学位论文等等。不需翻墙，速度较快
9、Nature
网址：http://www.nature.com/
2014年12月，《自然》（Nature）宣布了开放所有研究论文，包括旗下48个杂志，可惜不能免费复制、打印或下载。但仅仅是在线看，但也是非常大的福利！
10、Science.gov
网址：http://www.science.gov/
美国“科学”网站收录内容以研究与开发报告为主，所有的信息均免费使用，也不必注册，但是通过这些站点链接的有些信息是限制使用或有条件使用的。
11、Socolar
网址：http://www.socolar.com/
Socolar开放存取一站式检索服务平台是一个旨在为用户提供OA资源检索和全文链接服务的公共服务平台，由中国教育进出口公司管理。该平台是中文网页，收录了6000多种来自互联网的OpenAccess期刊、仓储等学术资源信息，提供一站式检索和链接服务。读者需要注意的是，链接到最后是否获取全文，取决于平台链接的有效性，用户网络是否允许境外访问两个因素。
12、cnpLINKer
网址：http://cnplinker.cnpeak.com/
cnpLINKer中国链接服务是由中国图书馆进出口总公司开发并提供的国外网络检索系统。目前共收录了国外50多家出版社的12000余种商业期刊，14000多种Open Access，900万篇文摘数据和全文链接服务，400多家OPAC信息，并保持时时更新。
除此之外，还有几个大学电子图书馆是可以利用的：
13、香港科技大学图书馆
网址：http://repository.ust.hk/dspace
包括香港科技大学的学术论文、学位论文、研究报告等内容，均可免费获取全文。访问速度：不需翻墙，速度较快
14、加利福尼亚大学国际和区域数字馆藏
网址：http://repositories.cdlib.org/escholarship/
加利福尼亚大学国际和区域数字馆藏研究项目。EScholarshipRepository主要提供已出版的期刊论文、未出版的研究手稿、会议文献以及其他连接出版物上的文章1万多篇。
15、剑桥大学机构知识库
网址：http://www.dspace.cam.ac.uk/
由CambridgeUniversityLibrary和University ComputingService维护，提供剑桥大学相关的期刊、学术论文、学位论文等电子资源。速度很快。
3
文献管理篇：Endnote 和它的七个小伙伴
说起文献管理，大天朝的小伙伴们首先默认想到Endnote，Endnote是一款功能强大的文献管理软件，可以非常方便地在word中插入所引用的文献。Endnote对英文文献的兼容性好，并且可以满足将中文文献插入word中， 是最经典的文献管理软件。
除Endnote 以外的7个文献下载软件
但在软件领域，它可不是独领风骚，一家独大，在国际科研界，数得上名号的还有另外七个软件：colwiz、F1000Workspace、Mendeley、Papers、ReadCube、RefME和Zotero。JEFFREY M. PERKEL在Nature上比较了这几个软件的核心功能，不想被Endnote挡住自己渊博知识储备之路的小伙伴们可以一探究竟。
这8个软件，有的擅长简化浏览和构建文献库流程，有的则擅长创建文献目录、通过共享工作空间或者推荐文献实现团队的协助合作，可谓各有所长。只是，F1000Workspace和Papers都是明摆着要给钱的，其他软件虽然某些功能受限，在开放那些免费功能已经够我等屌丝捯饬很久了。
每一个软件的存在都是为了帮助研究人员管理下载后杂乱无章、哪里方便存哪里、每到用时找不到的那些PDF文件。你说好不容易下意识的建立了一个文献文件夹吧，一打开简直爆满，每次下载的时候都重命名然后根据领域或者研究对象归类文件夹么？
如此细心活儿，臣妾做不到啊！好在参考文献管理软件可以通过索引电脑硬盘来帮你解决一派混乱的局面。特别是当你把一个PDF文献拖拽至应用软件窗口，会促发软件识别文献的DOI或者标题，从在线的服务器检索相关数据（比如标题、关键字和文献作者）。
4
下载后的文献怎么命名更高效
下载后的PDF文献很多很杂，怎么管理这些文献用起来方便呢？给这些PDF文件命名是门学问。根据文章题目？文献的标题大多很长啦，当你要找一篇文献的时候，你要一个一个点么？
那么，今天就要介绍一种高效的PDF命名方案，小伙伴不妨参考参考。
这个方案需要借助Endnote,在网上看到“心仪的”paper，不只要下载PDF，还要将文献导入Endnote。虽然工序是多了一道，但为了日后方便查阅，这是不可忽略的动作。这样文件里有一个pdf文件，EndNote里则对应着一个文献记录。
PDF文件的命名原则：选择能够唯一标识一篇paper的最少信息组合来做文件名。比较好的方式就是：期刊名缩写+卷号+首页。其他信息就免了。例如：J. Appl. Phys. 104 091901.pdf
这样的话，不需要看到文件名就大概知道这篇文章讲什么。为什么？因为文件夹里每一个PDF在EndNote里都有记录，在EndNote里浏览标题，遇到想看全文的，根据记录的期刊名、卷号和首页，就自然能在文件夹里找到相应的pdf文件。就算有两千多个文件，按Name排序，也能很快找到。
如果你在网上看到一篇文章，且感觉似曾相识，是不是已经下载过呢？这时通过EndNote就能很快查出来，设置文献在EndNote里排序方式，可以按Journal Name、Year、Volume、Page等进行排序。按Journal Name排有利于检查一篇paper你是否已经有了。按年份排则有利于写综述之前的文献阅读，方便你撰写最新的研究进展。
5
让文献主动找上门
每次检索某些热门领域的最新文献都麻烦的很，要定期去各大数据库或者杂志网站输入关键字后自己慢慢筛选，你说烦不烦！要是文献能主动送上门那才是一桩美事，别说，还真的可以，下面有两种“一劳永逸”的方法：
文献鸟Stork
文献鸟Stork是一款简单易上手的文献订阅工具，只要你把所有想跟踪的主题提炼出关键词，或者领域内大牛的人名输进去，就坐等通知吧！每天Stork会帮助你自动搜索然后把结果发给你，让你第一时间知道所关注领域的新文献，要是一次检索出的文献过多，Stork就会把每篇文章对应期刊的影响因子用颜色标记出来（颜色越黄，影响因子越高），帮你快速选择最值得阅读的文献。
首先在浏览器中输入网址Storkapp.me，界面出来后输入邮箱然后点击“sign up for free”：
网站会给你邮箱发链接设置密码、用户名等等，这里就不在赘述了，然后跳转到主页：
每输入一个关键字点击一下add，小伙伴们有没有注意到上图下半部分的Examples，是告诉你具体的关键字规则，比如输入stroke thrombolysis的意思是只要文献中包含stroke和thrombolysis，“stroke thrombolysis”则是把两个单词当成一个整体的短语进行搜索；你想要找Nature杂志的最新文献，不想附带的把只要包含了nature单词的文献都搜索出来的话，就在nature后面加上[Journal]即可，相信大家都是可以看懂的。这里添加了lncRNA、microbiota、CRISPR三个关键字，点了即时发送：
立马就收到邮件了！每个关键字都分paper和Awarded Grants，当然我们只关心paper啦！除了标记出影响因子，有免费全文的也会给予提示，没有免费全文的当然就用神器sci-hub（sci-hub.zz）了。
Pubmed文献订阅
Pubmed有订阅文献的功能？当然了！不过要提前注册下，在首页的右上角：
激活用户后，我们回到pubmed搜索，还是以CRISPR为例，点击search后，搜索框下方会出现create alert，点击后跳转到my NCBI页面，会询问你是否愿意接受CRISPR相关新文献的订阅推送，可以选择频率每月/每周/每天推送：
点击保存就可以坐等文献飞送到你眼前了。
6
四类必读文献
首先以下四种文献是需要阅读，且存在由浅入深的关系。
1.本领域核心期刊的文献——熟悉领域
不同的研究方向有不同的核心期刊，这里也不能一概唯IF是论了。当然，首先你要了解所研究的核心期刊有哪些，这个就要靠学长、老板或者网上战友的互相帮助了，挑选出几本价值高的作为备选。
2.本领域牛人或者主要课题组的文献——抓重点
每个领域都有几个所谓的领军人物，他们所从事的方向往往代表目前的发展主流。因此阅读这些组里的文献就可以把握目前的研究重点。那么，我怎么知道谁是牛人呢？这里我个人有两个小方法。
第一是在ISI 检索本领域的关键词，不要太多，这样你会查到很多文献，而后利用ISI 的refine 功能，就可以看到哪位作者发表的论文数量比较多，原则上一般发表论文数量较多的人和课题组就是这行里比较主要的了。
第二分方法，就是关注本领域规模较大的国际会议，看一看到关于会议的invited speaker的人，做邀请的报告人一般来说都是在该行有头有脸的人物了。
3.高引用次数的文章——追经典
一般来说高引用次数（如果不是靠自引堆上去的话）文章都是比较经典的文章，要么思路比较好，要么材料性能比较好，同时其文笔应该也不赖的话。多读这样的文章，体会作者对文章结构的把握和图表分析的处理，相信可以从中领悟很多东西的。
4.研究方向相近的文献——找同类
最后就是当你有了一定背景知识，开始做实验并准备写论文的时候需要看的文献了。首先要明确一点，你所做的实验想解决什么问题？是对原有材料的改进还是创造一种新的材料或者是新的制备方法，还是采用新的表征手段或是计算方法。明确这一点后，就可以有的放矢查找你需要的文献了。而且往往当你找到一篇与你研究方向相近的文章后，通过ISI 的反查，你可以找到引用它的文献和它引用的文献，从而建立一个文献树，更多的获取信息量。
7
不经过整理归类的文献
就不是自己的文献
很多时候我们下文献很盲目，好不容易下下来，却发现不是自己想要的，浪费时间又浪费磁盘空间，那么怎么快速识别是不是你想要的文献呢，告诉你一个比较简单实用的方法——“三点识别法”：
前言和最后一部分：一般这部分都是提出作者为什么要进行这项工作，依据和方法。
图表：提出采用的表征方法以及性能变化
结论：是否实现了既定目标以及是否需要改进
8
50字总结
精读一篇文献需要很长的时间，可以先尽可能用50 个字左右来归纳文章，说白了就是：
文章的目的（如改进某个性能或提出某种方法）＋表征手段（如XRD，IR，TEM 等）＋主要结论（如产物的性能）。
当你按照这个方法归纳整理几十篇文献后，自然会有一个大致的了解，而后再根据你的笔记将文献分类整理，当你在写论文需要解释引用时再回头精读，我觉得这样会提高效率不少。
9
文献阅读的正确姿势
以前拿到一篇新的文献，喜欢直接闷头苦看，谁要是这中间找我，都觉得我一副苦大仇深仿佛男朋友出柜了的表情。后来渐渐吃了不少苦头，总是没过两三天就把看好的内容还给杂志了，才悟出来看文献要带着问题一边思考一边研读。
看完思考文献还没有解决的问题？即文献的减分项，机制是不是做的不透，创新性是否不足。要是自己接着此方向继续做，哪些是在我所在工作条件下可以做的，哪些必须要做，哪些别人肯定比我做得更好更快？
有人说过一篇文献最重要的部分依次是：图表，讨论，文字结果，方法，这也是不无道理的。对一个领域熟悉之后，能做到仅通过阅读图表及其说明文字即能把握文章的方法、结果，在最短的时间内把握最必要的信息的要求。或者发展到定期查新得到的文章只须看摘要、图表即可，个别涉及新方法或突破性结果，再看讨论，文字结果和方法。
如果时间充裕，discussion部分还是要重点研读一下，特别是遇到CNS级别的paper的时候。这部分会把文章的精髓，idea的创新性，作者的实验设计逻辑再阐述一遍，图表的趋势解析，论据的组合，写作的亮点都是可以学习的地方。
10
文献精读的三种思维
文献精读是科研人必不可少的功课。精读的主要目的是要把文章的内容真正消化掉，要转化为你自己可以运用的东西。精读的方式分为三种，它们包括“验证型阅读”、“挑刺型阅读”和“总结归纳型阅读”。
1.验证型阅读——模仿者
这时候，你的角色是一个模仿者。就是拿到一篇好文章，暂不看文字内容，先把图和表挑出来，根据图和表的内容想想你来写这篇文章，你会怎么写，包括大的结构框架、组织逻辑，以及如何引入问题，如何进行结果陈述，如何引申出结论等，然后再看作者是怎么做的，反复体会你想的和你看的有哪些不同。当你的想法和作者的雷同程度越来越高，你的水平也在不知不觉之中越来越高。
这种“图表——思索——验证”的阅读对提升思维非常有效。当你做实验后得到的就是几个表、几个图，如果有意识地经过了“验证型阅读”的训练，你就会知道该怎么从更高、更好的角度来写你的文章。同样的数据，有的人可以发10.0的文章，有的人可能只能发5.0的文章，为什么有这种差别？这种差别其实就是在平时阅读文献的过程中慢慢积累出来的。
2.挑刺型阅读——评论者
这时候，你的角色相当于一个评论者了。是一种更高层次的精读方式，需要有评论的一些基础。挑刺就是找不足，能挑刺说明你不仅消化了文章的内容，而且还能比作者看得更深、更远。很多高档次杂志经常会刊出针对新文章的评论性短文，这实际上就是一种挑刺型阅读。“挑刺型阅读”可以提供新的研究思路，如果你立志于从事科学研究，撰写课题申请书是必须的能力之一。课题申请最重要的就是有新的idea，“挑刺型阅读”可以为你今后从事科学研究的选题提供良好的训练。
3.归纳总结型阅读——专家型
这时候，你的角色则是一个高屋建瓴的专家了，是一种宏观视野下阅读，是对多个“单”研究的归纳性思考，是对本领域的研究现状和发展趋势的总结和把握。每个人都可以总结，但要真正总结到位并对发展趋势进行合理、准确的预测却需要很强的能力，一般初涉研究的硕士很难达到这一水平，“大牛”才能很好地做到这一点，不是大牛，不是专家也没关系啦，因为大牛不是天生的，也是从研究生开始慢慢修炼出来的，你可以尝试性按照这种思维去做，量变到质变，说不定哪一天你成大牛了。
这三种精读的思维模式，也反映了我们文献阅读的三种境界，某一天，你对归纳总结型阅读已经游刃有余了，那么恭喜你，你成为“大牛”了。
（综合整理自解螺旋）
#往期热文推荐#