一步步教你利用diamond画出漂亮的晶体结构
*使用的cif 的参考文献：J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1304.
1．用diamond 打开cif 文件，相信这个大家都会。
2．整理结构，增减原子直到作出一个完整的框架，我只做了文献Fig1 中的一个框架，做两个只是花点时间重复操作而已。图形如下：
3．作出Zn 原子的多面体：点击diamond 最上方的按钮“Build－Polyhedra－Add Polyhedra”
出现如上面板，将Central atom groups 指定为Zn，Ligand atom groups 指定为O，然后确定，就得到Zn 的多面体图。
默认的多面体是白色的，可以自行调整颜色。用鼠标选中所有原子，右击鼠标点“Edit－PolyhedronDesigns…”在Fill Color 处改颜色；在other 里修改Ligand 原子半径，改为1。
改完后得到下图：
4．下面作出哑原子：选中任意两个处于体对角线的对称原子，或者全部原子（选全部原子要求结构框架是完整的，不然哑原子不落在空穴的中心），之后点击“Structure－Insert Atom…”，确定后在空穴的中心出现一个哑原子。
5．编辑哑原子：选中哑原子，右击鼠标“Edit－Atom Designs…”，先改颜色，再改半径。
将半径改成9（或者你自己喜欢的其他大小），点“apply now”，会出现警告提示，不管它，点确定。
然后点“Close”就好了！
然后调整角度，直到你自己满意为止。
6．保存图片：目前的分辨率是很低的，首先要调整一下分辨率：点“Picture－Layout…”
选用Bitmap，设定Resolution 为600，这样就可以提高分辨率了。在Backgroud 里可以改背景色。
最后Save as－Save Graphic as－选TIF 的格式，保存就得到一张图片。
这样得到的图片尽管 47 31307 47 14940 0 0 2493 0 0:00:12 0:00:05 0:00:07 2891清晰，但是仍然达不到出版的要求，最好用photoshop 打开，重新改一下分辨率和图片的大小（大小改成7～9cm，分辨率改成600 一般就没问题了）。
＃如果希望图片更加绚烂，比如有金属效果，倒影等等，就需要用到Pov-ray 了，这要求你首先要安装Povray 软件。
Povray 软件是免费的，目前稳定的版本是3.6 版，可以从它的主页上下载：
http://www.povray.org/download/
如果你安装了povray，diamond3.1 是可以调用它的。
点击“Tools－Pov-ray－Global Setting”
在Objects 里面挑选你喜欢的材质，选Metallic 就是金属效果，会出倒影。
在Backgroud 里改背景颜色或者背景图片，这个也会使你的图很炫。
在Bottom 改一些特效，在Lights 改灯光效果，有兴趣的的同学可以研究一下，当然这两项也很复杂。
改好以后点击“Tools－Pov-ray－Preview”预览一下效果。
点击“Tools－Pov-ray－Render into bitmap”就可以保存成图片了，注意要先取个文件名。
看看你的图片，是不是很绚烂？（个人觉得太炫的图不适合发表文章，只适合做报告用，个人意见哦！）
最后说一点，在螺旋链中间做一个柱子的方法，和上面是一样的，只不过需要做两个哑原子，然后把两个哑原子连成一条键
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