快讯：circRNA方法学专刊 & NAR数据库专刊上线

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声 明

近日，核酸研究领域迎来两大重量级的动态：一是著名的方法学杂志《Methods in Molecular Biology》专门对circRNA的研究方法做了专刊；二是Nucleic Acids Research杂志一年一度的数据库专刊上线。两者均对circRNA的研究有重要价值，在此跟诸位同行共同分享。

1. 《Methods in Molecular Biology》发表circRNA技术方法专刊

著名的方法学杂志《Methods in Molecular Biology》在最近的一期中专门对circRNA的研究方法做了专刊，包含了17篇方法学的文章，涵盖了circRNA分离，验证，分析与功能研究等各个方面。为方便广大同行交流学习，我们将结合公共号近期正做的RNA互作分子分析技术专题系列进行汇总和介绍。敬请大家关注。

专刊的目录截图如下：

图1 《Methods in Molecular Biology》circRNA专刊目录截图

2. 《Nucleic Acids Research》发布2018年度数据库专刊 

自1994年以来，Nucleic Acids Research每年定期在1月份刊发数据库专刊，2018年度已是第25期。

本期共收集了181篇文章，其中84篇为之前曾在数据库专刊中报道过的数据库的更新版，82篇为新收录的，还有15篇为最新上线和公布的数据库。核酸方面的数据库包括用于可视化基因组3D结构和RNA结构的数据的3DIV数据库，RNA家族的分级分类的RNArchitecture数据库。蛋白质数据库包括经典的SMART，ELM和MEROPS，也包括GPCRdb和STCRDab等新面孔。在代谢领域，HMDB和Reactome报道增加了新的功能，PULDB数据库则是首次收录。基因组Resource数据库包括Ensembl，UCSC基因组浏览器和ENCODE。还有其他的药学，蛋白质组学等等不同领域的数据库(Fern´andez 2018)。

circRNA相关的数据库

今年的数据库专刊首次收录了两个circRNA相关的数据库：CSCD和exoRBase。CSCD是介绍肿瘤特异性的circRNA表达的数据库。exoRBase是专门收录外泌体中各种RNA分子的数据库，其中包括了circRNA。两个数据库的介绍文章已在论文公布的第一时间做了介绍，在此不再赘述。

RNA研究可能涉及的数据库

在所收录的数据库中有不少是直接与RNA有关的，包括可视化基因组3D结构和RNA结构的数据的3DIV数据库，RNA家族的分级分类的RNArchitecture数据库等等。此外一些常用的基因组和蛋白研究的数据库也是circRNA研究经常会用到的，也一起汇总在这一部分了。下面将与RNA有关的数据库名称，简要介绍和网址汇总如下（表1）：

表1 RNA研究相关数据库（摘自(Fern´andez 2018)）

数据库名称

其他生物医学相关数据库

除了与RNA研究密切相关的，还一起写其他的生物医学相关的数据库，例如人类组织中蛋白-蛋白质相互作用差异的数据库DifferentialNET，疾病相关增强子数据库DiseaseEnhancer等等。具体列表如下：

表2生物医学相关数据库（摘自(Fern´andez 2018)）

数据库名称

其他数据库

非生物医学方向的，比如微生物，植物，甚至风味物质的数据库也在今年的收录名单，相关研究方向的同仁可以了解一下。

表3其他数据库（摘自(Fern´andez 2018)）

参考文献：

Fern´andez, D. J. R. a. X. e. M. (2018). "The 2018 Nucleic Acids Research database issue and the online molecular biology database collection." Nucleic Acids Research.

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