7月下半月circRNA研究报道汇总

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声 明

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期共收集最新发布的circRNA文献16篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

1、综述：circRNA生物起源、功能及研究挑战

论文标题：The Biogenesis, Functions, and Challenges of Circular RNAs.

杂志：Mol Cell 

影响因子：14.248

通讯作者单位：上海中科院

上海中科院杨力，陈玲玲教授在Molecular cell杂志上发表了最新circRNA研究综述文章，主要汇总了circRNA形成机制、功能和目前研究挑战等方面内容。CircRNA往往同宿主基因（host gene）来源于同一转录产物，相当一部分文章报道了circRNA与host gene间的相关性，但具体机制还需更多研究。CircRNA与宿主mRNA序列高度一致，仅接头位置序列不同，这给circRNA的检测技术带来了相当的难度。如跨接头设计PCR引物，定量鉴定circRNA分子；siRNA和ASO（反义核苷酸）对circRNA进行敲低，circRNA过表达载体构建，病毒包装；FISH探针检测circRNA亚细胞定位等，circRNA的这些研究技术都有提升的空间，该综述的具体解读见本公众号解读文章：杨力陈玲玲教授Molecular Cell杂志发表长篇circRNA综述。

2、circFBLIM1竞争性吸附miR-346来促进肝细胞癌的发展

论文标题：circFBLIM1 act as a ceRNA to promote hepatocellular cancer progression by sponging miR-346.

杂志：J Exp Clin Cancer Res 

影响因子：6.217

通讯作者单位：中南大学湘雅医院

肝癌是一种常见的恶性疾病。据估计，2012年全世界有778500个新病例和745 500例肝癌死亡病例。大部分原发性肝癌是肝细胞癌（HCC），往往在晚期才能被诊断出来，治疗手段是手术切除或肝移植，尽管手术不断改善，但预后任然很差。因此深入理解肝癌发病机制，获得新肝癌治疗靶标一直是科学家探索的方向，circRNA在众多生理功能和疾病发生发展过程起着重要作用。本文从circRNA角度出发，挖掘circRNA在肝癌中的作用机制。研究者通过circRNA微阵列芯片筛选肝癌组织中的差异表达circRNA，并经过qRT-PCR验证发现circFBLIM1在肝癌中异常高表达，进一步细胞功能研究表明circFBLIM1可促进肝癌细胞增殖和侵袭，抑制凋亡。敲低circFBLIM1则细胞表现出抑癌表征，说明circFBLIM1在肝癌中可能起癌基因角色。进一步分子机制研究，luciferase报告基因实验表明circFBLIM1可竞争性结合miR-346，而miR-346下游的靶基因正是circFBLIM1的宿主基因FBLIM1，因此研究结果表明circFBLIM1通过竞争性吸附miR-346，上调其自身宿主基因FBLIM1的表达，进而促进肝癌的发展，由此circFBLIM1可作为肝癌诊断治疗的潜在靶标。

图注：circFBLIM1通过ceRNA 机制（miR-346）调控FBLIM1

A:qPCR和WB检测FBLIM1在HCC细胞中的表达水平；

B：qPCR检测circFBLIM1在50例HCC组织和癌旁组织的表达情况，显著高表达；

C：生物信息预测miR-346结合FBLIM1的 3’UTR；

D：luciferase报告基因分析显示miR-346可直接结合调控FBLIM1；

E：HCC细胞中转染miR-346后，qPCR检测FBLIM1的表达；

F：siRNA干扰FBLIM1后，qPCR检测miR-346表达水平（上调）；

G&H： HCC细胞转染NC, si-circFBLIM1 或si-circFBLIM1 +miR-346 LNA后，qCPR检测FBLIM1或circFBLIM1的表达；

i： HCC细胞转染miR-NC, miR-346 或miR-346+si-circFBLIM1后，CCK8检测细胞增殖能力；

J：HCC细胞转染miR-NC, miR-346 或miR-346+si-circFBLIM1后，细胞凋亡情况检测。

3、CircRNA8924通过竞争性结合MiR-518d-5p/519-5p家族调节CBX8的表达进而促进子宫颈癌细胞增殖、迁移和侵袭

论文标题：CircRNA8924 Promotes Cervical Cancer Cell Proliferation, Migration and Invasion by Competitively Binding to MiR-518d-5p /519-5p Family and Modulating the Expression of CBX8

杂志：cell Physiol Biochem.

影响因子：5.5

通讯作者单位：辽宁省肿瘤医院

宫颈癌（Cervical cancer，CC）是世界上最常见的妇科癌症，并且已经证明持续感染高危型人乳头瘤病毒（HR-HPV）是其宫颈癌组织发生和发展的重要致病因素。 随着近年来HPV疫苗的广泛应用，宫颈癌的一级预防已在一定程度上得到实现，其发病率和死亡率在许多发达国家得到有效控制。 然而，较高的HPV感染率始终伴随着相对较低的CC发病率，这不仅使CC筛查和一级预防成为卫生经济学的沉重经济负担，而且暗示CC中的个体遗传差异和其他重要因素。因此，必须探索CC的确切发病机制，并找到全新的诊断标志物作为潜在的治疗靶点。近年来，circRNA成为疾病研究的热点， 与具有传统线性结构的miRNA和lncRNA不同，circRNA是共价闭合的连续环。由于缺乏3'，5'末端和poly A尾，circRNAs可以避免外切核酸酶和RNase R的降解作用。与线性RNA相比，circRNA更保守和稳定，并显示细胞特异性，组织特异性和阶段性。

在该研究中，研究者使用人circRNA微阵列筛选CC组织和配对的癌旁正常组织，结果显示circRNA8924是显著上调。CircRNA8924（DeepBase）也称为hsa_circ_0141539（circBase），来源于Clorf116基因的外显子，位于chr1：2072008388-207201024。通过生物信息学分析，发现miR-519a-5p，miR-519c-5p和miR-518e-5p与circRNA8924的具有较强的结合位点。这些miRNA属于miR-518d-5p / 519-5p家族，并且大多数家族成员具有相同的核苷酸序列，仅有1或2个核苷酸差别。miR-518d-5p / 519-5p家族其中一些成员已在肿瘤中报道。最近的研究表明，miR-526a在肝癌组织中的低表达可以靶向PAK7的调节。 miR-526a的过表达显着抑制HCC细胞Huh7和HepG2的增殖，迁移，侵袭和异位种植。然而，miR-518d-5p / 519-5p家族在CC中的表达和机制尚不清楚。该研究首次证明了circRNA8924在CC的肿瘤发生中的重要作用，并揭示其作为ceRNA的功能，通过海绵miR-518-d-5p / 519-5p调节CBX8的表达。

图注：宫颈癌中circRNA8924与miR-519a-5P表达相关性研究

A：qPCR检测miR-519a-5p在宫颈癌组织标本（n=33）中显著低表达；

B：circRNA8924与miR-519a-5P在宫颈癌组织中的表达水平显著负相关；

C：circRNA8924与miR-519a-5P结合位点预测及突变位点示意图；

D：luciferase报告基因证明circRNA8924与miR-519a-5P可直接结合；

E：shRNA敲低circRNA8924后，qPCR检测miR-519a-5p的表达水平升高；

4、circ2Disease：人工编辑的经过实验验证的人类疾病circRNAs的数据库

论文标题：Circ2Disease: a manually curated database of experimentally validated circRNAs in human disease

杂志：Sci Rep.  

影响因子：4.122

通讯作者单位：浙江大学医学院

环状RNA（circRNAs）是一类新的RNA分子，在人类疾病中发挥着重要作用。越来越多的circRNA被证明具有生物学功能，所以很有必要整合相关信息以促进人类疾病中circRNA功能和分子调控网络的研究。Circ2Disease数据库包含233个circRNA和54个人类疾病，以及273条人工整理的疾病-circRNA关联记录，120个circRNA-疾病关联具有较强的实验证据。每个关联包括circRNA名称，疾病名称，表达模式，实验方法，circRNA-疾病关系的简要功能描述，以及其他详细信息。经过实验验证的miRNA可能被这些circRNA及其验证目标“吸附”，也被整合进circRNA分子网络。Circ2Disease提供用户友好的界面，便于浏览，搜索，分析网络和下载数据。Circ2Disease将显着提高我们对疾病中circRNA失调的理解，并且是研究circRNA在人类疾病中的转录后调节作用的有用资源。

Circ2Disease数据库网址：http://www.disease-ontology.org/

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