circRNA研究汇总 | 20190527-0602

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献18篇，下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。

1、人类心脏蛋白翻译蓝图

论文标题：The Translational Landscape of the Human Heart.

杂志：cell. 

影响因子：31.398

通讯作者：Sebastiaan van Heesch和Norbert Hubner（德国柏林Max Delbruck分子医学中心）

本期Cell杂志发表了一项关于人心脏翻译组学系统性工作，该研究主要有以下亮点：利用核糖体印迹测序技术分析揭示了人体心脏组织中蛋白翻译调控原理；蛋白翻译剪切变体调控机制；一些lncRNA和circRNA可在体内产生功能性微蛋白；这些微蛋白可能涉及线粒体和其他细胞过程。该研究证实了169种lncRNA，40种circRNA可编码蛋白质，进一步打破了circRNA归为非编码RNA的界限，表明了circRNA的功能多样性。CircRNA翻译研究还有很多空白值得去探索。本文献深入解读详见本公众号历史文章：Cell | 心脏翻译组学文章，证明circRNA可翻译

图注：数以百计的circRNA和lncRNA可翻译微蛋白并行使功能，蛋白翻译剪切变体与疾病相关

2、由Circ-CDYL驱动的非编码调控RNA网络特别是在早期阶段肝细胞癌的研究

论文标题：A Noncoding Regulatory RNAs Network Driven by Circ-CDYL Acts Specifically in the Early Stages Hepatocellular Carcinoma

杂志：Hepatology 

影响因子：14.079

通讯作者：Hongyang Wang和Liang Li（第二军医大学东方肝胆外科研究）

肝细胞癌（HCC）是全球癌症相关死亡增加最快的癌症，但在其早期阶段缺乏特异性生物标志物和治疗靶点，导致HCC早期诊断和治疗的严重不足。该研究通过对mRNA，circRNA和microRNA表达谱的全基因组分析，揭示了在HCC的早期阶段以circRNA为中心的调控RNA网络。Circ-CDYL在HCC的早期阶段EpCAM阳性细胞特异性上调，Circ-CDYL分别作为miR-892a和miR-328-3p的海绵，与编码肝细胞瘤衍生生长因子（HDGF）和缺氧诱导因子天冬酰胺羟化酶（HIF1AN）的mRNA相互作用，随后，激活PI3K-AKT-mTORC1/β-catenin和NOTCH2途径，促进BIRC5或SURVIVIN和MYC原癌基因的效应蛋白的表达。研究者进一步证明了Circ-CDYL表达或与HDGF和HIF1AN两者结合都是区分早期HCC的独立标志物，优势比（OR）为1.09（95％CI：1.02-1.17）和124.58（95％）CI：13.26-1170.56）。

图注：A和B：Circ-CDYL、HDGF和HIF1AN作为肝细胞癌早期诊断标志物的诊断效能分析；C：肝细胞癌中以Circ-CDYL为中心的调控网络机制示意图

3、HPV来源的circRNA翻译原癌蛋白促进子宫颈癌细胞发生转化

论文标题：Transforming activity of an oncoprotein-encoding circular RNA from human papillomavirus

杂志：Nature communications  

影响因子：12.353

通讯作者：Richard C. Wang（德克萨斯大学西南医学中心）

人乳头瘤病毒（HPV）是双链DNA病毒，含有100多种亚型，高风险HPV16和18，引起约70％的宫颈癌。之前已有研究发现在EB病毒和卡波西肉瘤病毒(KSHV)可产生多种环状RNA，这些circRNA在病毒感染宿主过程可能起到关键调控作用。该研究发现，致癌型HPV产生circRNA，在HPV16感染细胞中通过RT-PCR和northern blotting实验检测到HPV16形成的circE7。CircE7经N6-甲基腺苷（m6A）修饰，主要定位于细胞质，与核糖体相关，可翻译产生E7癌蛋白。CaSki宫颈癌细胞中特异性敲低circE7后，E7蛋白水平降低，并抑制了体外和肿瘤异种移植中的癌细胞生长。该研究结果表明病毒来源的环状RNA编码蛋白质具有生物学功能，circE7的稳定性和其编码蛋白E7的致癌作用，为其作为诊断高风险性HPV感染的标志物提供了依据。本文献深入解读详见本公众号历史文章：Nature communications | HPV circRNA编码蛋白“助纣为虐”？

4、microRNA，circRNA和长非编码RNA在急性髓性白血病中的作用

论文标题：Role of microRNAs, circRNAs and long noncoding RNAs in acute myeloid leukemia

杂志：J Hematol Oncol. 

影响因子：7.333

通讯作者：Lin Fu（广州医科大学附属第二医院）

急性髓性白血病（AML）是骨髓（BM）中未成熟骨髓造血细胞的恶性肿瘤。这是一种高度异质性的疾病，老年患者的发病率和死亡率都在上升。尽管过去几十年的研究提高了我们对AML的认识，但其发病机制尚未完全阐明。长非编码RNA（lncRNA），小RNA（miRNA）和环状RNA（circRNA）三种非编码RNA（ncRNA）分子，他们调节基因转录和蛋白翻译。随着RNA-Seq技术的发展，已经发现了越来越多与AML白血病发生密切相关的ncRNA。大量研究发现，这些ncRNA在白血病细胞增殖，分化和凋亡中起重要作用。一些可能潜在地用作预后生物标志物。在该综述文章中，作者系统简要描述了三种ncRNAs的特征和分子功能，包括lncRNAs，miRNAs和circRNAs，并详细讨论了它们与AML的关系。

图注：AML相关的circRNA汇总表

图注：AML中circRNA-microRNA-lncRNA三种分子相关性图

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