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circRNA研究汇总 | 20190902-0908

木禾 circRNA 2021-02-21

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目,本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献23篇,下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。


1、揭示内含子和外显子限定和反向剪接的统一机制

论文标题:A unified mechanism for intron and exon definition and back-splicing.

期刊:Nature 

影响因子:43.07

通讯作者:Rui Zhao(美国科罗拉多大学安舒茨医学校区)和 Z. Hong Zhou(加州大学洛杉矶分校)


外显子限定和反向剪接的分子机制是前提mRNA剪接中尚未解决的基本问题。该研究的团队成员利用冷冻低温电镜技术,提供了在内含子上酵母剪接体E复合物组装结构及展示了mRNA前提剪接中最早期事件的视图。E复合物结构表明相同的剪接体可以跨越外显子组装,要么重构以跨越内含子实现经典的线性剪接(通常在短外显子上),要么催化反向剪接以产生环状RNA(在长外显子上)。该模型得到了实验的支持,即当外显子足够长时,在酵母EFM5或HMRA1基因的中间外显子上组装的E复合物可形成环状RNA。该模型统一了真核生物中利用相同剪接体的内含子、外显限定和反向剪接机制,意义重大。推荐阅读:Nature | 酵母剪切体E复合体结构揭示circRNA形成机制。

图注:内含子、外显子和反向剪接机制统一模型机制


2、N6-甲基腺苷修饰控制细胞对环状的RNA的免疫反应

论文标题:N6-Methyladenosine Modification Controls Circular RNA Immunity

期刊:Molecular Cell  

影响因子:14.548

通讯作者:Howard Y. Chang (斯坦福大学)


环状RNA(circRNA)在真核细胞和病毒基因组中普遍存在。哺乳动物细胞具有检测外源circRNA的先天免疫力,但是在细胞免疫系统中识别自身和外源circRNA同一性的分子基础尚不清楚。该研究结果发现人类circRNAs上的N6-甲基腺苷(m6A)RNA修饰可抑制细胞先天免疫和佐剂活性。外源circRNA是体内诱导抗原特异性T细胞活化,抗体产生和抗肿瘤免疫的有效佐剂。细胞内源产生的circRNA由于携带m6A修饰,募集并结合了YTHDF2,后者抑制了RIG-I/K63-Ubn/circRNA复合体的活化,最终不会诱发自身免疫效应通路激活。外源circRNA(不携带m6A修饰)可以通过与K63-Ubn和RIG-I结合并促进RIG-I聚合和激活,进而促进下游MAVS的聚合进而诱导IRF3的二聚化激活,最终诱导自身免疫相关通路基因的表达。推荐阅读:Molecular Cell | 外源环状RNA可诱发免疫效应的新证据。

图注:circRNA通过RIG-I诱导先天免疫应答分子机制示意图


3、黄病毒基因组RNA的环化抑制从头翻译起始

论文标题:Circularization of flavivirus genomic RNA inhibits de novo translation initiation

期刊:Nucleic Acids Research 

影响因子:11.147

通讯作者:Trevor R. Sweeney (剑桥大学Addenbrooke’s医院)


黄病毒科是一种病毒家族。人类和其他哺乳动物作为其天然宿主。它们主要通过节肢动物载体(主要是蜱和蚊子)传播。该科从黄热病病毒(黄病毒科病毒)获得其名称,遗传物质为单股线型的RNA,长度约9.6-12.3kb,5'端帽带有甲基化的核苷酸。病毒颗粒具有外套膜,直径约40-60nm。寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)等黄病毒科病毒在全球广泛流行,引起较大危害,而目前尚无批准的特效药物和疫苗用于防治。母亲感染寨卡病毒(ZIKV)可诱发新生儿小头畸形。感染后,黄病毒RNA基因组既要翻译蛋白又要作为转录模板复制新基因组。但核糖体和病毒聚合酶沿RNA的相反方向前进,存在碰撞和无法复制的风险。黄病毒基因组通常是线性的(有利于蛋白翻译),也可以远距离通过RNA-RNA相互作用形成环状构象,这种环状RNA的结构则是黄病毒基因组进行复制的必要条件。该研究利用体外重建方法,证明了黄病毒基因组环化抑制ZIKV(寨卡病毒)和DENV(登革病毒) RNA上的从头翻译起始,而线性构象是翻译能力的。清除核糖体的病毒RNA可以有效促进复制的机制,该研究成果增进了人们对黄病毒基因组RNA在不同感染阶段构象变化的认识,为对抗病毒感染提供了重要的理论基础,具有重要的临床意义。推荐阅读:Nucleic Acids Research | 黄病毒基因组RNA的环化抑制了从头翻译起始。

图注:RNA基因组环化抑制翻译起始的机制示意图



参考文献列表:





1

黄病毒基因组RNA的环化抑制了从头翻译起始

2

Nature | 酵母剪切体E复合体结构揭示circRNA形成机制

3

Genome Medicine | 逾千种肿瘤细胞系circRNA表达谱

4

珍藏版 | 环状RNA的过去,现在与未来

5

Molecular Cell | 外源环状RNA可诱发免疫效应的新证据

6

EMBO Mol Med|环状RNA可作为结肠癌复发预测分子标记物





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