许东博士就读于美国的伊利诺伊大学厄巴纳—香槟分校(University of Illinois at Urbana-Champaign,UIUC),但前面还有段小序曲。1990年,许东硕士毕业后,来到美国纽约市立大学皇后学院读起了物理博士。但因为当时女朋友(现在的妻子)读研选在了UIUC,许东果断转校。次年5月,许东向西出发,跨越千里与爱人会和。他与妻子在北大结识,妻子就读于化学系,比他小三届,两人从相恋时就约定去更远的地方,从北大到UIUC,两所学校成了二人从相识到婚姻的重要见证。这段经历有一位见证人——许东的博士导师Klaus J. Schulten教授,也是许东一生中最重要的一位导师。
1990年10月,经美国国会批准的人类基因组计划正式启动。这项大约耗资30亿美元来测定30亿个碱基对的国际计划,从美国迅速席卷到英、日、法、德、中等国家。与此同时,这项研究也从多国政府间的合作小组,分散到诸多私营性质的基因研究机构中。其中,最具代表性的就是文特尔(J. C. Venter)创立了塞莱拉基因公司,并用1991年提出的“散弹法”新型测序技术,多次走到“国际人类基因计划”的前面。一场公私之间的科研赛跑,在三十年前拉开帷幕。1994年,由美国科学家约翰·莫尔特(John Moult)发起的全球蛋白质结构预测竞赛(CASP),召集科研界所有人士,开始了真正的较量。这个两年举办一次的竞赛,一亮相便吸引了计算机科学、生物物理学等不同领域的专家参与到蛋白质三维结构预测中。在那个年代,基因测序和蛋白质结构预测如火如荼,生物信息学(Bioinformatics)也成为了一门正式学科。
许东一行人是幸运的,这群从橡树岭出来的人在美国高校大受欢迎。新世纪初,几乎所有高校都在建设生物信息研究所,徐鹰最终去到佐治亚大学,成为了该校生信研究所的首任所长,并拉去了Victor Olman,两人继续共事。许东则去了密苏里大学的哥伦比亚分校(University of Missouri,Columbia,下称“密大”)。2003年8月,许东以计算机科学系副教授、James C. Dowell讲座副教授,以及Christopher S. Bond生命科学中心研究员的身份,被正式引进到该校。而他将在这个被称为“哥村”的地方,一待近二十年。2007年底,42岁的许东担任该校计算机科学系的系主任,成为了密大所有系主任中最年轻的一位。这是许东人生中的一个重要时刻,也是在美国高校管理人员中为数不多的华人面孔。2007年,许东任职系主任时留影在这个非母语环境中,许东不善言辞,但这次任职,却收获了全院的支持。许东说到,“如果要说我有什么合适的地方,或许是我学问做得还不错,文章比较多,更重要的是,大家觉得我不会借机给自己谋什么福利。”上任第一件事,就是设计课程。许东在橡树岭这所千人实验室的经历派上了用场。他考虑了系内近20名教授的专长,准备将研究方向集中于三个领域,分别为网络、多媒体、生物信息。许东认为,计算机学科领域太广,必须专精才能突出。“当时的密大计算机系有50名博士生,人力资源丰富,如果善加整合,提供明确研究方向,必能协助教授,做出量多质佳的研究,提高计算机系的整体素质。”许东将学术机构则比作私人企业,学术合作的关键在于最后的产值,而系主任就是拉拉队鼓舞士气,让团队有最好表现。那些年里,许东也长期奔走在国内高校,一边做学术讲座,一边推动国内大学与密苏里大学3+2、2+2等联合培养项目。许东回忆,他跑遍了中国几十所双一流高校,回国次数不计其数。特别是吉林大学,他每年都去讲学,并担任过大约十年的唐敖庆客座教授,和许多的老师同学建立了深厚的友谊,合作发了几十篇论文。比如,时任吉林大学计算机学院副院长的梁艳春教授,也有十年每年到密苏里大学许东的实验室访问、合作。2015年许东到西安电子科技大学访问交流(右四),近年许东和梁艳春教授在密苏里河畔在担任系主任的那段时间,许东参加了很多的领导培训课程,看到课件上将领导人打上四类标签:冒险型、守成型、改革型和善后型。许东没想那么多,“天底下很多东西都有专业,但做领导是没有专业的,没有谁见到哪个系科是专门培养领导的,就算是MBA,教的也是金融的东西。”他反而觉得,不如从过去的经历中找养分,看看能不能把一个系管理得井井有条。直到2016年,密大计算机系与电机系合并,许东十年的系主任正式卸任。