Python数据分析之pandas学习(一)
我们接着上次分享给大家的两篇文章:Python数据分析之numpy学习(一)和Python数据分析之numpy学习(二),继续讨论使用Python中的pandas模块进行数据分。在接下来的两期pandas介绍中将学习到如下8块内容:
1、数据结构简介:DataFrame和Series
2、数据索引index
3、利用pandas查询数据
4、利用pandas的DataFrames进行统计分析
5、利用pandas实现SQL操作
6、利用pandas进行缺失值的处理
7、利用pandas实现Excel的数据透视表功能
8、多层索引的使用
一、数据结构介绍
在pandas中有两类非常重要的数据结构,即序列Series和数据框DataFrame。Series类似于numpy中的一维数组,除了通吃一维数组可用的函数或方法,而且其可通过索引标签的方式获取数据,还具有索引的自动对齐功能;DataFrame类似于numpy中的二维数组,同样可以通用numpy数组的函数和方法,而且还具有其他灵活应用,后续会介绍到。
1、Series的创建
序列的创建主要有三种方式:
1)通过一维数组创建序列
In [1]: import numpy as np, pandas as pd
In [2]: arr1 = np.arange(10)
In [3]: arr1
Out[3]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])
In [4]: type(arr1)
Out[4]: numpy.ndarray
返回的是数组类型。
In [5]: s1 = pd.Series(arr1)
In [6]: s1
Out[6]:
0 0
1 1
2 2
3 3
4 4
5 5
6 6
7 7
8 8
9 9
dtype: int32
In [7]: type(s1)
Out[7]: pandas.core.series.Series
返回的是序列类型。
2)通过字典的方式创建序列
In [8]: dic1 = {'a':10,'b':20,'c':30,'d':40,'e':50}
In [9]: dic1
Out[9]: {'a': 10, 'b': 20, 'c': 30, 'd': 40, 'e': 50}
In [10]: type(dic1)
Out[10]: dict
返回的是字典类型。
In [11]: s2 = pd.Series(dic1)
In [12]: s2
Out[12]:
a 10
b 20
c 30
d 40
e 50
dtype: int64
In [13]: type(s2)
Out[13]: pandas.core.series.Series
返回的是序列类型。
3)通过DataFrame中的某一行或某一列创建序列
这部分内容我们放在后面讲,接下来就开始讲一讲如何构造一个DataFrame。
2、DataFrame的创建
数据框的创建主要有三种方式:
1)通过二维数组创建数据框
In [14]: arr2 = np.array(np.arange(12)).reshape(4,3)
In [15]: arr2
Out[15]:
array([[ 0, 1, 2],
[ 3, 4, 5],
[ 6, 7, 8],
[ 9, 10, 11]])
In [16]: type(arr2)
Out[16]: numpy.ndarray
返回的是数组类型。
In [17]: df1 = pd.DataFrame(arr2)
In [18]: df1
Out[18]:
0 1 2
0 0 1 2
1 3 4 5
2 6 7 8
3 9 10 11
In [19]: type(df1)
Out[19]: pandas.core.frame.DataFrame
返回的数据框类型。
2)通过字典的方式创建数据框
以下以两种字典来创建数据框,一个是字典列表,一个是嵌套字典。
In [20]: dic2 = {'a':[1,2,3,4],'b':[5,6,7,8],
...: 'c':[9,10,11,12],'d':[13,14,15,16]}
In [21]: dic2
Out[21]:
{'a': [1, 2, 3, 4],
'b': [5, 6, 7, 8],
'c': [9, 10, 11, 12],
'd': [13, 14, 15, 16]}
In [22]: type(dic2)
Out[22]: dict
返回的是字典类型。
In [23]: df2 = pd.DataFrame(dic2)
In [24]: df2
Out[24]:
a b c d
0 1 5 9 13
1 2 6 10 14
2 3 7 11 15
3 4 8 12 16
In [25]: type(df2)
Out[25]: pandas.core.frame.DataFrame
返回的是数据框类型。
In [26]: dic3 = {'one':{'a':1,'b':2,'c':3,'d':4},
...: 'two':{'a':5,'b':6,'c':7,'d':8},
...: 'three':{'a':9,'b':10,'c':11,'d':12}}
In [27]: dic3
Out[27]:
{'one': {'a': 1, 'b': 2, 'c': 3, 'd': 4},
'three': {'a': 9, 'b': 10, 'c': 11, 'd': 12},
'two': {'a': 5, 'b': 6, 'c': 7, 'd': 8}}
In [28]: type(dic3)
Out[28]: dict
返回的是字典类型。
In [29]: df3 = pd.DataFrame(dic3)
In [30]: df3
Out[30]:
one three two
a 1 9 5
b 2 10 6
c 3 11 7
d 4 12 8
In [31]: type(df3)
Out[31]: pandas.core.frame.DataFrame
返回的是数据框类型。这里需要说明的是,如果使用嵌套字典创建数据框的话,嵌套字典的最外层键会形成数据框的列变量,而内层键则会形成数据框的行索引。
3)通过数据框的方式创建数据框
In [32]: df4 = df3[['one','three']]
In [33]: df4
Out[33]:
one three
a 1 9
b 2 10
c 3 11
d 4 12
In [34]: type(df4)
Out[34]: pandas.core.frame.DataFrame
返回的是数据框类型。
In [35]: s3 = df3['one']
In [36]: s3
Out[36]:
a 1
b 2
c 3
d 4
Name: one, dtype: int64
In [37]: type(s3)
Out[37]: pandas.core.series.Series
这里就是通过选择数据框中的某一列,返回一个序列的对象。
二、数据索引index
细致的朋友可能会发现一个现象,不论是序列也好,还是数据框也好,对象的最左边总有一个非原始数据对象,这个是什么呢?不错,就是我们接下来要介绍的索引。
在我看来,序列或数据框的索引有两大用处,一个是通过索引值或索引标签获取目标数据,另一个是通过索引,可以使序列或数据框的计算、操作实现自动化对齐,下面我们就来看看这两个功能的应用。
1、通过索引值或索引标签获取数据
In [38]: s4 = pd.Series(np.array([1,1,2,3,5,8]))
In [39]: s4
Out[39]:
0 1
1 1
2 2
3 3
4 5
5 8
dtype: int32
如果不给序列一个指定的索引值,则序列自动生成一个从0开始的自增索引。可以通过index查看序列的索引:
In [40]: s4.index
Out[40]: RangeIndex(start=0, stop=6, step=1)
现在我们为序列设定一个自定义的索引值:
In [41]: s4.index = ['a','b','c','d','e','f']
In [42]: s4
Out[42]:
a 1
b 1
c 2
d 3
e 5
f 8
dtype: int32
序列有了索引,就可以通过索引值或索引标签进行数据的获取:
In [43]: s4[3]
Out[43]: 3
In [44]: s4['e']
Out[44]: 5
In [45]: s4[[1,3,5]]
Out[45]:
b 1
d 3
f 8
dtype: int32
In [46]: s4[['a','b','d','f']]
Out[46]:
a 1
b 1
d 3
f 8
dtype: int32
In [47]: s4[:4]
Out[47]:
a 1
b 1
c 2
d 3
dtype: int32
In [48]: s4['c':]
Out[48]:
c 2
d 3
e 5
f 8
dtype: int32
In [49]: s4['b':'e']
Out[49]:
b 1
c 2
d 3
e 5
dtype: int32
千万注意:如果通过索引标签获取数据的话,末端标签所对应的值是可以返回的!在一维数组中,就无法通过索引标签获取数据,这也是序列不同于一维数组的一个方面。
2、自动化对齐
如果有两个序列,需要对这两个序列进行算术运算,这时索引的存在就体现的它的价值了--自动化对齐。
In [50]: s5 = pd.Series(np.array([10,15,20,30,55,80]),
...: index = ['a','b','c','d','e','f'])
In [51]: s5
Out[51]:
a 10
b 15
c 20
d 30
e 55
f 80
dtype: int32
In [52]: s6 = pd.Series(np.array([12,11,13,15,14,16]),
...: index = ['a','c','g','b','d','f'])
In [53]: s6
Out[53]:
a 12
c 11
g 13
b 15
d 14
f 16
dtype: int32
In [54]: s5 + s6
Out[54]:
a 22.0
b 30.0
c 31.0
d 44.0
e NaN
f 96.0
g NaN
dtype: float64
In [55]: s5/s6
Out[55]:
a 0.833333
b 1.000000
c 1.818182
d 2.142857
e NaN
f 5.000000
g NaN
dtype: float64
由于s5中没有对应的g索引,s6中没有对应的e索引,所以数据的运算会产生两个缺失值NaN。注意,这里的算术结果就实现了两个序列索引的自动对齐,而非简单的将两个序列加总或相除。对于数据框的对齐,不仅仅是行索引的自动对齐,同时也会自动对齐列索引(变量名)。
数据框中同样有索引,而且数据框是二维数组的推广,所以数据框不仅有行索引,而且还存在列索引,关于数据框中的索引相比于序列的应用要强大的多,这部分内容将放在下面的数据查询中讲解。
三、利用pandas查询数据
这里的查询数据相当于R语言里的subset功能,可以通过布尔索引有针对的选取原数据的子集、指定行、指定列等。我们先导入一个student数据集:
In [56]: student = pd.io.parsers.read_csv('C:\\Users\\admin\\Desktop\\student.csv')
查询数据的前5行或末尾5行:
In [57]: student.head()
Out[57]:
Name Sex Age Height Weight
0 Alfred M 14 69.0 112.5
1 Alice F 13 56.5 84.0
2 Barbara F 13 65.3 98.0
3 Carol F 14 62.8 102.5
4 Henry M 14 63.5 102.5
In [58]: student.tail()
Out[58]:
Name Sex Age Height Weight
14 Philip M 16 72.0 150.0
15 Robert M 12 64.8 128.0
16 Ronald M 15 67.0 133.0
17 Thomas M 11 57.5 85.0
18 William M 15 66.5 112.0
查询指定的行:
In [59]: student.ix[[0,2,4,5,7]] #这里的ix索引标签函数必须是中括号[]
Out[59]:
Name Sex Age Height Weight
0 Alfred M 14 69.0 112.5
2 Barbara F 13 65.3 98.0
4 Henry M 14 63.5 102.5
5 James M 12 57.3 83.0
7 Janet F 15 62.5 112.5
查询指定的列:
In [60]: student[['Name','Height','Weight']].head() #如果多个列的话,必须使用双重中括号
Out[60]:
Name Height Weight
0 Alfred 69.0 112.5
1 Alice 56.5 84.0
2 Barbara 65.3 98.0
3 Carol 62.8 102.5
4 Henry 63.5 102.5
也可以通过ix索引标签查询指定的列:
In [61]: student.ix[:,['Name','Height','Weight']].head()
Out[61]:
Name Height Weight
0 Alfred 69.0 112.5
1 Alice 56.5 84.0
2 Barbara 65.3 98.0
3 Carol 62.8 102.5
4 Henry 63.5 102.5
查询指定的行和列:
In [62]: student.ix[[0,2,4,5,7],['Name','Height','Weight']].head()
Out[62]:
Name Height Weight
0 Alfred 69.0 112.5
2 Barbara 65.3 98.0
4 Henry 63.5 102.5
5 James 57.3 83.0
7 Janet 62.5 112.5
这里简单说明一下ix的用法:df.ix[行索引,列索引]
1)ix后面必须是中括号
2)多个行索引或列索引必须用中括号括起来
3)如果选择所有行索引或列索引,则用英文状态下的冒号:表示
以上是从行或列的角度查询数据的子集,现在我们来看看如何通过布尔索引实现数据的子集查询。
查询所有女生的信息:
In [63]: student[student['Sex']=='F']
Out[63]:
Name Sex Age Height Weight
1 Alice F 13 56.5 84.0
2 Barbara F 13 65.3 98.0
3 Carol F 14 62.8 102.5
6 Jane F 12 59.8 84.5
7 Janet F 15 62.5 112.5
10 Joyce F 11 51.3 50.5
11 Judy F 14 64.3 90.0
12 Louise F 12 56.3 77.0
13 Mary F 15 66.5 112.0
查询出所有12岁以上的女生信息:
In [64]: student[(student['Sex']=='F') & (student['Age']>12)]
Out[64]:
Name Sex Age Height Weight
1 Alice F 13 56.5 84.0
2 Barbara F 13 65.3 98.0
3 Carol F 14 62.8 102.5
7 Janet F 15 62.5 112.5
11 Judy F 14 64.3 90.0
13 Mary F 15 66.5 112.0
查询出所有12岁以上的女生姓名、身高和体重:
In [66]: student[(student['Sex']=='F') & (student['Age']>12)][['Name','Height','Weight']]
Out[66]:
Name Height Weight
1 Alice 56.5 84.0
2 Barbara 65.3 98.0
3 Carol 62.8 102.5
7 Janet 62.5 112.5
11 Judy 64.3 90.0
13 Mary 66.5 112.0
上面的查询逻辑其实非常的简单,需要注意的是,如果是多个条件的查询,必须在&(且)或者|(或)的两端条件用括号括起来。
四、统计分析
pandas模块为我们提供了非常多的描述性统计分析的指标函数,如总和、均值、最小值、最大值等,我们来具体看看这些函数:
首先随机生成三组数据
In [67]: np.random.seed(1234)
In [68]: d1 = pd.Series(2*np.random.normal(size = 100)+3)
In [69]: d2 = np.random.f(2,4,size = 100)
In [70]: d3 = np.random.randint(1,100,size = 100)
In [71]: d1.count() #非空元素计算
Out[71]: 100
In [72]: d1.min() #最小值
Out[72]: -4.1270333212494705
In [73]: d1.max() #最大值
Out[73]: 7.7819210309260658
In [74]: d1.idxmin() #最小值的位置,类似于R中的which.min函数
Out[74]: 81
In [75]: d1.idxmax() #最大值的位置,类似于R中的which.max函数
Out[75]: 39
In [76]: d1.quantile(0.1) #10%分位数
Out[76]: 0.68701846440699277
In [77]: d1.sum() #求和
Out[77]: 307.0224566250874
In [78]: d1.mean() #均值
Out[78]: 3.070224566250874
In [79]: d1.median() #中位数
Out[79]: 3.204555266776845
In [80]: d1.mode() #众数
Out[80]: Series([], dtype: float64)
In [81]: d1.var() #方差
Out[81]: 4.005609378535085
In [82]: d1.std() #标准差
Out[82]: 2.0014018533355777
In [83]: d1.mad() #平均绝对偏差
Out[83]: 1.5112880411556109
In [84]: d1.skew() #偏度
Out[84]: -0.64947807604842933
In [85]: d1.kurt() #峰度
Out[85]: 1.2201094052398012
In [86]: d1.describe() #一次性输出多个描述性统计指标
Out[86]:
count 100.000000
mean 3.070225
std 2.001402
min -4.127033
25% 2.040101
50% 3.204555
75% 4.434788
max 7.781921
dtype: float64
必须注意的是,describe方法只能针对序列或数据框,一维数组是没有这个方法的。
这里自定义一个函数,将这些统计描述指标全部汇总到一起:
In [87]: def stats(x):
...: return pd.Series([x.count(),x.min(),x.idxmin(),
...: x.quantile(.25),x.median(),
...: x.quantile(.75),x.mean(),
...: x.max(),x.idxmax(),
...: x.mad(),x.var(),
...: x.std(),x.skew(),x.kurt()],
...: index = ['Count','Min','Whicn_Min',
...: 'Q1','Median','Q3','Mean',
...: 'Max','Which_Max','Mad',
...: 'Var','Std','Skew','Kurt'])
In [88]: stats(d1)
Out[88]:
Count 100.000000
Min -4.127033
Whicn_Min 81.000000
Q1 2.040101
Median 3.204555
Q3 4.434788
Mean 3.070225
Max 7.781921
Which_Max 39.000000
Mad 1.511288
Var 4.005609
Std 2.001402
Skew -0.649478
Kurt 1.220109
dtype: float64
在实际的工作中,我们可能需要处理的是一系列的数值型数据框,如何将这个函数应用到数据框中的每一列呢?可以使用apply函数,这个非常类似于R中的apply的应用方法。
将之前创建的d1,d2,d3数据构建数据框:
In [89]: df = pd.DataFrame(np.array([d1,d2,d3]).T,columns=['x1','x2','x3'])
In [90]: df.head()
Out[90]:
x1 x2 x3
0 3.942870 1.369531 55.0
1 0.618049 0.943264 68.0
2 5.865414 0.590663 73.0
3 2.374696 0.206548 59.0
4 1.558823 0.223204 60.0
In [91]: df.apply(stats)
Out[91]:
x1 x2 x3
Count 100.000000 100.000000 100.000000
Min -4.127033 0.014330 3.000000
Whicn_Min 81.000000 72.000000 76.000000
Q1 2.040101 0.249580 25.000000
Median 3.204555 1.000613 54.500000
Q3 4.434788 2.101581 73.000000
Mean 3.070225 2.028608 51.490000
Max 7.781921 18.791565 98.000000
Which_Max 39.000000 53.000000 96.000000
Mad 1.511288 1.922669 24.010800
Var 4.005609 10.206447 780.090808
Std 2.001402 3.194753 27.930106
Skew -0.649478 3.326246 -0.118917
Kurt 1.220109 12.636286 -1.211579
非常完美,就这样很简单的创建了数值型数据的统计性描述。如果是离散型数据呢?就不能用这个统计口径了,我们需要统计离散变量的观测数、唯一值个数、众数水平及个数。你只需要使用describe方法就可以实现这样的统计了。
In [92]: student['Sex'].describe()
Out[92]:
count 19
unique 2
top M
freq 10
Name: Sex, dtype: object
除以上的简单描述性统计之外,还提供了连续变量的相关系数(corr)和协方差矩阵(cov)的求解,这个跟R语言是一致的用法。
In [93]: df.corr()
Out[93]:
x1 x2 x3
x1 1.000000 0.136085 0.037185
x2 0.136085 1.000000 -0.005688
x3 0.037185 -0.005688 1.000000
关于相关系数的计算可以调用pearson方法或kendell方法或spearman方法,默认使用pearson方法。
In [94]: df.corr('spearman')
Out[94]:
x1 x2 x3
x1 1.00000 0.178950 0.006590
x2 0.17895 1.000000 -0.033874
x3 0.00659 -0.033874 1.000000
如果只想关注某一个变量与其余变量的相关系数的话,可以使用corrwith,如下方只关心x1与其余变量的相关系数:
In [95]: df.corrwith(df['x1'])
Out[95]:
x1 1.000000
x2 0.136085
x3 0.037185
dtype: float64
数值型数据的协方差矩阵:
In [96]: df.cov()
Out[96]:
x1 x2 x3
x1 4.005609 0.870124 2.078596
x2 0.870124 10.206447 -0.507512
x3 2.078596 -0.507512 780.090808
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由于正文部分不能超过20000字符,接下来的部分将在《Python数据分析之pandas学习(二)》中继续讲解。
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