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教你如何简单快速绘制heatmap图
heatmap图怎么做?
作为万能的R有无数种方法做出heatmap图:
R包pheatmap:作为最受欢迎的热图绘制程序包之一,其作图美观细致,然而需要用到代码,对新手而言可能困难。
此外自然少不了ggplot2:其以美观著称,功能繁多,对于热图更有专门的heatmap()系列函数。
甚至Excel也可以制作热图,但其绘制略显复杂。
那有没有一种方法可以简单快速绘制heatmap图呢?
在这里,本葱想向大家推荐一款heatmap小软件——HEMI,非常适合生信小白使用。本葱相当喜欢并使用了很长一段时间,希望其能向大家提供一些帮助。
具体操作步骤如下:
操作界面
输入文件
支持.xls .csv .txt等格式;
HEMI内提供了一些例子便于我们操作练习(点击L区【DEMO】);
HEMI可以修改字体、设置颜色Bar、简单的数据标准化、添加聚类树等;
下载地址
支持多种系统:Windows、Linux、Mac
用户手册(中文):
用户手册(英文):
视频教程
最后,百闻不如一见
以下是一段3分40秒的视频教程,让我们一起来学习一下吧!
https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=u1316id1zal&width=500&height=375&auto=0
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本期编辑:李小圆
本期校稿:小超人 小丸子