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教你如何简单快速绘制heatmap图

2017-04-20 参天大葱 微生物生态

heatmap图怎么做? 

作为万能的R有无数种方法做出heatmap图:

R包pheatmap:作为最受欢迎的热图绘制程序包之一,其作图美观细致,然而需要用到代码,对新手而言可能困难。

此外自然少不了ggplot2:其以美观著称,功能繁多,对于热图更有专门的heatmap()系列函数。

甚至Excel也可以制作热图,但其绘制略显复杂。


那有没有一种方法可以简单快速绘制heatmap图呢?


 

在这里,本葱想向大家推荐一款heatmap小软件——HEMI,非常适合生信小白使用。本葱相当喜欢并使用了很长一段时间,希望其能向大家提供一些帮助。


   


具体操作步骤如下:


操作界面



输入文件

支持.xls  .csv  .txt等格式;

HEMI内提供了一些例子便于我们操作练习(点击L区【DEMO】);

HEMI可以修改字体、设置颜色Bar、简单的数据标准化、添加聚类树等;


下载地址

支持多种系统:Windows、Linux、Mac

用户手册(中文)

用户手册(英文)



视频教程


最后,百闻不如一见

以下是一段3分40秒的视频教程,让我们一起来学习一下吧!


https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=u1316id1zal&width=500&height=375&auto=0




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本期编辑:李小圆

 

本期校稿小超人 小丸子


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