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临床案例 | 宏基因组测序协助诊断多杀巴斯德菌脓胸1例

小菌 唯菌论
2024-11-08

摘要

多杀巴斯德菌脓胸少见,容易被漏诊。1例81岁患者因“咳嗽、咳痰、发热3 d”入株洲市中心医院/中南大学湘雅医学院附属株洲医院呼吸与危重症医学科一区,诊断为“社区获得性肺炎”,经抗感染治疗后仍发热,胸X射线摄影检查提示胸腔积液,行胸腔闭式引流,引流出红褐色液体,将胸腔积液行华大基因PMseq病原微生物高通量基因检测,检测出多杀巴斯德菌。多杀巴斯德菌对生长条件要求比较严格,是一种难以培养的细菌,而宏基因组测序技术(mNGS)的应用有助于快速诊断病原体。


1

病史


患者,男,81 岁,退休工人。

2019年2月被猫咬伤手臂。

2019年7月6日,出现咳嗽、咳痰,无发热、胸痛、咯血、盗汗等,肺部CT示右上肺大片状影,使用哌拉西林他唑巴坦进行治疗。

2019年10月12日,又出现咳嗽、咳痰,无发热、胸痛、咯血、气促等,肺部CT示右肺门片状影,使用莫西沙星 0.4 g qd进行治疗。

2019年11月7日受凉后出现咳嗽、咳痰、发热,咳嗽为阵发性、无高调金属音,痰为黄色黏痰、量少、不易咳出,伴有发热、畏寒、寒战,体温最高达39.2 ℃,无咯血、胸痛、胸闷、气促、腹痛、腹胀、头晕、头痛、肌肉酸痛、咽痛及皮疹等症状,以肺炎于 2019 年 11 月10日收住株洲市中心医院呼吸与危重症医学科。


起病以来,精神、食欲、睡眠一般,大小便正常,体重无明显变化。

个人史:吸烟20余年,每日1包,1992年戒烟。

婚育史、家族史:无特殊。

过敏史:有青霉素过敏史。


2

2019年11月10日


体格检查:

T 38.8℃、P 101次/分、R 23次/分、BP 150/70mmHg、SPO2 97%。

急性面容,神志清楚,巩膜无黄染,全身浅表淋巴结未触及肿大。右肺呼吸音低,上肺可闻及少量湿性啰音,左肺呼吸音稍低,未闻及明星干湿啰音。心腹(-),双下肢无浮肿。

初步诊断为社区获得性肺炎(CAP)。


感染指标


尿常规:尿潜血弱阳性,尿葡萄糖3+。

大便常规:正常。

肝肾功能:ALB 31.5 g/L,肌酐112 μmol/L,尿素氮9.32 mmol/L。

凝血功能:PT 17.50↑Sec,APTT 47.90↑Sec,FIB 5.69↑g/L,D-二聚体 3.2↑ug/ml。

心肌酶:CK 237.2↑IU/L,CK-MB 23.6IU/L,Mb 201.5↑IU/L,肌钙蛋白I正常。

血培养、痰培养、痰抗酸染色均阴性

心电图:窦性心律,左室面高电压,T波异常,可考虑为侧壁心肌缺血。


给予患者莫西沙星(0.4 g,每日1次)抗感染治疗。


3

2019年11月12-17日


11月12日患者体温正常。

11月13日再次出现发热,最高体温39.2 ℃,改用美罗培南(0.5 g,每6 h 1次)抗感染治疗。

11月15日胸X射线摄影示右肺感染并右侧胸腔积液



11月17日仍有发热,加利奈唑胺(0.6 g,每12 h 1次)联合抗感染治疗。


4

2019年11月19-21日


11月19日肺部CT示右侧肺门区斑块状影,双侧胸腔积液,右侧为包裹性积液,采用B超定位穿刺抽液20 mL送检。



胸水生化:腺苷脱氢酶106.8 U/L,总蛋白36.2↓g/L,白蛋白17.4↓g/L,球蛋白18.8↓g/L,白/球比例0.93↓,葡萄糖0.21↓mmol/L,总胆固醇0.70↓mmol/L,甘油三酯0.06↓mmol/L,乳酸脱氢酶5321.0↑IU/L。


胸水常规:颜色红褐色,透明度混浊,比重1.023,白细胞计数3208.00个/uL,红细胞计数156.00个/uL,其它WBC分类:单个核5%,多核95%,李凡它试验阳性(++)。


胸水革兰染色镜检未找到细菌。

胸水抗酸染色阴性。

胸水培养阴性。


11月20日行右侧胸腔闭式引流术。


11月21日患者的体温恢复正常。


5

2019年11月23日


胸腔积液送深圳华大基因股份有限公司进行PMseq病原微生物高通量基因检测,11月23日回报结果,检测到1259条reads的多杀巴斯德菌,覆盖度为2.7%(72 861/2 699 012)。



该患者被诊断为多杀巴斯德菌脓胸,予以停用其他抗感染药物、单用莫西沙星(0.4 g,每日1次)抗感染治疗,辅以对症支持治疗后,患者体温恢复正常,血常规、C反应蛋白等感染指标基本恢复正常,于11月30日出院


6

预后


患者出院后继续口服莫西沙星 (0.4 g,每日1次)抗感染治疗。于12月28日门诊复查肺部CT,结果示:右侧肺门斑块状影较前吸收、好转,右侧胸腔积液较前减少,伴右侧气胸,左侧胸腔积液基本吸收。


7

讨论


多杀巴斯德菌是一种小的革兰氏阴性球杆菌,能引起动物的原发和机会感染,人类感染较少见,主要是通过与动物接触(尤其是猫、狗等动物的抓、咬伤)所致。多杀巴斯德菌对生长条件要求比较严格,是一种难以培养的细菌,一般需要培养基营养成分丰富才能生长良好,且前期经验性使用广谱抗生素会降低细菌培养的阳性率,病原体诊断困难。本例患者痰、胸腔积液及血等细菌培养均为阴性。而宏基因组测序技术(mNGS)的应用可协助快速诊断多杀巴斯德菌。mNGS具有检出率高、耗时短、敏感性高的优点,能够检测到临床罕见、培养困难以及既往未知的病原体。mNGS也有其局限性,如缺乏公认的判读标准、测序结果与治疗关系不明确、不能检测耐药基因等。


多杀巴斯德菌的治疗可选用青霉素、三代头孢菌素、复方磺胺甲噁唑片、左氧氟沙星及四环素。本例患者对青霉素过敏,在明确多杀巴斯德菌脓胸的诊断后予以莫西沙星治疗有效。由于多杀巴斯德菌脓胸患者的临床症状与体征无特异性,漏诊率较高,因此,详尽的病史(猫接触史)、新的诊断方法(mNGS)对多杀巴斯德菌的诊断起关键作用。尽早针对病原体用药,可提高治疗效率,改善患者的预后。


参考文献:

[1]刘斌, 黄彭, 刘双柏,等. 二代测序协助诊断多杀巴斯德菌脓胸1例[J]. 中南大学学报:医学版, 2021, 46(8):5.



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