全方位立体解读——华大智造最新高通量测序系统【纯干货】
耀世来袭
今天我在这边给大家隆重的介绍我们新的两款测序仪——MGISEQ-200和MGISEQ-2000,前者是台式测序仪更加灵活方便,后者是更加高通量的测序仪。
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传承创新
具体这两款仪器有什么性能?
MGISEQ-200支持4种读长,也继承了BGISEQ-50测序仪上非常广泛运用的环境,包括高海拔的区域;在每次运行的通量上对比BGISEQ-50有很大的提升,能达到15~60G/run,读长能够到达PE100,而且能在两天之内拿到我们的数据结果。如果我们做一个简单的测算,我们在平均一天之内可以完成6到24个肿瘤样本的检测,能完成48个病原样本的检测,这样的通量对绝大部分的临床实验室非常适合。
MGISEQ-2000同样继承了BGISEQ—500的高规格的芯片,集成了加载系统,使操作更加简单方便,在数据产出上面实现了每个600G/run的产出,一次可以拿到6个全基因组数据,而且同样能够在48小时之内拿到PE100的数据结果,这无论对科研还是临床都是相当有吸引力的,最后其通量如果在满负荷运行的话我们在一年可以完成一千个全基因组的测序,这对一般的科研机构或者临床检验机构都是非常合适的选择。
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怦然芯动
华大智造现已经完全实现了芯片的自主研发、生产和制造,这两款测序仪匹配了不同的芯片,在读长上面我刚刚介绍有4种不同的读长,包括SE50、SE100、PE50和PE100。
在MGISEQ2000上目前有两种不同的芯片可选,包括小型的芯片和大型的芯片,同样支持四种基本读长,在未来会升级到SE300和PE150,具体这两个平台各有什么特点,为什么能比之前的型号有更进一步的提升。
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All in All
这是我们更简单的总结,首先在MGISEQ-200上面我们的分辨率进一步提升,有效区增加了80%,使得我们的数据产出更高,另外我们同样使用试剂的恒温储存,使我们的读长已经达到了PE100,能符合绝大部分的临床研究。
在MGISEQ-2000上面首先是一个双芯片的设计,但是对比之前的仪器的版本我们实现了加载时间和生化时间的Match,使得反应时间大大的缩减,第二进行了BAST的旁路技术的优化,进行了进一步的加速,对比之前的BGISEQ-500的仪器型号来说做了一个新的芯片的设计,就是使用了4个隔离lane的芯片,这个是支持我们未来更加灵活的研发,当然我们除开仪器之外还有一系列的标准化的操作,可以减少人员培训的成本。
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未来可期
在将来我们还会有更新的东西会放在我们新发布的这两款机型上,包括会实现更高的通量,新的算法,另外在临床上会进行新的探索,希望探索二代测序的极限,在算法上我们已经取得了新的突破,我们可以实现芯片密度的提升,在不改变仪器的设计和试剂的情况下,可以效率提高3倍以上。
现在SE350已经到了非常稳定的状态,错误率到达了非常低的水平。从实验室进入到真正的生产过程,未来会提供更长的读长。
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享你所想
无论做多少种仪器的研发,无论做了多少的努力,最后想达到的目的是一个,希望为中国和其他国家的科学家提供一台在实验室运行的仪器设备,希望大家所有新的想法、新的样本能在最短的时间最快的速度拿到你想实现的结果,这样的话不仅需要一台硬件的支持,希望提供更好的解决方案。
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大道智简
MG I SP-100自动化文库制备系统,可完成酶处理,PCR等文库构建步骤,使所有的操作流程能实现标准化、自动化,最大程度解放人力,为临床和科研工作者提供快捷的NGS文库制备解决方案。
现已测试了多种样本,包括血浆、FFPE等,能实现从样本到文库全流程的自动化。
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试不可挡
列出的18种文库制备试剂盒,支持不同的应用场景。其中也包括模块化试剂盒,比如我们的环化模块试剂盒,可以让大家根据自己的需求研发适用的科研和临床检测,关于测序我们已经提供了4种不同的读长,未来将会提供3种不同的测序试剂盒。
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转录组应用
转录组应用采用PE100测序的策略,在自己的实验室使用自己的测序仪,4天可以拿到结果。在数据量为10GB时,平均可以检测到两万个基因表达,发现新的转录本是科研突破的重点方向,研究人员可根据自己的项目做进一步设计。
单细胞RNA测序
单细胞RNA测序作为研究热点,我们现已实践了大量的单细胞RNA测序工作,将10X genomics构建的文库直接放到我们测序仪上,能够获得将近4200个单细胞的数据,平均产量达到62KB,无论是它的reads比对到不同的区域还是它的质量值都是相当之高的。通过这样的分析能快速拿到单细胞的表达和肿瘤的分析结果,为单细胞转录组研究提供更具扩展性的平台,帮助研究人员得到更好的科学发现。
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医路同行
在大家聚焦的医学临床领域,我们已实现了包括NIPT在内的更多临床检测,致力于以更低的价格,让人人都可以享用。癌症检测能在72小时内完成,每个样本可获得两个百万reads,这样的检测为肿瘤患者带来福音。我们现已进行了大量的性能测试,无论是准确度还是一致性都相当优秀,理论值和检测值能有99%的相关性。同时我们还在不断探索0.1%甚至更低的稀有突变。
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羊羊大观
我们正好找到一些羊的个体进行我们的宏基因组和宏转录组的检测,非常快的发现羊的样本里感染了羊口疮病毒,这个结果也快速的得到了qPCR的验证,说明我们的测序不仅应用在人的领域,在未来农林牧副渔也有很大的空间。
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大家的第一印象
华大的平台不管在操作的简便性、通量的灵活性、成本的控制以及稳定性上都是很出色的。MGISEQ2000我们看中的是稳定性更好,速度也很快,符合我们临床的需求。
赵美茹——北京吉因加科技
MGISEQ2000,刚才关于这台机器的优点已经说了很多次了,其实对我来说首先是更快,当你把样本送过去之后,每个小时都在想这个结果会不会出来,所以交付的时间是很重要的;更强,跑一次可以产生更多的基因组数据,这样对我们的交付有很大的好处;更稳,各种成功率的提升和质量提升也很明显,这是我们检测的全基因组数据里面,全是唾液,目标深度是30X深度,我们也尝试了不同的分析方法,试图去最准确的找出每个人的基因组信息,大家可以看到这些数据如果处理过,不管是同样的测序平台,可以看到所有的数据完全不输于现在的平台,甚至在一些数据上还有一些优势。
陈刚——WeGene创始人
MGISEQ2000传承了BGISEQ-500的优势,Q20和Q30的数据令人满意,我们也可以实现更多的应用,未来可在应对肿瘤等疾病方面将发挥重要作用。
David Smith
director of the technology assessment group
at the Mayo Clinic's Center
for Individualized Medicine
智胜未来,传奇继续。华大智造携两款最新的高通量测序仪隆重登场,获得了业内人士的高度赞赏。注重产品品质,精益求精,华大智造最新高通量测序系统,让不同需求的客户有更加灵活的选择。