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重磅发布 | 从基因到生命数据的演算—MegaBOLT&BGI CUP

2018年5月27日,深圳华大智造科技有限公司(以下简称“华大智造”)COO、深圳华大生命科学研究院执行副院长蒋慧在贵阳国际生态会议中心举办的生命大数据高峰论坛上,发布最新生信分析加速器MegaBOLT,并宣布首届“BGI CUP”基因变异检测算法大赛正式启动。




蒋慧表示,基因大数据的爆发增长也对传统生物信息分析的方法学带来了挑战。与传统GATK生物信息分析流程相比,以深度学习为代表的算法,正在基因组大数据分析的领域显示出诸多应用潜力。


MegaBOLT,测序与分析一站完成


华大智造自主研发的国产FPGA生信分析加速器-MegaBOLT,极大降低基因测序分析时间。MegaBOLT 采用CPU与FPGA异构方式,极大地提高了分析速度,100Gbp全基因组分析时间缩短至2小时,而6Gbp全外显子组分析只需10分钟,相较于传统加速方法,MegaBOLT 效率提升16至20倍。在提高效率的同时,计算成本也大幅降低。目前在大批量测试情况下, 100Gbp数据量(约35倍深度)全基因组分析成本最低达到¥19.9元,而6Gbp(约100倍深度)全外显子组分析每份最低只需¥1.99元。

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BGI CUP,征集“中国制造”的基因变异检测模型


“BGI CUP”基因变异检测算法大赛是由华大智造主办,面向全球征集超高精度的基因变异检测模型的年度系列赛事。本次比赛所用的训练集与测试集均是基于华大智造自主研发的MGISEQ系列测序仪所产出的全外显子组(WES)和全基因组(WGS)测序数据。此外,主办方将为参赛者部署GPU集群,并提供算法框架与技术指导。华大将为参赛者提交的算法模型在多节点做区块链存证,确保比赛公平公正。比赛将接受团队报名形式(3-6人),分为初赛与决赛两个阶段。具体报名信息请登陆大赛官网(http://bgicup.mgitech.cn)了解详情。


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