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微课回顾|CoolMPS到底有多酷(含FAQ)

上周我们迎来了第一期智造微课,华大智造产品经理雷莹全方位讲解了“CoolMPS到底有多酷”,观众反响热烈。本篇小编将为您梳理课程干货,重温CoolMPS。


CoolMPS为什么酷?


错配率作为高通量测序中测序数据质量的重要反映指标,反映着测序质量的优劣。通过与其他平台的对比,可以惊喜发现,华大智造MGISEQ-2000 CoolMPS测序数据的Mismatch rate随cycle数的变化,始终维持在一个较为平稳的低值



CoolMPS技术原理


CoolMPS测序过程,即首先引入未标记可逆终止核苷酸,随后使用荧光标记的能与3'-阻断的核苷酸特异结合的抗体进行碱基识别。切除3'-阻断基团后,结合的抗体从核苷酸上掉落下来,再生天然核苷酸,由此形成循环往复。



这种恢复到天然核苷酸的特性允许在新的测序循环中进一步延伸,而不受前一个循环的任何干扰。此外,无标签的RTs(可逆终止子)更容易制备,可以更有效的被聚合。另一个优点是与标准标记RTs的单个染料相比,抗体可以携带同一染料的多个分子,从而大大增加了测序信号



CoolMPS用户数据


以CoolMPS国内用户在WGS、WES和肿瘤Panel等应用的实测数据为例,基于DNBSEQ平台的CoolMPS测序结果显示平均Q30至少提升了5%,Mismatch rate降低了50%以上,能够检测到更多突变位点,而且对于超低频突变的标准品测试验证结果优秀(检出率高达92.3%)。









FAQ精选



Q1:抗体的结合效率怎么保证?

A1:我们对于抗体结合及切除,已做过多次验证,四个标记抗体结合后,在单一成像场中DNBs群体的荧光强度不显示任何抗体交叉结合,说明抗体具有良好的特异性。


Q2:请问相比Standard MPS, CoolMPS成本会有优势吗?

A2:长远来看,CoolMPS肯定是非常有成本优势的,比如说同样的试剂用量,CoolMPS产出的数据量更多,数据质量更高,其实就是节省了更多的试剂消耗。


Q3:目前基于DNBSEQ平台的所有文库类型,都可以采用CoolMPS测序吗?

A3:是的,该试剂套装适配华大智造DNBSEQ测序平台,适配现有的常规文库制备方法。


Q4:抗体和碱基的结合率有多高,传统荧光方法和碱基的结合率有多高?

A4:结合率可以从信号强度侧面反应,CoolMPS比传统荧光方法的结合率提高了3倍。


Q5:如何选购CoolMPS的试剂?

A5:目前,基于MGISEQ-2000平台已发布SE100/SE50/PE100三款试剂套装。可联系当地销售或扫描下方二维码联系我们,新品促销活动正在进行中。


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