如何让高通量自动化实验室跑起来 | 微课回顾
作为核酸检测实验室的自动化技术平台之一,华大智造MGISP系列产品具备自动化核酸提取功能和自动化测序文库制备功能,既能实现全流程的高度自动化,又能满足大规模筛查的高通量需求,目前已驰援全球80+国家和地区,助力疫情防控“新基建”。本期微课回顾通过一组数字:2000+、6、90%、70+,与您一同探寻让高通量自动化实验室跑起来的奥秘。
日提取量
MGISP-960是一款具备96通道的自动化移液工作站,具备强大的提取功能。常规核酸提取仪的提取通量一般在96样本/Run以下,而MGISP-960的最高提取通量在192样本/Run,日提取通量高达2000+样本。在抗疫一线,多台MGISP-960为全球新冠病毒检测贡献了日均10万+样本的理论提取通量,累计提取新冠样本量超过1000万。
自动化核酸提取
面对自动化核酸提取需求,无论是10例以下的样本量,还是100例以上的样本量,MGISP系列产品均能轻松应对,并提供6档选择。具体而言,灵活的MGISP-100配备8通道移液器,支持8/16/24/32样本的自动化提取;高通量的MGISP-960配备96通道移液器,支持96/192样本的自动化提取。而且,MGISP的操作非常简单,1名操作人员最多可同时操作3台设备完成自动化的核酸提取工作,有助于提取通量的快速提升。
自动化程度
面对高通量测序需求,MGISP系列自动化样本制备系统可自动化完成一系列实验操作,包括核酸提取、磁珠纯化、酶反应、PCR反应、片段筛选、杂交捕获以及DNB制备,自动化程度高达90%以上。以常规WGS建库为例,MGISP-100自动运行时间7h,而人工操作时间仅需0.5h(人工定量)。对比同样的实验条件下的常规人工操作至少需要用到10h,工作效率至少提升25%以上。
自动化测序文库制备
特别地,华大智造自动化样本制备系统MGISP系列产品整合了在核酸提取及文库制备过程中需要用到的各种仪器,化繁为简,一机整合。以MGISP-960为例,配备24个标准板位,不仅提供温控模块、PCR仪、震荡模块、自动升降的高效磁力架等6大功能模块,而且配备紫外消毒系统和正压的HEPA系统,安全可靠。
目前,基于MGISP系列的已开发应用脚本70+,可兼容第三方提取试剂(磁珠法)和第三方测序文库制备试剂(高通量测序法),支持定制化需求,具备开放式面向用户的脚本编辑功能以及向导式图形操作软件。
通过基于多平台的自动化实验,对DNA、RNA、WES及肿瘤组织等不同样本的高通量测序文库制备过程进行验证,结果表明:MGISP系列操作简单,性能稳定,值得信赖。
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要点回顾
FAQ精选
Q1: 提取和建库可以共用1台自动化设备么?
MGISP系列产品集提取功能和建库功能为一体,一般情况下提取和建库可以共用1台自动化设备;特别地,针对新冠病毒样本,提取和建库不建议共用1台自动化设备。这是因为,根据相关指南,利用活病毒或其感染细胞(或细胞提取物),不经灭活进行的生化分析、血清学检测、免疫学检测等操作视同病毒培养。而使用病毒培养物提取核酸,裂解剂或灭活剂的加入必须在与病毒培养等同级别的实验室和防护条件下进行,即生物安全三级实验室。可靠方法灭活后的病毒培养物,可在生物安全二级实验室操作。高通量测序文库制备等不含致病性病毒的其他操作,可在生物安全一级实验室进行。
Q2: MGISP系列产品如何避免交叉污染?
为避免交叉污染,MGISP系列产品在MGISP-100和MGISP-960这两款仪器中,整合了紫外灯和层流罩(正压的HEPA系统,过滤后的空气洁净度达ISO5级),可在实验前后对仪器内部自动进行消毒和过滤,仪器内部的实验环境接近于超净工作台。另外,该设备适配的移液器吸头为带滤芯的吸头,在保证经济适用的同时,可减少移液器内可能存在的气溶胶污染风险。
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