用户测评 | 基于华大智造DNBSEQ-T7测序平台,及智医学的单细胞测序数据展示
新经济下的初创企业面临诸多挑战,在这样的契机下,华大智造作为生命科技领域的上游企业,希望能够发挥平台优势,与IDG资本创新投资研究院、蓝色彩虹共同主办的2022华大智造&IDG资本生命健康加速营(以下简称“加速营”),一同为加速营入营项目提供资源、资本、技术等全要素孵化要素支持,为生命科学领域产业发展贡献力量。
在华大智造与加速营合作的六年里,双方互通资源、紧密协作,成功驱动许多生命科学领域的初创企业加速革新升级。同时,2022年加速营还升级提供创新工具包,包括测序试剂、单细胞建库、智慧实验室管理系统定制、实验室自动化设计及建设咨询服务等内容,入营项目有机会获得最高价值100万创新工具包,以助推研发成果产业转化。
2022年及智医学入选“华大智造&IDG资本生命健康加速营”,作为明星学员,获得由主办方提供的创新工具包。及智团队使用华大智造DNBSEQ-T7平台开展了几十例样品的单细胞测序,从下机数据质控分析结果看,华大智造测序平台:
◯ 测序质量优异,Q30均值达90%以上
◯ 测评结果稳定,一致性好
部分测试结果统计如下:
配合及智团队的单细胞捕获设备,经过华大智造 DNBSEQ-T7 平台测序后,最终得到每个样品的基因中位值与 Mean reads per cell 均有非常优异的表现:
数据分析显示,PBMC样品经过华大智造DNBSEQ-T7测序后,总计分为了CD8 Tcm、Mac、B、Neu等11个亚群,细胞类型注释及细胞类型占比等信息均与文献报道的PBMC细胞亚群组成非常吻合。表明华大智造DNBSEQ-T7平台在细胞类型检测的强大能力。
并在后续细胞间通讯分析中,发现了较多配受体互作信息:
以及CCL通路的互作网络,为NK细胞与CD8 Tcm的配受体分析提供了可信的数据支持。
及智(苏州)医学技术有限公司
成立于2021年11月24日,是苏州思萃免疫技术研究所有限公司(苏州市产业技术研究院免疫技术研究所)孵化成立的一家致力于单细胞临床转化方向的技术企业,公司重点围绕单细胞富集与检测平台、单细胞测序技术平台和基于AI算法的单细胞数据分析算法平台,建立了单细胞转录组、空间转录组、单细胞联合Bulk多组学等多种独特的分析流程和方法,尤其擅长各类免疫细胞与基质细胞的分类、功能解析、细胞互作、药物靶点筛选等分析项目。最终通过积累的上百种单细胞分析方法与百万级别单细胞数据库,为单细胞临床转化类项目提供专业研发服务。