回放来了| SciFinder助力生物材料研究
美国化学文摘(CAS)在6月9日举办了“SciFinder 论坛 | SciFinder助力生物材料研究”讲座。本次讲座程小燕博士聚焦SciFinder如何支持生物材料研究,包括基础结构检索、材料的制备、应用领域开发现状分析,并以案例展示生物材料在聚合物科学、生物相容性等技术层面的具体研究信息。程小燕博士和CAS市场经理余敏女士还就观众关心的检索问题,如嘧啶并各种环检索、多肽或者蛋白质水凝胶的生物应用、新化合物的确认、合成路线检索等方面的内容做了精彩解答。
回放链接
讲座受到听众的欢迎,针对很多观众提出的回放请求,现为您奉上本次讲座的回放链接和问答环节。错过直播的小伙伴可以注册收看(听过直播的小伙伴也可重复收看哦),满是干货,值得收藏!
将下方链接复制到浏览器即可收看:
https://casevents.webex.com/casevents/lsr.php?RCID=fcdacbc6a7ed424f9b87158b0bbcc311
(或点击文末的“阅读原文”,即可收看。)
观众问答
Q:
如何搜索嘧啶并各种环的所有结构?
A:
首先绘制嘧啶结构,进行物质亚结构检索并保存为结果1;然后使用环锁定工具将嘧啶环锁定,再次进行亚结构检索并保存为结果2;最后通过Combine功能从结果1中排除结果2中的结果,即可获得嘧啶的并环结构。
如果嘧啶的并环有一定的限定范围,比如环系大小、环上原子类型、键型特定等,那么可以使用结构编辑器中的重复结构单元键、自定义R基团、虚线键等来绘制并环的通式结构,并进行亚结构检索即可获得。
Q:
已知嵌段共聚物结构,可以查询相关的合成路线吗?
A:
可以。首先进行聚合物物质检索,然后在物质结果集页面点击Get Reaction,并选择 此聚合物在反应中的角色,即可获得此聚合物的合成或者改性等反应路线。嵌段共聚物的获取方式有以下两种:
如果重复结构单元和端基都已经明确,可以通过分子式检索获取;
如果只明确重复结构单元,则可以通过结构编辑器输入重复的结构单元,选择亚结构检索,并且在Advanced Search中选择物质类型为聚合物,即可得到符合要求的嵌段聚合物。
Q:
检索多肽或者蛋白质水凝胶的生物应用,您能详细讲一下吗?
A:
对于生物分子的检索,比如多肽或者蛋白,可以通过Substance Identifier输入具体的物质名称或者代码(CAS登记号、俗名、商品名、酶学代码等);
对于短肽,可以通过结构进行检索;
如果物质的名称和结构信息都不明确,则可以使用文献的research topic主题词来检索,比如protein hydrogel。然后通过Analyze: Section Titles查看应用领域,或者通过Categorize: Biotechnology查看生物应用。
Q:
怎么知道自己设计的一个物质是不是可能存在,以及合成路线的检索?
A:
如果设计的物质是可以绘制的一个结构,那么直接在结构编辑器中绘制好结构,并进行Substance检索,根据Exact Search的结果判断是否有一样的结构;根据Substructure Search的结果判断是否具有此结构的衍生物;最后通过Markush检索,查看其是否被包含在已公开专利通式结构中。
如果检索结果中有存在的物质结果,则可以根据物质结果获取反应,最终即可获得合成路线。
Q:
由化学式检索到的反应,是否可以保存检索过程?因为重复相近检索时,所用到的化学式,每次都需要重新绘制。
A:
可以保存检索过程。点击反应结果集页面右上角的Save,则可将检索结果保存。然后打开主页面Saved Searches中的Saved Answer Sets即可查看到每条记录的检索过程。
如果是要保存绘制的化学式,则可以在结构面板中绘制好结构式之后,点击页眉上方的Export,将结构保存为.cxf或.mol格式的文件,存在电脑中;下次再进行检索时可以在结构面板中,通过页眉上方的Import工具将保存的结构文件导入即可。
Q:
我平常多用PubMed,能否介绍SciFinder中收录的生物信息?
A:
SciFinder中收录了大量的生物信息,在其文献数据库CAplus中,生物信息占比高达约35%。同时SciFinder中还整合了Medline数据库及Genbank中收录的生物序列(包括蛋白和核酸)。
SciFinder论坛
美国化学文摘社(CAS)将举办“SciFinder 论坛”系列,旨在将SciFinder 与高校科研实际相结合,更好地发挥SciFinder在高校科研中的作用。从高校师生使用SciFinder的实际问题出发,围绕科研流程,由CAS 培训师主讲,同时也将邀请SciFinder用户作为嘉宾进行经验分享。
SciFinder简介
SciFinder由美国化学会(American Chemical Society, ACS)旗下的美国化学文摘社(Chemical Abstracts Service, CAS)出品,是一个研发信息应用平台,提供全球最大、最权威的化学及相关学科文献、物质和反应信息。SciFinder涵盖了化学及相关学科如生物、医药、工程、农学、物理等多学科、跨学科的科技信息;收录的文献类型包括期刊、专利、会议论文、图书、技术报告、评论、网络预印本和其他网络资源等。
SciFinder可以帮助科研人员高效、精准地定位所需信息,极大地提升研究工作的效率。
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