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CAS SciFinderⁿ常见问题解答 | 生物序列检索

CAS ACS美国化学会 2022-11-15

CAS SciFindern

常见问题解答


CAS SciFindern是美国化学文摘社(CAS)出品的新一代的科学研究工具,是化学及相关学科智能研究平台,提供全球全面、可靠的化学及相关学科研究信息和分析工具。


我们会定期更新CAS SciFindern常见问题的解答,希望能帮助您掌握更多检索技巧、提高科研效率。如果您在使用CAS SciFindern时遇到了检索难题,欢迎邮件咨询:china@acs-i.org

本期为您解答生物序列检索的常见问题:


Q:CAS Biosequences中是否包含专利全文中表格里的序列、专利序列表中的序列?

A:CAS Biosequences包含来自期刊、专利和NCBI中的序列。其中,专利中的序列涵盖权利要求书、说明书、全文表格,以及专利申请人向专利授权机构提交的序列表中的序列等。


Q:同时用3个CDR检索抗体序列,获得的包含2个或3个CDR的序列结果是在同一条链上吗?

A:是的。


Q:如何获取跟抗体轻链和重链中6个CDR序列均相关的专利?

A:分四步完成,以下为详细的操作过程:

第一步:输入抗体其中一条链中的3个CDR, 获取3个CDR均被包含的序列结果集,再点击序列结果集页面左上角References按钮,获取报道这些序列的专利文献,点击文献结果集右上角Save按钮,保存结果集并命名,如:此例命名为“CDR to combine 1”。

第二步:输入抗体另一条链中3个CDR, 同第一步的操作,获取3个CDR均被包含的序列结果集,再点击序列结果集页面左上角的References按钮,获取报道这些序列的专利文献。

第三步:在第二步的文献结果集页面,点击右上角combine按钮,选择合并方式,如:此例选取交集Intersect;在弹出对话框中选勾选想要合并取交集的已保存文献结果集,如:此例选 “CDR to combine 1”。

第四步:点击View Results按钮,查看跟抗体轻链和重链中6个CDR序列均相关的专利文献结果。


Q:Bioscape中可以展示指定目标公司的序列吗?

A:示例序列:

EALSFVSLVDGYFRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGM

1) 在CAS Biosequences中获得的序列结果集页面,点击页面左侧Create Bioscape Analysis。

2) 在Bioscape可视化分析页面,点击左侧放大镜图标,在All中输入指定公司名,如“Compugen”,点击绿色search按钮,获得该页面上的指定公司相关结果。

3) 点击柱体代表的序列,会在右侧弹出框中呈现该序列、序列长度、相关专利数量,点击代表专利数量的蓝色数字,可获取该选中序列(绿框框柱的柱体)的相关专利合集。

4) 在专利结果集页面左侧Organization筛选选项下,可见该专利结果集专利权人包含指定的“Compugen”。


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