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新品发布| 外泌体small RNA测序服务

小编艾皮 表观生物 2019-06-30

项目简介


miRNA是一类17 ~ 24 nt的非编码RNA,能介导基因的转录后沉默,与细胞增殖分化、迁移、疾病发生和疾病进展都有关系。2014年,Goldie等人发现miRNA在外泌体中所占的比例高于外泌体来源细胞,表明miRNA特异地富集于外泌体中。自此,外泌体miRNA的作用受到越来越多的关注:循环的囊泡如外泌体被认为是与通过细胞接触或可溶分子转运的信号传导一样重要的第三种细胞间通讯途径。

表观生物采用来源于美国Exosome Diagnostics, Inc.公司的独家技术——QIAGEN exoRNeasy Serum/Plasma Maxi Kit 提取外泌体RNA,能够在20分钟内快速纯化得到细胞外囊泡,并获得更为全面的RNA分子,广泛兼容来自细胞培养基上清、血清血浆及其他体液的外泌体样本,为后续RNA功能研究奠定基础。

在建库技术方面,表观生物对外泌体small RNA测序服务也进行了革新,采用QIAseq NGS pannal专有的数字NGS技术,基于QIAseq miRNA Library Kit的建库策略无需切胶分离小RNA(Gel-free),能够实现对外泌体miRNA等稀少样本的无偏向准确定量。结合最新的高通量测序技术和生物信息分析方案(样本≥10个,即送miRNA调控网络分析),将为您提供最为全面的外泌体miRNA测序服务!


技术优势:

1. 源于Exosome Diagonstics临床级外泌体提取技术,快速高效

2. 革新的QIAseq数字NGS建库技术,完美实现少量样本准确定量

3. 生物信息分析内容丰富,包含miRNA调控网络分析,无需额外费用!




与竞争试剂盒生成的文库相比(之前必须进行繁琐的凝胶切除),表观生物Gel-free 外泌体small RNA建库技术产生的miRNA文库更加稳定,没有接头二聚体和污染RNA。 




外泌体miRNA有望作为生物标志物,因此表观生物外泌体small RNA测序对建库技术经过了精心优化,可增强体液(如血清)来源的外泌体样本等超低起始量的miRNA的丰度。


项目流程



测序方案


测序平台:Illumina HiSeq X10/Hiseq 4000 

测序数据:10M reads

适用物种人、大小鼠 

样本类型血清/血浆、培养基上清、尿液、唾液等 

样本分组建议:10 VS 10 


分析内容





分析项目

1

 原始数据过滤

2

 Clean reads 长度分布统计

4

 基因组比对

5

 已知 miRNA 注释

6

 已知 piRNA 注释

8

 重复序列比对

9

 新 miRNA 预测

10

 Small RNA 分类注释统计

11

 miRNA 丰度差异分析

12

 miRNA 家族分析

13

 miRNA 保守性分析

14

 差异表达 miRNA 聚类分析

15

 miRNA靶基因预测

16

 靶基因富集分析(GO)

17

 靶基因富集分析(KEGG)

18

 miRNA与mRNA调控网络构建




喜大普奔!

即日起至3月22日

签订外泌体long RNA或small RNA测序服务合同

可获得第三届外泌体与疾病研讨会免费参会名额一个!

点击此处查看会议信息


活动细则: 在活动时间内(即日起至2月25日)签订合同,且外泌体测序服务合同金额5万或以上,并在会议开始前(3月22日前)完成合同首付款转账,即可获得第三届外泌体与疾病研讨会参会名额一个!



欢迎拨打 400-775-0875 或公众号留言咨询!


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