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【景观生态学】宝儿边织毛衣边碎碎念式教程—关于Linkage Mapper的一个教程:(1)数据准备

宝儿 数读城事 2022-07-17
宝儿的碎碎念:啊!写之前的碎碎念,大概也就一年前答应菌菌要写这篇推文。然而!懂得都懂。哈哈哈哈哈哈哈我内心的想法大概要100年后才会想起写吧,居然最近良心发现,推文日程提前99年,这大概就是因为爱吧!哈哈哈哈哈。菌菌注:爱情来得太快我都有点害怕了~~~~

01数据准备

首先当然是准备数据阶段,嗯!作为网络构建,首先需要一个源地和一个阻力面,剩下的就交给Lingkage Mapper叭叭叭!


◐ 源地筛选
源地筛选的方法有很多种,不管是目前多数论文中的MSPA、生态系统服务功能重要性、生境质量、生态重要区(自然保护区、水源涵养区等等)等方法进行源地识别,但宝儿姐还是认为不管选取什么方法,一旦是做科学研究一定要先搞清楚研究内容和研究目的,这很重要,尤其是刚开始做科学问题研究的小朋友们(虽然我也菜菜的,但还是把自己的血泪史经验分享给大家,哭的很大声),具体的方法请自行阅读相关文献哈,我就不一一介绍了,在这里我就直接用生态重要区数据(图1-1)进行演示咯(我不管!)~
(此外,这里的源地也不仅仅只能是生态源地哦,也可以是其他的,具体问题具体分析,旅游、交通规划等等都可适用,举一反三的事情就交给优秀的你们了!)

图1-1|某市生态重要区(非官方)

将重庆市自然保护区、风景名胜区、世界自然遗产地、湿地公园、森林公园、风景名胜区和地质公园合并为一个图层,妈耶,有255个斑块!通过进一步的合并merge操作,并删除面积小于1km2(根据具体研究来定义,毕竟斑块太碎小会影响整体的结果呈现,以及源地数量很多的话会极大的!降低运行速度)的源地斑块后就只剩下81个(什么?!!!还有81个!!!哭了,我擅自删除了一些斑块,仅仅是为了运行速度,大家写论文和做研究可千万不要学我啊!!!教程式演示就不要在意这些细节了,即使我现在的内心很纠结),然后在属性表中给32个源地斑块增加一列ID,并进行1-32编号,方便后期源地与廊道关系的一系列分析,然后将将将!!!我们的源地图层就做好啦!

图1-2|生态源地空间分布

◐ 阻力面构建

生态阻力值(源地向外扩张的阻力)主要受土地覆被类型和地形坡度影响[1],建设用地、道路、大的水域等都是大多数生物,特别是陆生物种迁徙的重要障碍,所以选取土地覆被类型、距道路的距离、坡度、距水域的距离、NDVI植被指数等为主要阻力因子。在这里值得注意的是,首先我的阻力因子的选取是依据阻碍陆生物种的迁徙的可能存在的因子,如果研究对象、研究目的不同阻力因子的选取依据是不同的,这也是我遇到很多朋友在阻力因子选取方面遇到的疑惑和迷茫,在网络构建中阻力面很重要!!!一定要科学!!!一定要慎重!!!严谨啊!!!不然审稿老师的质疑会让你哭的!!!此外,关于阻力值的确定也是哦,一定要有科学依据!依据!依据!!!(重要的事情说三遍),我这里的阻力值是根据实际情况及参考了一些参考文献后进行的赋值,大家看看就好,可不要参考去写论文哦,宝儿姐概不负责啊!

表1-1|阻力因子与阻力值

以上阻力因子根据阻力值赋值在GIS中重分类(reclassify),分别赋值1-5,具体操作我就不赘述啦,菌其他的推文中都有很详细的介绍了啦~~~~呐~~~重分类好了!(图1-3)

图1-3|阻力因子与阻力值

然后就是构建阻力面啦,最简单的方法当然是1+1等权叠加咯(从科学的角度来讲这么做并不怎么科学)~~But在很多论文中会采用各种方法确定各阻力因子的权重,如大家熟悉的AHP、熵权法、经验赋值法还有balabala我也说不上来的一些方法,然后加权叠加得到最终的综合阻力面,当然,在这里我就用最简单的等权叠加叭!!!酱~~~~叠加好惹,长这样(图1-4)。

图1-4|综合阻力面


◐ 福利时间

分享个计算地形起伏度最佳窗口工具箱,嘻嘻~~~高高给我的!呐~~~经过九九八一难,计算出了重庆市地形起伏度计算窗口也就是邻域大小为18*18。

图1-5|计算地形起伏度最佳窗口工具箱

链接:

https://pan.baidu.com/s/1wBwPobrwyjYWQ4PpLyk7SQ

提取码:ons8


作者|宝儿

排版|数读菌

校阅|数读菌


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