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金库银库不如国家基因库!亮相央视《创新中国》的深圳国家基因库,藏着怎样的生命信息大数据?

2018-02-13 深圳梦

近日首播收官的央视系列纪录片《创新中国》的《生命》分集中讲述了试图容纳整个世界的物种、让人惊叹的深圳国家基因库。


在事关人类生存的问题上,生命科学带来的突破可能比其他任何领域都更加令人惊喜。死亡之症不断被攻克,绝境中重获生机。生存质量将空前提高,返老还童似乎不再是天方夜谭。在深圳大鹏新区,就有一栋酝酿着勃勃野心的大楼——这个占地不到12万平方米的建筑,是全球最大的综合性基因库——深圳国家基因库。在这里,无数生命以数字形态获得了永生。


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目前深圳国家基因库生物资源样本库已具备2500万份可溯源性生物样本的存储能力,已存储高质量、可溯源样本量2000多万份;生物信息数据库实现500PB的数据访问支持能力,存储容量60PB,累计保存了18PB数据,并建成全球最大的基因组高性能计算中心及生命数据开发共享平台,其构建的40多个数据库,总访问量达1.18亿;生物活体库以保护和保存世界约三十万种植物、百万种动物、近千万种微生物活体资源为目标,目前四个国内生物活体库已挂牌和开展项目;数字化平台数据产出能力8Pb/年,已建成高通量、国产化、低成本的公共服务平台;合成与编辑平台科研水平实现国际“并跑”,部分技术占据领先地位,参与基因组合成、胚胎编辑评估等国际大项目,Nature、Science双突破。此外,深圳国家基因库已接待分别来自于国内外政府机构、科研院所、大中小学校、媒体、医疗领域机构、金融领域机构等万余人来访参观;并举办了多场科普、公益活动,受到社会各界的一致好评。


广东省委常委、深圳市委书记王伟中莅临华大调研

来源:华大基因  2018-02-12 


2018年2月11日,广东省委常委、深圳市委书记王伟中莅临华大基因集团调研,并代表市委市政府送来新春祝福。陪同调研的深圳市领导有市委常委、秘书长郭永航,市政府职能部门领导聂新平、刘胜、梁永生;陪同调研的盐田区领导有区委书记杜玲。


王伟中书记一行重点参观了测序仪相关实验室,详细了解了华大在生命科学领域的发展情况,以及国产测序仪在医学、农业、司法等领域的应用情况。



华大基因集团董事长汪建向王伟中书记汇报了华大现阶段的整体情况、科研成果、与国内外机构的重要合作项目进展,以及华大在防控出生缺陷、肿瘤和传染感染性疾病方面所做的努力和取得的成绩。



王伟中书记指出,华大过去十年在深圳的巨大发展以及测序仪的国产化,得益于华大的创新精神,也得益于深圳这片沃土的创新氛围。他表示,市委市政府一定会支持华大的发展,也期待华大能继续紧跟深圳的城市发展节奏,打造世界顶级的生命科学领域产学研深度融合的开放平台,助力深圳成为竞争力和影响力卓著的全球创新引领型城市。



深圳国家基因库理事会第三次会议举行,努力建设全球持续领先的生物资源平台

来源:深圳特区报  2018-02-10  


2月9日下午,深圳国家基因库理事会第三次会议在深圳举行,总结国家基因库建设成绩与经验,研究部署下一步工作重点。国家发展改革委副主任林念修出席会议并讲话,深圳市市长陈如桂主持会议。


林念修在讲话中充分肯定深圳国家基因库建设生物样本资源建设水平世界领先、基因信息数据库建设水平世界领先,基因库产学研支撑水平世界领先,经济效益和社会效益初步显现。林念修强调,新时代开启新征程,新时代赋予新要求,新时代要有新作为,国家基因库建设发展面临重大机遇,要紧紧抓住我国生物经济加快发展的黄金时期,把握生命科学纵深发展、生物技术广泛应用和融合创新的新趋势,以基因技术快速发展为契机,面向国内重大需求,“高标准”加快推进基因库二期建设、“高质量”推进基因库运营管理、“高站位”谋划基因库国际合作,推动基因库成为全球持续领先的生物资源平台。


陈如桂表示,深圳将立足国家战略需求,服从国家总体规划,大力支持国家基因库建设运营,为率先建设社会主义现代先行区提供有力支撑。


会议听取了深圳国家基因库2017年度工作总结及2018年度工作计划、开放共享工作总结、二期建设方案、成立“一带一路”生命科技促进联盟等情况汇报,审议并原则通过了《深圳国家基因库联络员工作制度》。会上,各副理事长、理事单位相关负责人就基因库下一步重点工作提出了意见建议。


市政府秘书长李廷忠参加会议。




深圳国家基因库简介


2011年10月深圳国家基因库建设方案由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部以及卫生部四部委批复,并由深圳华大基因研究院组建及运营。深圳国家基因库独创集生物资源样本库、生物信息数据库和生物资源信息网络为一体,通过建立高水平的生物资源样本库、高效的生物信息数据处理、存储与管理系统以及覆盖广泛的联盟网络,有效保护、合理开发和利用我国生物资源及基因数据资源,充分调动、发挥及整合各地区、各单位的资源和技术优势,积极开展广泛交流与合作,搭建信息资源研究开发的基础性支撑平台,提高我国生命科学研究水平和国际影响力,促进我国生物产业发展。

规划到2015年,国家基因库将建成国际一流水平的高效基因信息数据库、可溯源性生物样本资源库,完成3000万份可溯源性生物样本保存,实现对基因信息数据总量达1EB的访问支持。同时围绕生物医药、生物农业和海洋生物等生物产业重点领域搭建基因信息资源挖掘的基础性支撑平台,全面提升我国生物产业创新能力。


我国首个国家基因库启动运行,加快打造我国基因资源及生命信息大数据战略高地

来源:深圳国家基因库 2016-09-22 


  2016年9月22日,深圳国家基因库开业仪式隆重举行。国家基因库理事会成员单位、科学委员会专家学者、全球知名合作伙伴代表等出席了仪式。




  今天的新闻联播对我国首个国家基因库的开幕进行报道。


  深圳市市委常委、市政府党组成员田夫,广东省发改委副主任吴道闻,广东省卫生和计划生育委员会副巡视员温伟群,中国军事医学科学院、科技部副部长毛军文,深圳市市政府副秘书长刘胜,华大基因理事长杨焕明,华大基因董事长汪建,深圳国家基因库主任、华大农业集团董事长兼总裁梅永红,华大基因研究院院长、深圳国家基因库执行主任徐讯等出席了本次活动。田夫、吴道闻、刘胜、汪建、梅永红、徐讯等共同为深圳国家基因库揭幕。


  汪建回顾了国家基因库建设的漫长而艰辛的历程,感谢从中央到地方,各级领导、各级政府的大力支持和帮助。


  梅永红深知在当今时代拥有基因资源对于中国的意义,他为有机缘投身这样一个伟大的事业感到荣幸。梅永红号召各方力量建立更紧密的联系,共同谱写生命经济的华章。



  田夫代表深圳市委市政府对国家基因库的开业表示祝贺。他表示,近年来,深圳市委市政府在促进扶持、努力规划、人才引进和培养方面大力培育生物和生命健康产业,孕育了国家基因库的诞生。经过近5年的建设,深圳国家基因库的主体建筑已经基本竣工并投入使用,可访问数据量和数据存储能力均达到中国第一和全球前列。深圳国家基因库正释放出越来越强大的能量,成为代表国家参与全球产业竞争和对外开放合作的重要载体。大家将更好地依托深圳国家基因库搭建的平台,汇聚全球科研机构的创新能力,按照供给侧结构性改革的要求,加快构建基因组学在精准健康、海洋农业、生物应用等方面的科研研发和科技成果转化,将深圳打造成为基因科技和产业发展的高地。


  2011年1月,国家发展改革委员会批复同意深圳依托华大基因研究院组建深圳国家基因库,同年10月,深圳国家基因库建设方案获得国家发展改革委员会、财政部、工业和信息化部、卫生和计划生育委员会四部委批复,正式投建。一期主体工程已经建成,占地面积4.75万平方米。深圳国家基因库已经初步建成了“三库两平台”的功能和结构,包括生物资源样本库、生物信息数据库、生物活体库以及数字化平台、合成及编辑平台,实现对生物资源和信息的“存、读、懂、写、用”。


  随着国家基因库的启动,其公共平台的公共服务也正式对外开放。此次宣布启动的国家基因库数字化平台,装备了150台BGISEQ-500型测序仪和1台RevolocityTM测序仪,目前总数据产量将达到每年5Pb,相当于一年5万人全基因组或是1000万产前筛查的数据产出规模,升级后的系统预计年产数据可达10Pb,将成为全球最大的数据产出平台。同时,宣布启动的国家基因库开放数据中心,已经建成了20Pb数据的可访问能力,并规划在二期完成500Pb的可访问能力,能力上超越国际三大基因数据中心,填补了我国长期缺少国家级基因数据中心的空白。


  徐讯还宣布启动基因组合成与编辑平台及基因组合成2020计划,将在2020年完成10万个噬菌体的合成,完成全球第一个动物基因组、全球第一个植物基因组以及人类21号染色体的合成。同时,国家基因库还将启动两大项目——数字化瑞丽植物园和母婴大人群队列研究。


  开业仪式上,深圳国家基因库与斯瓦尔巴全球种子库(The Svalbard Seed Vault)、德国癌症研究中心(DKFZ)、德国环境研究中心、海德堡大学、中国科学院深圳先进技术研究院、华为、阿里云等国内外知名机构举行了签约仪式,将在种子数字化、儿童健康表观基因组、万种噬菌体基因组等方面展开合作。


  此次开业仪式是深圳国家基因库发展的一个里程碑,国家基因库将继续以服务国家战略需求作为出发点,融合近年来生命科学学科的国际前沿动向,进一步完善“三库两平台”的业务结构,扮演好公共服务平台的角色,形成从资源到科研、产业的全贯穿全覆盖的模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的联动。


国家基因库图片

  深圳国家基因库设立以理事会为核心的管理结构,为全国服务,起到公共服务作用,积极探索行之有效的运行管理机制和可持续发展的服务模式;体现国家意志,加快打造我国基因资源及生命信息大数据战略高地。


  小编为你送上更多国家基因库图片,想了解更多国库故事,请继续关注后续的探秘专题哦~


国家基因库展厅


三分钟了解,中国首个国家基因库的43800小时

来源:深圳国家基因库  2016-09-22



历经五年的沉淀和风雨,国家基因库于2016年9月22日,在社会各界、行业伙伴以及全体工作人员的见证下迎来开业仪式。目前,国家基因库初步建成“三库两平台”的业务结构和功能,搭建起基因资源挖掘的基础性支撑及公共服务平台,以具备对海量生物资源的存、读、懂、写、用能力为基础,构建起检测、管理、认证、基础应用体系,促进基因组学在精准健康、精准农业、海洋开发、微生物应用等方面的前沿探索与产业转化。


2011至2016年间


我们迎来了十二五、反法西斯战争胜利90周年

我们经历了广州亚运会、伦敦奥运会、里约奥运会

我们见证了生命时代日新月异的改变

而国家基因库

也在这样的5年间发生了翻天覆地的变化

一起回顾

这5年间的难忘时刻




国家基因库的诞生


    2011年1月    国家发改委批复同意深圳依托华大基因研究院组建深圳国家基因库

    2011年10月  深圳国家基因库建设方案获得国家发展改革委员会、财政部、工业和信息化部、卫生和计划生育委员会四部委批复,相关项目列入国家战略性新兴产业发展专项资金计划。至此,抱着造福人类、推动生物产业发展心愿的国家基因库,开启了未知的发展旅程。






国家基因库的发展


  5年,1825天,43800小时,看似很长,却是国家基因库全体工作人员一分一秒垒积起来的。在这充满回忆的5年间,国家基因库在生物大样本及资源存储、数据库建设、全球联盟网络等方面都取得了显著成绩,多项指标处于国际领先水平;在这5年间,许多有着同样憧憬的伙伴与我们建立了联盟关系,例如美国自然历史博物馆等、BioStorage Technologies等等;在这5年间,我们获得了行业的普遍认可,收获了各类奖项......时间终究证明了努力的价值。


1样本库、数据库以及平台建设


    2012年5月   国家基因库已同10余家国内外知名科研院所达成战略合作伙伴关系。

    2014年3月   国家基因库已完成21项关于生物样本收集、处理和保存方面的专利申请工作,其中9项获得中华人民共和国知识产权局的授权。

    2014年4月   国家基因库-基因信息数据库宣布将面向全国提供生物数据免费存储服务。

    2014年8月   E-BioBank信息共享平台二期搭建完成。

    2015年3月  国家基因库万种鸟类数据库一期正式发布。

    2015年7月  国家基因库筹建了崭新的谷子数据库。


  截至到目前,国家基因库已存储多种生物资源样本1000万份已经建成了20Pb数据的可访问能力。由国家基因库构建的生物样本和大数据存储、管理、认证、基础应用体系,正有序与国际权威数据库开展数据交换与共享,形成全球联盟体系,支撑引领生物大健康产业和生物经济快速发展。


2科研成果


    2014年2月   国家基因库成员在《自然·遗传》上发表了破译迄今为止首个比目鱼——半滑舌鳎全基因组序列图谱的成果。

    2014年5月   国家基因库成员在《自然·通讯》上发表首个白蚁基因组被成功破译的成果。

    2014年9月   国家基因库在《自然·通讯》上发表成果文章《切叶蚁等级特异的RNA编辑组》。

    2014年11月 国家基因库领衔的千种昆虫转录组项目大成果发表在《科学》杂志上。

    2014年12月   国家基因库领衔的国际团队在《自然·通讯》上发表世界首个两栖鱼类基因组测序成果;国家基因库领衔的国际鸟类基因组研究联盟于在Science等其他杂志上以专刊形式集中公布了28篇首期研究成果。

    2015年3月   国家基因库带领的研究团队在美国科学院院刊(PNAS)杂志上发表了首个现代蛙类基因组——高山倭蛙基因组的破译成果。

    2015年5月   国家基因库张国捷带领的生物多样性课题组与国际团队合作完成了10种蜂类的比较基因组学研究。

    2015年7月  国家基因库生物多样性组成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法。

    2016年7月 国家基因库生物多样性组和国际团队共同在《自然·通讯》发表真菌蚂蚁最新研究成果,揭示了蚂蚁与真菌共同适应性的分子基础。

    2016年8月 国家基因库生物多样性组在GigaScience杂志上发表了一款名为RES-Scanner的RNA编辑位点检测软件。


  截至到目前,国家基因库已开展国际/国家重点科研项目20余项合作项目共发表论文140余篇,其中在NatureScienceCell等重点杂志上发表论文30余篇。


3合作项目


    2012年9月   国家基因库同美国自然历史博物馆签订战略合作框架协议。

    2012年12  国家基因库-生物多样性联盟启动;60多家国内机构与9家国际机构加入国家基因库联盟。

    2013年1月    国家基因库加入 Global Genome Biodiversity Network(GGBN)。

    2013年10月  国家基因库与BioStorage Technologies签署战略联盟协议。

    2014年10月  北京重大疾病临床数据和样本资源库与国家基因库共同打造世界级样本库联盟。

    2015年6月   国家基因库主导的国际鸟类基因组联盟正式宣布启动“鸟全纲基因组项目”,这是国际上首次对同一大类群的所有现生物种进行完整的基因组研究。

    2015年8月   国家基因库深圳野生动物救护基地在深圳市野生动物救护中心正式挂牌。


  截至到目前,国家基因库已与国际生物和环境样本库协会(ISBER)、全球生物多样性联盟(GGBN)、挪威世界末日种子库中国科学院海洋研究所、北京重大疾病临床数据和样本资源库、深圳超算中心等100多家国内外科研机构、行业组织建立了战略合作关系,在人类健康、生物多样性、生物演化机制等方面开展了合作研究。


4行业规范编写


    2014年1月  华大基因研究院(国家基因库)和深圳市标准技术研究院联合编写深圳市标准化指导性技术文件《动物种质资源库建设与管理规范》、《人类样本库建设与管理规范》及《生物基因信息数据库建设与管理规范》,该三项规范于2014年2月1日正式实施。

    2014年6月  3项国际标准提案通过PWI投票,并正式纳入ISO/TC276工作中。

    2014年9月   国标委批准基因库提交的国家标准《核酸数据库格式规范》立项。

    2015年2月  由深圳市市场监督管理局组织制订、华大基因研究院(国家基因库)编写深圳市标准化指导性技术文件《人类间充质干细胞库建设与管理规范》和《植物种质资源离体保存库建设规范》于2015年3月1日正式实施。

    2015年6月   国家基因库成为全国生物样本标准化技术委员会的委员单位。


  截至目前,国家基因库已初步建立基因信息数据和生物样本采集、存储、管理相关标准和技术规范,发布深圳市地方标准5项,申请国际、国内标准10项,申请国内外专利46项,出版基因资源专著8本。



5重要会议

    2014年10月   国标委批复由国家基因库专家申请的ISO/TC 276的第三届年会(2015)在华大基因举办。

    2014年11月  由国家基因库主办的中国人类遗传资源共享体系研讨会在深圳召开。

    2015年4月   由华大基因研究院和国家基因库承办的ISO/TC 276年会在深圳成功召开。

    2014年9月   国标委批准基因库提交的国家标准《核酸数据库格式规范》立项。

    2015年10月   青岛国际基因科技高峰会议在青岛西海岸新区举行。

    2015年11月  国家基因库理事会在深圳成立并举行第一次会议。

    2015年12月   由国家基因库与北京重大疾病临床数据和样本资源库联合举办的“临床数据与样本资源库建设”专业培训在北京顺利举行。

    2016年6月  国家基因库执行主任徐讯参与了在德国柏林举行的全球基因组生物多样性联盟(GGBN)2016年年会,并做了题为“Biodiversity Biobanking in China National GeneBank: from single biobank to international networks”的主题报告,向全球与会成员介绍了国家基因库各方面的建设和发展情况,并代表国家基因库正式成为其执行委员会成员。


6基因库基地建设

    2012年3月   国家基因库建设项目举行开工仪式。

    2012年10月 国家基因库基地取得中华人民共和国建筑工程施工许可证。

    2013年6月   国家基因库基地建设正式动工。

    2014年12月  基因库建设工程结构封顶。


7更多......


    2013年9月   国家基因库张国捷博士荣获第十四届“李汝祺动物遗传奖”。

    2014年8月   国家基因库生物多样性组成员获得中国青少年科技创新奖。

    2015年3月  《新闻联播》在“平台思维开拓创新驱动新路径”主题中播出了国家基因库平台的介绍和相关采访。

    2016年6月  国家基因库的大鹏基地迎来广东省省委副书记、深圳市委书记马兴瑞,广东省副省长袁宝成,深圳市市长许勤一行。



国家基因库的现在


  2016年9月,基因库建筑主体完工后投入使用,并于9月22日在国家基因库大鹏基地隆重举行开业仪式。


  此次开业仪式邀请了理事会成员单位及全球知名重要合作伙伴出席,华大基因研究院院长、深圳国家基因库执行主任徐讯在仪式上宣布启动DNA存储、超大基因组合成计划、瑞丽珍稀植物园数字化项目、母婴健康队列计划等重大建设规划项目,并发布了深圳国家基因库信息库统一检索系统,该系统目前可对癌症数据集成与整合分析平台、人体微生物数据库、罕见病数据库、免疫数据库、人类遗传变异数据库等十余个基因库自建生物信息数据库进行检索,总检索条目数超过1亿。对于生物行业、国家基因库及其合作伙伴、全体工作人员来说,这次开业仪式不仅难忘,更是具有里程碑意义的重要事件。





  说到这里,国家基因库的5年回顾告一段落,相信未来将带给大家更多的惊喜,收获更优的成绩,陪伴民众迈入生命时代,实现个人健康长寿,地球可持续发展。




国家基因库正式启动运营一周年


2017年9月22日,国家基因库正式启动运营一周年庆祝活动在深圳举行。


华大董事长汪建,华大首席运营官杨爽,深圳华大基因股份有限公司执行总裁尹烨,国家基因库执行主任、深圳华大生命科学研究院院长徐讯,华大执行副总裁、国际区域发展中心主任余德健,华大执行副总裁、首席财务官孙英俊,华大副总裁、国内区域发展中心主任路军及各部门同事出席了当天的庆祝活动。


国家基因库周年大事记展览同步展出。一张张熟悉或陌生的面孔,一次次新的突破,让大家重新回顾了一年来国家基因库一步步走来的历程,此情此景,让大家心潮澎湃。


徐讯首先回顾了这一年来基因库的重大里程碑事件。他强调,这一年国家基因库不仅在建设方面有重要的进展,在其组建与运营上也有很多突出成就。2016年9月22日,大家共同见证了国家基因库的开业仪式,之后第一次在国家基因库举办了国际性、综合性的学术会议——ICG-11;今年3月,国家基因库也迎来了第一次重大的科研突破,人工合成酵母基因组项目取得又一突破性进展——七篇最新研究成果组成专刊发表于Science杂志,这不仅是国家基因库的重大事件,也是中国生物界的重大事件,标志着人造生命新篇章的开启……


国家基因库“三库两平台”、合作与联盟员工代表分别分享过去一年的故事及取得的成绩。


从水稻基因组的梯田到如今的国家基因库,这是一个横跨15年的故事,汪建希望大家将历史发展、现在和未来结合起来,“痴心不改,善始善终”。


杨爽感谢国家对基因库的信任与支持,并代表整个华大的执行团队向过去一年国家基因库的同仁、华大同事以及一年为来国家基因库的发展作出贡献的各界友人表示感谢,同时也对未来发展提出了要求与期望,激励大家不断前进。


一年来,国家基因库发展成为全世界的基因科学和生物产业的圣地,尹烨强调,国家基因库承担了一个国家的使命、国家的职责,金山银山也不如绿水青山,金库国库不如国家基因库。在一个PM2.5只有个位数的地方,大家看到如此多珍奇异草,国家基因库可以带给万千百姓安健、长寿。他希望大家身体好、学习好、工作好,并祝贺国家基因库顺利运行一周年,希望它能运行一万年!


余德健回顾国家基因库筹建之前到建设落成,以及目前启动运营一周年期间发生的故事。经过大家的努力,也让国外友人看到了国家基因库在这一年作出的所有成绩,“一带一路一国一库”,相信国际合作也会取得长足的发展。


活动现场,大家共同为国家基因库特制的一周年蛋糕点燃了蜡烛,在歌声中相互祝福、举杯同庆,纪念这个意义非凡的一年,迎接更加辉煌的下一年!活动现场,周年展览、歌舞表演、明信片祝福、互动抢答相映成趣,大家欢聚一堂,签名合影留念。


据了解,一年来,国家基因库已接待分别来自于国内外政府机构、科研院所、大中小学校、媒体、医疗领域机构、金融领域机构等万余人来访参观;国家基因库也举办了多场科普、公益活动,受到社会各界的一致好评;样本库已建成2000万可溯源性生物样本的存储能力,已存储超过1500万份样本;信息库作为生命大数据计算及开放共享平台,已储存数据量达18PB,数据库总点击量达1.18亿;全国已共建四个活库(云南、青海、深圳);合成与编辑平台累计发表文章 13篇(CNNS系列7篇),专利 13个(PCT5项),软著8个;数字化平台高质、高产、高效,150台BGISEQ-500测序仪满饱和、稳定运行,已累计产出达Pb级的测序数据;国家基因库开展广泛的联盟合作,新加入或建立了全球联盟9个。


国家基因库将继续以服务国家战略需求作为出发点,融合近年来生命科学学科的国际前沿动向,进一步完善“三库两平台”的业务结构,切实体现公共服务平台的功能 ,形成从资源到科研、产业的全贯穿模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的联动。




附:国家基因库一周年大事记(部分):


2016年9月22日

 国家基因库正式启动运营。

2016年11月

 ICG-11在国家基因库召开。

2016年12月24日

国家基因库云南活体库与国家基因库云南分库瑞丽分中心揭牌。

2017年1月18日

国家基因库理事会第二次会议在深圳召开。


2017年3月10日

人工合成酵母基因组项目取得又一突破性进展——七篇最新研究成果组成专刊发表于Science杂志。

2017年7月18日

国家基因库深圳市仙湖植物园活体库揭牌仪式顺利举行。

2017年8月16日

国家基因库——青海高原活体库揭牌仪式在海西州都兰县隆重举行,现已奔赴青海省都兰县进行种质资源采集和科学考察。

2017年9月6日

国家海洋基因库启动。



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